RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464454.1

CLK1-208, Transcript of CDC like kinase 1, human

TSL 2

Gene CLK1, Length 484 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLK1-208	ENST00000464454	HTR2A	P28223	471 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	KIF5B	P33176	963 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	CYLC1	P35663	651 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	IST1	P53990	364 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	KRTAP10-3	P60369	221 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	SLC10A1	Q14973	349 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	CAMK4	Q16566	473 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	TMEM41B	Q5BJD5	291 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	DCST2	Q5T1A1	773 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	RIPPLY2	Q5TAB7	128 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	LGSN	Q5TDP6	509 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	MEDAG	Q5VYS4	303 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	RNLS	Q5VYX0	342 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	BAIAP2L2	Q6UXY1	529 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	SH2D6	Q7Z4S9	175 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	VN1R17P	Q8TDU5	208 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	UPRT	Q96BW1	309 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	TESK2	Q96S53	571 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	FEM1A	Q9BSK4	669 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF416	Q9BWM5	594 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	HCAR1	Q9BXC0	346 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	GPN2	Q9H9Y4	310 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	EXOSC3	Q9NQT5	275 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	AGPAT5	Q9NUQ2	364 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	PRR34	Q9NV39	138 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	ELOVL2	Q9NXB9	296 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	GALP	Q9UBC7	116 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	SH3BGRL2	Q9UJC5	107 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	GMPPB	Q9Y5P6	360 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	AGRN	O00468	2067 aa		3.15	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454		A0A1B0GWJ7	208 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CLK1-208	ENST00000464454	ZSCAN5C	A6NGD5	496 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
CLK1-208	ENST00000464454	SDHD	O14521	159 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CLK1-208	ENST00000464454	MAPK13	O15264	365 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CLK1-208	ENST00000464454	JAK2	O60674	1132 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF354A	O60765	605 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
CLK1-208	ENST00000464454	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
CLK1-208	ENST00000464454	JCHAIN	P01591	159 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CLK1-208	ENST00000464454	ALPI	P09923	528 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CLK1-208	ENST00000464454	CDH5	P33151	784 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
CLK1-208	ENST00000464454	ACAA2	P42765	397 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
CLK1-208	ENST00000464454	OR1D4	P47884	311 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CLK1-208	ENST00000464454	FNTA	P49354	379 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CLK1-208	ENST00000464454	KLHL30	Q0D2K2	578 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CLK1-208	ENST00000464454	IL18R1	Q13478	541 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CLK1-208	ENST00000464454	RUNX3	Q13761	415 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CLK1-208	ENST00000464454	OLFML2A	Q68BL7	652 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CLK1-208	ENST00000464454	SCYL2	Q6P3W7	929 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CLK1-208	ENST00000464454	CBLN3	Q6UW01	205 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CLK1-208	ENST00000464454	LRRC70	Q7Z2Q7	622 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CLK1-208	ENST00000464454	PARG	Q86W56	976 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CLK1-208	ENST00000464454	GPD1L	Q8N335	351 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CLK1-208	ENST00000464454	FADS6	Q8N9I5	356 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CLK1-208	ENST00000464454	OR5AU1	Q8NGC0	362 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CLK1-208	ENST00000464454	RHOXF1	Q8NHV9	184 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CLK1-208	ENST00000464454	SYAP1	Q96A49	352 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
CLK1-208	ENST00000464454	TPPP3	Q9BW30	176 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CLK1-208	ENST00000464454	OPN3	Q9H1Y3	402 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
CLK1-208	ENST00000464454	RIBC2	Q9H4K1	309 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CLK1-208	ENST00000464454	DUSP12	Q9UNI6	340 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CLK1-208	ENST00000464454	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CLK1-208	ENST00000464454	USP6	P35125	1406 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CLK1-208	ENST00000464454	MET	P08581	1390 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CLK1-208	ENST00000464454	IGLV3-10	A0A075B6K4	115 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CLK1-208	ENST00000464454		A8MX80	341 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CLK1-208	ENST00000464454	MBD3	O95983	291 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CLK1-208	ENST00000464454	CSF2	P04141	144 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CLK1-208	ENST00000464454	CT45A10	P0DMU9	189 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CLK1-208	ENST00000464454	LAMP1	P11279	417 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CLK1-208	ENST00000464454	ANXA3	P12429	323 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CLK1-208	ENST00000464454	BCKDHA	P12694	445 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CLK1-208	ENST00000464454	KRT13	P13646	458 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CLK1-208	ENST00000464454	PGAM2	P15259	253 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CLK1-208	ENST00000464454	IDS	P22304	550 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CLK1-208	ENST00000464454	PSMA2	P25787	234 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CLK1-208	ENST00000464454	ACVR1B	P36896	505 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CLK1-208	ENST00000464454	MAGEA9	P43362	315 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CLK1-208	ENST00000464454	ALDH3B2	P48448	385 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CLK1-208	ENST00000464454	NUCB2	P80303	420 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CLK1-208	ENST00000464454	PLOD1	Q02809	727 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
CLK1-208	ENST00000464454	PAX2	Q02962	417 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CLK1-208	ENST00000464454	PUDP	Q08623	228 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CLK1-208	ENST00000464454	OVGP1	Q12889	678 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CLK1-208	ENST00000464454	CYP51A1	Q16850	503 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CLK1-208	ENST00000464454		Q1RN00	199 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CLK1-208	ENST00000464454	TIMM50	Q3ZCQ8	353 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CLK1-208	ENST00000464454	ASPHD2	Q6ICH7	369 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CLK1-208	ENST00000464454	STAC2	Q6ZMT1	411 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CLK1-208	ENST00000464454	GCNT7	Q6ZNI0	430 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CLK1-208	ENST00000464454	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CLK1-208	ENST00000464454		Q8N9G6	341 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
CLK1-208	ENST00000464454	OR10T2	Q8NGX3	314 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CLK1-208	ENST00000464454	ZPLD1	Q8TCW7	415 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CLK1-208	ENST00000464454	PPP1R16A	Q96I34	528 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CLK1-208	ENST00000464454	TSGA13	Q96PP4	275 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CLK1-208	ENST00000464454	SLC30A2	Q9BRI3	323 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CLK1-208	ENST00000464454	GSDMC	Q9BYG8	508 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CLK1-208	ENST00000464454	SLC25A51	Q9H1U9	297 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CLK1-208	ENST00000464454	DHX33	Q9H6R0	707 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91

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