RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415055.2

PTPRK-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, human

TSL 5

Gene PTPRK, Length 782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRK-210	ENST00000415055	PAFAH1B3	Q15102	231 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	HADH	Q16836	314 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	SYT16	Q17RD7	645 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	SLC25A35	Q3KQZ1	300 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	ACSM2B	Q68CK6	577 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	FRMPD2B	Q6IN97	320 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	PPP1R2P3	Q6NXS1	205 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	AAGAB	Q6PD74	315 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	LRIG3	Q6UXM1	1119 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	B3GNT6	Q6ZMB0	384 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	MOB3C	Q70IA8	216 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	HIST3H2A	Q7L7L0	130 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	TAS2R42	Q7RTR8	314 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	CPEB2	Q7Z5Q1	589 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	TBC1D21	Q8IYX1	336 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	IPMK	Q8NFU5	416 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	OR4N2	Q8NGD1	307 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	OR4K2	Q8NGD2	314 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	FLVCR1-AS1	Q8TAF5	88 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	TRAF3IP1	Q8TDR0	691 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	ELMO1	Q92556	727 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	SLCO2A1	Q92959	643 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	ULK4	Q96C45	1275 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	LINC00615	Q96LM1	132 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	IMMP1L	Q96LU5	166 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	IL17F	Q96PD4	163 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	COPS8	Q99627	209 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	OLFM1	Q99784	485 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	HEMGN	Q9BXL5	484 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	THAP2	Q9H0W7	228 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	EXO5	Q9H790	373 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	MRPL47	Q9HD33	250 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	RANGRF	Q9HD47	186 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	MKKS	Q9NPJ1	570 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	PNPLA3	Q9NST1	481 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	SMOX	Q9NWM0	555 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	HACD3	Q9P035	362 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	C19orf25	Q9UFG5	118 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	FAM153A	Q9UHL3	310 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	OSGIN1	Q9UJX0	560 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	KLF13	Q9Y2Y9	288 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	ARL5A	Q9Y689	179 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	PRR14L	Q5THK1	2151 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	LOC102723996	A0A087X1L8	192 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055		A0A0A6YYC8	382 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	TUBAL3	A6NHL2	446 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	FAM166B	A8MTA8	275 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	NPIPB11	E5RHQ5	1161 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	KLRC4-KLRK1	H3BQV0	150 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055		I3L1I5	382 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	CCL22	O00626	93 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	PHF1	O43189	567 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	SRPX2	O60687	465 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	CTSV	O60911	334 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	AVIL	O75366	819 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	GPC4	O75487	556 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	NEURL1	O76050	574 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	AP2A1	O95782	977 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	MYZAP	P0CAP1	466 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	FER	P16591	822 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	PSMB5	P28074	263 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	PKLR	P30613	574 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	PEX19	P40855	299 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	CYB561	P49447	251 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	F2RL1	P55085	397 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	MAT1A	Q00266	395 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	SLC25A11	Q02978	314 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	RUNX1T1	Q06455	604 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	PPID	Q08752	370 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	TSTA3	Q13630	321 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	KPNB1	Q14974	876 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	PDK1	Q15118	436 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	SLC1A5	Q15758	541 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	EXT1	Q16394	746 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	CMPK2	Q5EBM0	449 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	CST9LP1	Q5W188	147 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	TMEM205	Q6UW68	189 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	AMIGO2	Q86SJ2	522 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	RPS19BP1	Q86WX3	136 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	MAP7D3	Q8IWC1	876 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	OR8H3	Q8N146	312 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	CLDN19	Q8N6F1	224 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	MLKL	Q8NB16	471 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	TSPAN14	Q8NG11	270 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	OR5K2	Q8NHB8	316 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	LINC01560	Q8TB33	94 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	HEXDC	Q8WVB3	486 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	SKA2	Q8WVK7	121 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	SNAPC3	Q92966	411 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	TMCO6	Q96DC7	493 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	C10orf90	Q96M02	699 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	FCRL5	Q96RD9	977 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	SMC6	Q96SB8	1091 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	CYTH2	Q99418	400 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	NPAS2	Q99743	824 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	TTYH2	Q9BSA4	534 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	DUSP26	Q9BV47	211 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	VN1R1	Q9GZP7	353 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	HRH4	Q9H3N8	390 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRK-210	ENST00000415055	PLEKHF2	Q9H8W4	249 aa		4.16	□□□□□ -1.74

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