RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459758.5

TTLL3-222, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 555 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-222	ENST00000459758	AASS	Q9UDR5	926 aa		10.75	□□□□□ -0.69
TTLL3-222	ENST00000459758	NUP210L	Q5VU65	1888 aa		10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-222	ENST00000459758	LILRA5	A6NI73	299 aa		10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-222	ENST00000459758	CPSF4L	A6NMK7	179 aa	Known RBP	10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF670-ZNF695	F2Z2N8	137 aa		10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-222	ENST00000459758		H0Y8X5	98 aa		10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-222	ENST00000459758	ARHGAP33	O14559	1287 aa		10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-222	ENST00000459758	DYRK3	O43781	588 aa		10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-222	ENST00000459758	AKAP8	O43823	692 aa	Known RBP	10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-222	ENST00000459758	CTSV	O60911	334 aa		10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-222	ENST00000459758	PRKRA	O75569	313 aa	Known RBP	10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-222	ENST00000459758	UPK1B	O75841	260 aa		10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-222	ENST00000459758	PTTG1	O95997	202 aa		10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-222	ENST00000459758	SRF	P11831	508 aa		10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-222	ENST00000459758	IDUA	P35475	653 aa		10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-222	ENST00000459758	OMP	P47874	163 aa		10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-222	ENST00000459758	AVPR1B	P47901	424 aa		10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-222	ENST00000459758	FASLG	P48023	281 aa		10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-222	ENST00000459758	BCAP31	P51572	246 aa		10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-222	ENST00000459758	PDX1	P52945	283 aa		10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-222	ENST00000459758	EEF1A1	P68104	462 aa	Known RBP	10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-222	ENST00000459758	EFNB1	P98172	346 aa		10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-222	ENST00000459758	BDH1	Q02338	343 aa		10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-222	ENST00000459758	ACSM1	Q08AH1	577 aa		10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-222	ENST00000459758	CDC20	Q12834	499 aa		10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-222	ENST00000459758	SMAD4	Q13485	552 aa	Known RBP	10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-222	ENST00000459758	GPR50	Q13585	617 aa		10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-222	ENST00000459758	RUNX2	Q13950	521 aa		10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-222	ENST00000459758	SERTAD2	Q14140	314 aa		10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-222	ENST00000459758	FAM53B	Q14153	422 aa		10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-222	ENST00000459758	OXA1L	Q15070	435 aa		10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-222	ENST00000459758	LEXM	Q3ZCV2	418 aa		10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-222	ENST00000459758	FHL5	Q5TD97	284 aa		10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-222	ENST00000459758	TMPRSS11A	Q6ZMR5	421 aa		10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-222	ENST00000459758	PLEKHG7	Q6ZR37	379 aa		10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-222	ENST00000459758	VRK2	Q86Y07	508 aa		10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-222	ENST00000459758	RBM45	Q8IUH3	476 aa	Known RBP	10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-222	ENST00000459758	FAM20C	Q8IXL6	584 aa		10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-222	ENST00000459758	TDH	Q8IZJ6	230 aa		10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-222	ENST00000459758	CA13	Q8N1Q1	262 aa		10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-222	ENST00000459758	MFSD4A	Q8N468	514 aa		10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-222	ENST00000459758	C19orf47	Q8N9M1	422 aa	Known RBP	10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-222	ENST00000459758	SLC16A11	Q8NCK7	471 aa		10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-222	ENST00000459758	ANKK1	Q8NFD2	765 