RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372478.4

C9orf50-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 50, humanhuman

APPRIS P2 TSL 2 BASIC

Gene C9orf50, Length 1,620 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf50-201ENST00000372478 MAN2A2P49641 1150 aa23.1■■□□□ 1.29
C9orf50-201ENST00000372478 LRRC74AQ0VAA2 488 aa23.1■■□□□ 1.29
C9orf50-201ENST00000372478 TBCELQ5QJ74 424 aa23.1■■□□□ 1.29
C9orf50-201ENST00000372478 SLC2A7Q6PXP3 512 aa23.1■■□□□ 1.29
C9orf50-201ENST00000372478 ATCAYQ86WG3 371 aa23.1■■□□□ 1.29
C9orf50-201ENST00000372478 SIAH3Q8IW03 269 aa23.1■■□□□ 1.29
C9orf50-201ENST00000372478 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
C9orf50-201ENST00000372478 TMCO6Q96DC7 493 aa23.1■■□□□ 1.29
C9orf50-201ENST00000372478 SPDL1Q96EA4 605 aa23.1■■□□□ 1.29
C9orf50-201ENST00000372478 OR7D2Q96RA2 312 aa23.1■■□□□ 1.29
C9orf50-201ENST00000372478 STACQ99469 402 aa23.1■■□□□ 1.29
C9orf50-201ENST00000372478 PIGUQ9H490 435 aa23.1■■□□□ 1.29
C9orf50-201ENST00000372478 RMND5AQ9H871 391 aa23.1■■□□□ 1.29
C9orf50-201ENST00000372478 GALNT9Q9HCQ5 603 aa23.1■■□□□ 1.29
C9orf50-201ENST00000372478 DUSP22Q9NRW4 184 aa23.1■■□□□ 1.29
C9orf50-201ENST00000372478 KLRF1Q9NZS2 232 aa23.1■■□□□ 1.29
C9orf50-201ENST00000372478 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
C9orf50-201ENST00000372478 PRAMEF25A6NGN4 478 aa23.09■■□□□ 1.29
C9orf50-201ENST00000372478 TFECO14948 347 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
C9orf50-201ENST00000372478 ICOSLGO75144 302 aa23.09■■□□□ 1.29
C9orf50-201ENST00000372478 KCNK2O95069 426 aa23.09■■□□□ 1.29
C9orf50-201ENST00000372478 KRT16P08779 473 aa23.09■■□□□ 1.29
C9orf50-201ENST00000372478 UQCRFS1P47985 274 aa23.09■■□□□ 1.29
C9orf50-201ENST00000372478 PPIAP62937 165 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
C9orf50-201ENST00000372478 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
C9orf50-201ENST00000372478 ART3Q13508 389 aa23.09■■□□□ 1.29
C9orf50-201ENST00000372478 C6orf10Q5SRN2 563 aa23.09■■□□□ 1.29
C9orf50-201ENST00000372478 CCNJQ5T5M9 372 aa23.09■■□□□ 1.29
C9orf50-201ENST00000372478 SAXO2Q658L1 398 aa23.09■■□□□ 1.29
C9orf50-201ENST00000372478 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa23.09■■□□□ 1.29
C9orf50-201ENST00000372478 ZGRF1Q86YA3 2104 aa23.09■■□□□ 1.29
C9orf50-201ENST00000372478 ARHGAP24Q8N264 748 aa23.09■■□□□ 1.29
C9orf50-201ENST00000372478 GALNT11Q8NCW6 608 aa23.09■■□□□ 1.29
C9orf50-201ENST00000372478 ITCHQ96J02 903 aa23.09■■□□□ 1.29
C9orf50-201ENST00000372478 FBXO34Q9NWN3 711 aa23.09■■□□□ 1.29
C9orf50-201ENST00000372478 LRRC3CA6NJW4 275 aa23.08■■□□□ 1.29
C9orf50-201ENST00000372478 BBIP1A8MTZ0 92 aa23.08■■□□□ 1.29
C9orf50-201ENST00000372478 AIM2O14862 343 aa23.08■■□□□ 1.29
C9orf50-201ENST00000372478 GSC2O15499 205 aa23.08■■□□□ 1.29
C9orf50-201ENST00000372478 GLSO94925 669 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
C9orf50-201ENST00000372478 EDN3P14138 238 aa23.08■■□□□ 1.29
C9orf50-201ENST00000372478 NQO1P15559 274 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
C9orf50-201ENST00000372478 CAPN3P20807 821 aa23.08■■□□□ 1.29
C9orf50-201ENST00000372478 PTGDSP41222 190 aa23.08■■□□□ 1.29
C9orf50-201ENST00000372478 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
C9orf50-201ENST00000372478 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa23.08■■□□□ 1.29
C9orf50-201ENST00000372478 ZAR1Q86SH2 424 aa23.08■■□□□ 1.29
C9orf50-201ENST00000372478 TRIML2Q8N7C3 387 aa23.08■■□□□ 1.29
