RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa17.48■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 SCO2O43819 266 aa17.48■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 AIFM1O95831 613 aa17.48■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 DRD3P35462 400 aa17.48■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 LTBRP36941 435 aa17.48■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 MC3RP41968 323 aa17.48■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 SNAP47Q5SQN1 464 aa17.48■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM64Q6YI46 380 aa17.48■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa17.48■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 MRGPREQ86SM8 312 aa17.48■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF485Q8NCK3 441 aa17.48■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 OTULINQ96BN8 352 aa17.48■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP17.48■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP17.48■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa17.48■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP17.48■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 ASB4Q9Y574 426 aa17.48■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 CD8B2A6NJW9 211 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 CCNYL3P0C7X3 344 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 CD8BP10966 210 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP17.47■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 CERS1P27544 350 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 OMPP47874 163 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 RAB8AP61006 207 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 TATDN3Q17R31 274 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP17.47■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 NEIL3Q8TAT5 605 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 PIGXQ8TBF5 258 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 DIO2Q92813 273 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 MS4A6EQ96DS6 147 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 CAMK1GQ96NX5 476 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 ATF6BQ99941 703 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP17.47■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 OR6C70A6NIJ9 312 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC2A10O95528 541 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 POU2F2P09086 479 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 ATP6V1E1P36543 226 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP17.47■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 TGM3Q08188 693 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 ST3GAL3Q11203 375 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 RAB42Q8N4Z0 105 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 SIMC1Q8NDZ2 872 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 OR9A2Q8NGT5 310 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 S1PR5Q9H228 398 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF576Q9H609 170 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP17.47■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 KCNK6Q9Y257 313 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 CHST2Q9Y4C5 530 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 GABRPO00591 440 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP17.46■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 B3GLCTQ6Y288 498 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 NUP43Q8NFH3 380 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 OR56A1Q8NGH5 318 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 SFXN5Q8TD22 340 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 KAT2AQ92830 837 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP17.46■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP17.46■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 NLKQ9UBE8 527 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 LIPT1Q9Y234 373 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 CENPBD1B2RD01 187 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 DVL2O14641 736 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 PIP5K1CO60331 668 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP17.46■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 ADAM15Q13444 863 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 NRMQ8IXM6 262 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 POGLUT1Q8NBL1 392 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP17.46■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP17.46■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP17.46■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 LMAN2LQ9H0V9 348 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP17.46■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 PRDM7Q9NQW5 492 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 SURF4O15260 269 aa17.46■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 FCMRO60667 390 aa17.46■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP17.46■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 RAB28P51157 221 aa17.46■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 PRR5P85299 388 aa17.46■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 KRT33BQ14525 404 aa17.46■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP17.46■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM35AQ53FP2 167 aa17.46■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 AADACL4Q5VUY2 407 aa17.46■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 ABHD17CQ6PCB6 329 aa17.46■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa17.46■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 C16orf62Q7Z3J2 963 aa17.46■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 RFKQ969G6 155 aa17.46■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 ARHGDIGQ99819 225 aa17.46■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 MAU2Q9Y6X3 613 aa17.46■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 OR52A4PA6NMU1 304 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 HCN1O60741 890 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 HLA-DPB1P04440 258 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 ASGR2P07307 311 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1-202ENST00000417536 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.1 ms