aa		10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-222	ENST00000459758	OR13H1	Q8NG92	308 aa		10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-222	ENST00000459758	SETD6	Q8TBK2	473 aa		10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-222	ENST00000459758	BRIX1	Q8TDN6	353 aa	Known RBP	10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-222	ENST00000459758	SLC37A2	Q8TED4	501 aa		10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-222	ENST00000459758	HOXB13	Q92826	284 aa	Predicted RBP	10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-222	ENST00000459758	MACROD1	Q9BQ69	325 aa		10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-222	ENST00000459758	RHNO1	Q9BSD3	238 aa		10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-222	ENST00000459758	MED18	Q9BUE0	208 aa		10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-222	ENST00000459758	TRIM2	Q9C040	744 aa		10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-222	ENST00000459758	NDEL1	Q9GZM8	345 aa		10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF576	Q9H609	170 aa		10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-222	ENST00000459758	ZBTB20	Q9HC78	741 aa	Predicted RBP	10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-222	ENST00000459758	ST6GALNAC1	Q9NSC7	600 aa	Predicted RBP	10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-222	ENST00000459758	WSB2	Q9NYS7	404 aa	Predicted RBP	10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-222	ENST00000459758	DOLK	Q9UPQ8	538 aa		10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-222	ENST00000459758	LSM2	Q9Y333	95 aa	Known RBP	10.74	□□□□□ -0.69
TTLL3-222	ENST00000459758	TMX2-CTNND1	H3BSU7	103 aa		10.73	□□□□□ -0.69
TTLL3-222	ENST00000459758		J3QRK9	145 aa		10.73	□□□□□ -0.69
TTLL3-222	ENST00000459758	CYR61	O00622	381 aa		10.73	□□□□□ -0.69
TTLL3-222	ENST00000459758	P2RX6	O15547	441 aa		10.73	□□□□□ -0.69
TTLL3-222	ENST00000459758	PRAMEF2	O60811	474 aa		10.73	□□□□□ -0.69
TTLL3-222	ENST00000459758	SEMA7A	O75326	666 aa		10.73	□□□□□ -0.69
TTLL3-222	ENST00000459758	CS	O75390	466 aa	Known RBP	10.73	□□□□□ -0.69
TTLL3-222	ENST00000459758	NKX2-2	O95096	273 aa		10.73	□□□□□ -0.69
TTLL3-222	ENST00000459758	EML2	O95834	649 aa		10.73	□□□□□ -0.69
TTLL3-222	ENST00000459758	TP53	P04637	393 aa	Predicted RBP	10.73	□□□□□ -0.69
TTLL3-222	ENST00000459758	EIF2S1	P05198	315 aa	Known RBP	10.73	□□□□□ -0.69
TTLL3-222	ENST00000459758	IGHV4-34	P06331	123 aa		10.73	□□□□□ -0.69
TTLL3-222	ENST00000459758	ALPPL2	P10696	532 aa		10.73	□□□□□ -0.69
TTLL3-222	ENST00000459758	BMP4	P12644	408 aa		10.73	□□□□□ -0.69
TTLL3-222	ENST00000459758	CD53	P19397	219 aa		10.73	□□□□□ -0.69
TTLL3-222	ENST00000459758	PAICS	P22234	425 aa	Known RBP	10.73	□□□□□ -0.69
TTLL3-222	ENST00000459758	LTBR	P36941	435 aa		10.73	□□□□□ -0.69
TTLL3-222	ENST00000459758	RANBP1	P43487	201 aa		10.73	□□□□□ -0.69
TTLL3-222	ENST00000459758	LIMK1	P53667	647 aa		10.73	□□□□□ -0.69
TTLL3-222	ENST00000459758	CDH11	P55287	796 aa		10.73	□□□□□ -0.69
TTLL3-222	ENST00000459758	PSPH	P78330	225 aa		10.73	□□□□□ -0.69
TTLL3-222	ENST00000459758	SIM1	P81133	766 aa	Predicted RBP	10.73	□□□□□ -0.69
TTLL3-222	ENST00000459758	DLX2	Q07687	328 aa	Predicted RBP	10.73	□□□□□ -0.69
TTLL3-222	ENST00000459758	POU4F2	Q12837	409 aa		10.73	□□□□□ -0.69
TTLL3-222	ENST00000459758	ATP1A4	Q13733	1029 aa		10.73	□□□□□ -0.69
TTLL3-222	ENST00000459758	DUSP5	Q16690	384 aa		10.73	□□□□□ -0.69
TTLL3-222	ENST00000459758	PRICKLE4	Q2TBC4	344 aa		10.73	□□□□□ -0.69
TTLL3-222	ENST00000459758	PGGHG	Q32M88	737 aa		10.73	□□□□□ -0.69
TTLL3-222	ENST00000459758	C6orf132	Q5T0Z8	1188 aa		10.73	□□□□□ -0.69
TTLL3-222	ENST00000459758	FAM111B	Q6SJ93	734 aa		10.73	□□□□□ -0.69
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF836	Q6ZNA1	936 aa		10.73	□□□□□ -0.69
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF620	Q6ZNG0	422 aa		10.73	□□□□□ -0.69
TTLL3-222	ENST00000459758	GDF7	Q7Z4P5	450 aa		10.73	□□□□□ -0.69
TTLL3-222	ENST00000459758	BMP8A	Q7Z5Y6	402 aa		10.73	□□□□□ -0.69
TTLL3-222	ENST00000459758	VWA5B2	Q8N398	1253 aa		10.73	□□□□□ -0.69
TTLL3-222	ENST00000459758	KLHL36	Q8N4N3	616 aa		10.73	□□□□□ -0.69
TTLL3-222	ENST00000459758	POGLUT1	Q8NBL1	392 aa		10.73	□□□□□ -0.69
TTLL3-222	ENST00000459758	TSTD1	Q8NFU3	115 aa		10.73	□□□□□ -0.69
TTLL3-222	ENST00000459758	CADM4	Q8NFZ8	388 aa		10.73	□□□□□ -0.69
TTLL3-222	ENST00000459758	OR52I1	Q8NGK6	324 aa		10.73	□□□□□ -0.69

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