C9orf50-201ENST00000372478 MCUR1Q96AQ8 359 aa23.08■■□□□ 1.29
C9orf50-201ENST00000372478 NEURL3Q96EH8 262 aa23.08■■□□□ 1.29
C9orf50-201ENST00000372478 BTBD2Q9BX70 525 aa23.08■■□□□ 1.29
C9orf50-201ENST00000372478 OSBPL11Q9BXB4 747 aa23.08■■□□□ 1.29
C9orf50-201ENST00000372478 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
C9orf50-201ENST00000372478 IL1RL2Q9HB29 575 aa23.08■■□□□ 1.29
C9orf50-201ENST00000372478 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
C9orf50-201ENST00000372478 NDUFAF1Q9Y375 327 aa23.08■■□□□ 1.29
C9orf50-201ENST00000372478 H0YHG0 523 aa23.08■■□□□ 1.28
C9orf50-201ENST00000372478 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.28
C9orf50-201ENST00000372478 GNLYP22749 145 aa23.08■■□□□ 1.28
C9orf50-201ENST00000372478 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.28
C9orf50-201ENST00000372478 GTDC1Q4AE62 458 aa23.08■■□□□ 1.28
C9orf50-201ENST00000372478 C16orf89Q6UX73 402 aa23.08■■□□□ 1.28
C9orf50-201ENST00000372478 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa23.08■■□□□ 1.28
C9orf50-201ENST00000372478 OR52N2Q8NGI0 321 aa23.08■■□□□ 1.28
C9orf50-201ENST00000372478 GTF2H4Q92759 462 aa23.08■■□□□ 1.28
C9orf50-201ENST00000372478 ZNF597Q96LX8 424 aa23.08■■□□□ 1.28
C9orf50-201ENST00000372478 OR51I1Q9H343 314 aa23.08■■□□□ 1.28
C9orf50-201ENST00000372478 ZFP64Q9NPA5 681 aa23.08■■□□□ 1.28
C9orf50-201ENST00000372478 SLC52A3Q9NQ40 469 aa23.08■■□□□ 1.28
C9orf50-201ENST00000372478 GIN1Q9NXP7 522 aa23.08■■□□□ 1.28
C9orf50-201ENST00000372478 SNX4O95219 450 aa23.07■■□□□ 1.28
C9orf50-201ENST00000372478 ANP32DO95626 131 aa23.07■■□□□ 1.28
C9orf50-201ENST00000372478 RFPL3SP0C7P2 107 aa23.07■■□□□ 1.28
C9orf50-201ENST00000372478 MASP1P48740 699 aa23.07■■□□□ 1.28
C9orf50-201ENST00000372478 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
C9orf50-201ENST00000372478 TMEM81Q6P7N7 255 aa23.07■■□□□ 1.28
C9orf50-201ENST00000372478 PACS2Q86VP3 889 aa23.07■■□□□ 1.28
C9orf50-201ENST00000372478 SLC22A16Q86VW1 577 aa23.07■■□□□ 1.28
C9orf50-201ENST00000372478 TMEM251Q8N6I4 163 aa23.07■■□□□ 1.28
C9orf50-201ENST00000372478 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa23.07■■□□□ 1.28
C9orf50-201ENST00000372478 FAM110BQ8TC76 370 aa23.07■■□□□ 1.28
C9orf50-201ENST00000372478 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
C9orf50-201ENST00000372478 NTNG2Q96CW9 530 aa23.07■■□□□ 1.28
C9orf50-201ENST00000372478 RCN3Q96D15 328 aa23.07■■□□□ 1.28
C9orf50-201ENST00000372478 DEFB127Q9H1M4 99 aa23.07■■□□□ 1.28
C9orf50-201ENST00000372478 SEC14L3Q9UDX4 400 aa23.07■■□□□ 1.28
C9orf50-201ENST00000372478 ANKUB1A6NFN9 424 aa23.06■■□□□ 1.28
C9orf50-201ENST00000372478 ACOT7O00154 380 aa23.06■■□□□ 1.28
C9orf50-201ENST00000372478 ANGPT2O15123 496 aa23.06■■□□□ 1.28
C9orf50-201ENST00000372478 UTS2O95399 124 aa23.06■■□□□ 1.28
C9orf50-201ENST00000372478 NUDT2P50583 147 aa23.06■■□□□ 1.28
C9orf50-201ENST00000372478 FNDC7Q5VTL7 733 aa23.06■■□□□ 1.28
C9orf50-201ENST00000372478 SLC30A6Q6NXT4 461 aa23.06■■□□□ 1.28
C9orf50-201ENST00000372478 RNF130Q86XS8 419 aa23.06■■□□□ 1.28
C9orf50-201ENST00000372478 RAB8BQ92930 207 aa23.06■■□□□ 1.28
C9orf50-201ENST00000372478 GPR137Q96N19 417 aa23.06■■□□□ 1.28
C9orf50-201ENST00000372478 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
C9orf50-201ENST00000372478 GNB5O14775 395 aa23.05■■□□□ 1.28
C9orf50-201ENST00000372478 ASNA1O43681 348 aa23.05■■□□□ 1.28
C9orf50-201ENST00000372478 SCO2O43819 266 aa23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms