RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435535.1

RPS3AP54-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 54, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP54, Length 734 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP54-201ENST00000435535 STMN1P16949 149 aa4.11□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 TFEBP19484 476 aa4.11□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 CERS1P27544 350 aa4.11□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 TACR3P29371 465 aa4.11□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 PPP2R1BP30154 601 aa4.11□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP4.11□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 RFC3P40938 356 aa4.11□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 TNFSF10P50591 281 aa4.11□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 PLA2G16P53816 162 aa4.11□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR4D2P58180 307 aa4.11□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 GPX6P59796 221 aa4.11□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 BTG2P78543 158 aa4.11□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 ID2Q02363 134 aa4.11□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP4.11□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 NSDHLQ15738 373 aa4.11□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa4.11□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 GARNL3Q5VVW2 1013 aa4.11□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 ARMC3Q5W041 872 aa4.11□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 DUPD1Q68J44 220 aa4.11□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP4.11□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 CLEC18BQ6UXF7 455 aa4.11□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 Q6ZS92 163 aa4.11□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 RAPH1Q70E73 1250 aa4.11□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 ABHD13Q7L211 337 aa4.11□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 NDUFAF7Q7L592 441 aa4.11□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 MDGA2Q7Z553 956 aa4.11□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 ANKRD37Q7Z713 158 aa4.11□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 GALNT7Q86SF2 657 aa4.11□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 FJX1Q86VR8 437 aa4.11□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 CRLF3Q8IUI8 442 aa4.11□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 RNF175Q8N4F7 328 aa4.11□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 TBC1D19Q8N5T2 526 aa4.11□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 MFSD9Q8NBP5 474 aa4.11□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 CLEC18CQ8NCF0 446 aa4.11□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa4.11□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 SSC4DQ8WTU2 575 aa4.11□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 KCTD4Q8WVF5 259 aa4.11□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 ATL1Q8WXF7 558 aa4.11□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 CDKL2Q92772 493 aa4.11□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 LRRC39Q96DD0 335 aa4.11□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 C5orf34Q96MH7 638 aa4.11□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 GPR22Q99680 433 aa4.11□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 AIF1LQ9BQI0 150 aa4.11□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 ERP44Q9BS26 406 aa4.11□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRIM2Q9C040 744 aa4.11□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 AICDAQ9GZX7 198 aa4.11□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 PCBD2Q9H0N5 130 aa4.11□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 RAB17Q9H0T7 212 aa4.11□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 ALG9Q9H6U8 611 aa4.11□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP4.11□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 KCNK13Q9HB14 408 aa4.11□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 OLAHQ9NV23 265 aa4.11□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM184CQ9NVA4 438 aa4.11□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 THAP1Q9NVV9 213 aa4.11□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 CD274Q9NZQ7 290 aa4.11□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 C5AR2Q9P296 337 aa4.11□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP4.11□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP4.11□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 OSGIN2Q9Y236 505 aa4.11□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 OARD1Q9Y530 152 aa4.11□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 FBN2P35556 2912 aa4.11□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 PCNX3Q9H6A9 2034 aa4.11□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa4.1□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR5H15A6NDH6 313 aa4.1□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM159BA6NKW6 160 aa4.1□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 GABRR3A8MPY1 467 aa4.1□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 H0YIG0 161 aa4.1□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 RTCAO00442 366 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 TXNDC9O14530 226 aa4.1□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC16A5O15375 505 aa4.1□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 TAPBPO15533 448 aa4.1□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 CHST10O43529 356 aa4.1□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZG16O60844 167 aa4.1□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 MYO1DO94832 1006 aa4.1□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 CLDN1O95832 211 aa4.1□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 SERPINA7P05543 415 aa4.1□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC35E2BP0CK96 405 aa4.1□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 GP1BBP13224 206 aa4.1□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 CD1DP15813 335 aa4.1□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 ALOX12P18054 663 aa4.1□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 GNAZP19086 355 aa4.1□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 CD22P20273 847 aa4.1□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 JAK1P23458 1154 aa4.1□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 STX2P32856 288 aa4.1□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 GP5P40197 560 aa4.1□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 TSFMP43897 325 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC6A12P48065 614 aa4.1□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 HMGA2P52926 109 aa4.1□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 RAB10P61026 200 aa4.1□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 HSF1Q00613 529 aa4.1□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 RHAGQ02094 409 aa4.1□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 GUCY2DQ02846 1103 aa4.1□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
RPS3AP54-201ENST00000435535 DLG1Q12959 904 aa4.1□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms