RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437078.6

RABGEF1-210, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene RABGEF1, Length 4,319 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-210ENST00000437078 TP53P04637 393 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 ADORA3P0DMS8 318 aa12.72□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 ITGAMP11215 1152 aa12.72□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF45Q02386 682 aa12.72□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 CD300CQ08708 224 aa12.72□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 IL18R1Q13478 541 aa12.72□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 NKAIN2Q5VXU1 208 aa12.72□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa12.72□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 TTLQ8NG68 377 aa12.72□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 GRPEL2Q8TAA5 225 aa12.72□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 PTCHD1Q96NR3 888 aa12.72□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF639Q9UID6 485 aa12.72□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 TSPAN11A1L157 253 aa12.72□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 OR7A10O76100 309 aa12.72□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 ALOX5P09917 674 aa12.72□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 UGT2B7P16662 529 aa12.72□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 AHRP35869 848 aa12.72□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 CDH11P55287 796 aa12.72□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 GAB4Q2WGN9 574 aa12.72□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 LRIT3Q3SXY7 679 aa12.72□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 PYDC2Q56P42 97 aa12.72□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 C1orf189Q5VU69 101 aa12.72□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 GARNL3Q5VVW2 1013 aa12.72□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 FAM3CQ92520 227 aa12.72□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 DIRAS2Q96HU8 199 aa12.72□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 SAMD8Q96LT4 415 aa12.72□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 GAL3ST1Q99999 423 aa12.72□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 ASPNQ9BXN1 380 aa12.72□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 OR8D2Q9GZM6 311 aa12.72□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 EPHX3Q9H6B9 360 aa12.72□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF226Q9NYT6 803 aa12.72□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 PEX12O00623 359 aa12.72□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 SLC2A10O95528 541 aa12.72□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 BMP4P12644 408 aa12.72□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 KEAP1Q14145 624 aa12.72□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 E2F2Q14209 437 aa12.72□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 UBE3DQ7Z6J8 389 aa12.72□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 TRIM69Q86WT6 500 aa12.72□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 HRASLS5Q96KN8 279 aa12.72□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa12.71□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 CD8B2A6NJW9 211 aa12.71□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 PRKYO43930 277 aa12.71□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 CLEC3AO75596 197 aa12.71□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 CD8BP10966 210 aa12.71□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 MMP11P24347 488 aa12.71□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 CSNK2BP67870 215 aa12.71□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 NDUFAF6Q330K2 333 aa12.71□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 ACSM5Q6NUN0 579 aa12.71□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 NIPAL1Q6NVV3 410 aa12.71□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 OR52L1Q8NGH7 329 aa12.71□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 NEURL3Q96EH8 262 aa12.71□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF354BQ96LW1 612 aa12.71□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa12.71□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 ANKHQ9HCJ1 492 aa12.71□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 FBXO34Q9NWN3 711 aa12.71□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 TMEM9Q9P0T7 183 aa12.71□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 CPNE7Q9UBL6 633 aa12.71□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 IFT52Q9Y366 437 aa12.71□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa12.71□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 CTSVO60911 334 aa12.71□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 ADAM23O75077 832 aa12.71□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 PCSK2P16519 638 aa12.71□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 SLC3A1Q07837 685 aa12.71□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa12.71□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 ARL9Q6T311 187 aa12.71□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 LAPTM4BQ86VI4 370 aa12.71□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 OR6K6Q8NGW6 343 aa12.71□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 TMEM255BQ8WV15 326 aa12.71□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 RNFT2Q96EX2 444 aa12.71□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 A0A1W2PPV9 198 aa12.71□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 P2RX6O15547 441 aa12.71□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 OSMP13725 252 aa12.71□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 G0S2P27469 103 aa12.71□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 IFNGR2P38484 337 aa12.71□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 XCR1P46094 333 aa12.71□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 ZMYND11Q15326 602 aa12.71□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 SPHARQ15513 63 aa12.71□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 PDZK1Q5T2W1 519 aa12.71□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 PLBD1Q6P4A8 553 aa12.71□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 SPATC1Q76KD6 591 aa12.71□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 OR7G2Q8NG99 324 aa12.71□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 KLHDC7BQ96G42 594 aa12.71□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 BEX2Q9BXY8 128 aa12.71□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 ENOPH1Q9UHY7 261 aa12.71□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 POLHQ9Y253 713 aa12.71□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 PADI2Q9Y2J8 665 aa12.71□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 TRAV27A0A087WT01 109 aa12.71□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 FFAR1O14842 300 aa12.71□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 CLEC2LP0C7M8 214 aa12.71□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 GCGRP47871 477 aa12.71□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.6 ms