RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 COMMD3Q9UBI1 195 aa6.76□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa6.76□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 ACSL5Q9ULC5 683 aa6.76□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM265A0A087WTH1 108 aa6.76□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa6.76□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa6.76□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 ANKDD1BA6NHY2 528 aa6.76□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 GABRR3A8MPY1 467 aa6.76□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 GFYI3L273 518 aa6.76□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 PCDH17O14917 1159 aa6.76□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 AKR7A2O43488 359 aa6.76□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 PCDH7O60245 1069 aa6.76□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 OR10H3O60404 316 aa6.76□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 PRAF2O60831 178 aa6.76□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 TSC22D2O75157 780 aa6.76□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 KLKB1P03952 638 aa6.76□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 H1F0P07305 194 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 CD53P19397 219 aa6.76□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 ACSL1P33121 698 aa6.76□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 GPR3P46089 330 aa6.76□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 RGRP47804 291 aa6.76□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 MTNR1BP49286 362 aa6.76□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 CCT3P49368 545 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 DSTNP60981 165 aa6.76□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 RHOAP61586 193 aa6.76□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 BDH1Q02338 343 aa6.76□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 SNAPC1Q16533 368 aa6.76□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 AANATQ16613 207 aa6.76□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 ATAT1Q5SQI0 421 aa6.76□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 SLC22A10Q63ZE4 541 aa6.76□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 PYHIN1Q6K0P9 492 aa6.76□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 BRAT1Q6PJG6 821 aa6.76□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 SLC36A4Q6YBV0 504 aa6.76□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa6.76□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 USP45Q70EL2 814 aa6.76□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 OR52I1Q8NGK6 324 aa6.76□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 OR52P1PQ8NH57 321 aa6.76□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 NFKBIDQ8NI38 313 aa6.76□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP6.76□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 WDR20Q8TBZ3 569 aa6.76□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 FBXW5Q969U6 566 aa6.76□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 SCMH1Q96GD3 660 aa6.76□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 TCTN2Q96GX1 697 aa6.76□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 MSANTD3Q96H12 275 aa6.76□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 OR4K3Q96R72 315 aa6.76□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 IL4I1Q96RQ9 567 aa6.76□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa6.76□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 EBPLQ9BY08 206 aa6.76□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 SLC46A2Q9BY10 475 aa6.76□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 HDAC8Q9BY41 377 aa6.76□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 NLNQ9BYT8 704 aa6.76□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 BTBD1Q9H0C5 482 aa6.76□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 HDHD2Q9H0R4 259 aa6.76□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 AP5S1Q9NUS5 200 aa6.76□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 TDP1Q9NUW8 608 aa6.76□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM184CQ9NVA4 438 aa6.76□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 UCKL1Q9NWZ5 548 aa6.76□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 ZSCAN32Q9NX65 697 aa6.76□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 CFAP97Q9P2B7 532 aa6.76□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa6.76□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa6.76□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 A0A1W2PPC1 479 aa6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 A0A1W2PRB8 838 aa6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 F8W735 103 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 LEFTY2O00292 366 aa6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM127O75204 238 aa6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 SOD1P00441 154 aa6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 LALBAP00709 142 aa6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 ETFAP13804 333 aa6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 POU2F1P14859 743 aa6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 UGT2B7P16662 529 aa6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 APEX1P27695 318 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 EVI2BP34910 448 aa6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 BDKRB1P46663 353 aa6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 OR1E2P47887 323 aa6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 RFX3P48380 749 aa6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 SHC2P98077 582 aa6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 HOXC5Q00444 222 aa6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 BCL2L1Q07817 233 aa6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 TEAD2Q15562 447 aa6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 XKR6Q5GH73 641 aa6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 RETSATQ6NUM9 610 aa6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 ARSKQ6UWY0 536 aa6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 TPGS1Q6ZTW0 290 aa6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 SPRED2Q7Z698 418 aa6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF366Q8N895 744 aa6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 VN1R2Q8NFZ6 395 aa6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 OR5M3Q8NGP4 307 aa6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 OR52N1Q8NH53 320 aa6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 CDC26Q8NHZ8 85 aa6.75□□□□□ -1.33
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