RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399300.6

RBM12B-201, Transcript of RNA binding motif protein 12B, human

APPRIS P2 TSL 2 BASIC

Gene RBM12B, Length 7,269 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM12B-201	ENST00000399300	RPS10-NUDT3	A0A1W2PQS6	291 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM12B-201	ENST00000399300	BET1	O15155	118 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM12B-201	ENST00000399300	NUPL2	O15504	423 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
RBM12B-201	ENST00000399300	TF	P02787	698 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM12B-201	ENST00000399300	SPATA31C1	P0DKV0	1188 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM12B-201	ENST00000399300	RPS10	P46783	165 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
RBM12B-201	ENST00000399300	IL17A	Q16552	155 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM12B-201	ENST00000399300	RABL3	Q5HYI8	236 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM12B-201	ENST00000399300	LY6G5C	Q5SRR4	150 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM12B-201	ENST00000399300	FNDC9	Q8TBE3	224 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM12B-201	ENST00000399300	MAL2	Q969L2	176 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM12B-201	ENST00000399300	STARD5	Q9NSY2	213 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM12B-201	ENST00000399300	GIMAP2	Q9UG22	337 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM12B-201	ENST00000399300	GLI2	P10070	1586 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM12B-201	ENST00000399300		B4DXG7	233 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM12B-201	ENST00000399300	KIAA0513	O60268	411 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM12B-201	ENST00000399300	RNH1	P13489	461 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
RBM12B-201	ENST00000399300	RPA2	P15927	270 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM12B-201	ENST00000399300	PCSK2	P16519	638 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM12B-201	ENST00000399300	OMG	P23515	440 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM12B-201	ENST00000399300	SERPINF1	P36955	418 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM12B-201	ENST00000399300	EFNA3	P52797	238 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM12B-201	ENST00000399300	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM12B-201	ENST00000399300	SYPL2	Q5VXT5	272 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM12B-201	ENST00000399300	FAM58A	Q8N1B3	248 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM12B-201	ENST00000399300	OR5L1	Q8NGL2	311 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM12B-201	ENST00000399300	NANOG	Q9H9S0	305 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM12B-201	ENST00000399300	TXNL4B	Q9NX01	149 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
RBM12B-201	ENST00000399300	LEFTY1	O75610	366 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM12B-201	ENST00000399300	HOXB5	P09067	269 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM12B-201	ENST00000399300	HLA-DOB	P13765	273 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM12B-201	ENST00000399300	RAB5C	P51148	216 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM12B-201	ENST00000399300	PDE7A	Q13946	482 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM12B-201	ENST00000399300	P2RY14	Q15391	338 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM12B-201	ENST00000399300	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
RBM12B-201	ENST00000399300	SLC35F2	Q8IXU6	374 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM12B-201	ENST00000399300	PGAP3	Q96FM1	320 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
RBM12B-201	ENST00000399300	HHIP	Q96QV1	700 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM12B-201	ENST00000399300	OCSTAMP	Q9BR26	566 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM12B-201	ENST00000399300	ABCG5	Q9H222	651 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM12B-201	ENST00000399300	OR1A2	Q9Y585	309 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM12B-201	ENST00000399300	TRAPPC2L	H3BP13	241 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM12B-201	ENST00000399300	HSD17B7	P56937	341 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM12B-201	ENST00000399300	TAS2R30	P59541	319 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM12B-201	ENST00000399300	ZNF33A	Q06730	810 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM12B-201	ENST00000399300	GRM7	Q14831	915 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM12B-201	ENST00000399300	CATSPERE	Q5SY80	951 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM12B-201	ENST00000399300	ZNF585A	Q6P3V2	769 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM12B-201	ENST00000399300	WDR92	Q96MX6	357 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM12B-201	ENST00000399300	SLC25A18	Q9H1K4	315 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM12B-201	ENST00000399300	ZMAT5	Q9UDW3	170 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
RBM12B-201	ENST00000399300	TRAPPC2L	Q9UL33	140 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM12B-201	ENST00000399300	KCTD3	Q9Y597	815 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM12B-201	ENST00000399300	MAK	P20794	623 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM12B-201	ENST00000399300	HNF1A	P20823	631 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM12B-201	ENST00000399300	CERS1	P27544	350 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM12B-201	ENST00000399300	OPCML	Q14982	345 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM12B-201	ENST00000399300	AADACL3	Q5VUY0	350 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM12B-201	ENST00000399300	FBXL22	Q6P050	247 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM12B-201	ENST00000399300	LARP4	Q71RC2	724 aa	Known RBP eCLIP	11.33	□□□□□ -0.6
RBM12B-201	ENST00000399300	PSMF1	Q92530	271 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM12B-201	ENST00000399300	IL17F	Q96PD4	163 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM12B-201	ENST00000399300	ACTR3B	Q9P1U1	418 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM12B-201	ENST00000399300	PHYH	O14832	338 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM12B-201	ENST00000399300	AOC2	O75106	756 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM12B-201	ENST00000399300	GATM	P50440	423 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM12B-201	ENST00000399300	EMP3	P54852	163 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM12B-201	ENST00000399300	CCNJ	Q5T5M9	372 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM12B-201	ENST00000399300	DBX2	Q6ZNG2	339 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM12B-201	ENST00000399300	DNAJC19	Q96DA6	116 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM12B-201	ENST00000399300	CCDC106	Q9BWC9	280 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RBM12B-201	ENST00000399300	NSUN3	Q9H649	340 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
RBM12B-201	ENST00000399300	PRSS51	A0A1B0GVH4	220 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RBM12B-201	ENST00000399300	PRAMEF27	A3QJZ7	478 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RBM12B-201	ENST00000399300	LGALS8	O00214	317 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RBM12B-201	ENST00000399300	FAAH	O00519	579 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RBM12B-201	ENST00000399300	CD63	P08962	238 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RBM12B-201	ENST00000399300	ETV4	P43268	484 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RBM12B-201	ENST00000399300	PPP2CA	P67775	309 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RBM12B-201	ENST00000399300	CCL14	Q16627	93 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RBM12B-201	ENST00000399300	PRAMEF9	Q5VWM5	478 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RBM12B-201	ENST00000399300	C3orf49	Q96BT1	292 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RBM12B-201	ENST00000399300	WDR37	Q9Y2I8	494 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RBM12B-201	ENST00000399300	PSAT1	Q9Y617	370 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RBM12B-201	ENST00000399300	LRP5L	A4QPB2	252 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RBM12B-201	ENST00000399300	ABCA8	O94911	1581 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RBM12B-201	ENST00000399300	PFKM	P08237	780 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RBM12B-201	ENST00000399300	ACTB	P60709	375 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RBM12B-201	ENST00000399300	ACTG1	P63261	375 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RBM12B-201	ENST00000399300	HHEX	Q03014	270 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RBM12B-201	ENST00000399300	GPR50	Q13585	617 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RBM12B-201	ENST00000399300	SULF2	Q8IWU5	870 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RBM12B-201	ENST00000399300	F2RL3	Q96RI0	385 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RBM12B-201	ENST00000399300	SLC29A3	Q9BZD2	475 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RBM12B-201	ENST00000399300	SOX17	Q9H6I2	414 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
RBM12B-201	ENST00000399300	FADS1	O60427	444 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RBM12B-201	ENST00000399300	RPS15A	P62244	130 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
RBM12B-201	ENST00000399300	PEA15	Q15121	130 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RBM12B-201	ENST00000399300	YIF1B	Q5BJH7	314 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RBM12B-201	ENST00000399300	OR11L1	Q8NGX0	322 aa		11.32	□□□□□ -0.6

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