RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 AP4S1Q9Y587 144 aa27.26■■□□□ 1.95
ECHS1-201ENST00000368547 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa27.26■■□□□ 1.95
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ECHS1-201ENST00000368547 PCGF2P35227 344 aa27.25■■□□□ 1.95
ECHS1-201ENST00000368547 PLCXD2Q0VAA5 305 aa27.25■■□□□ 1.95
ECHS1-201ENST00000368547 GCNT6Q5T4J0 391 aa27.25■■□□□ 1.95
ECHS1-201ENST00000368547 ISLR2Q6UXK2 745 aa27.25■■□□□ 1.95
ECHS1-201ENST00000368547 SLC34A3Q8N130 599 aa27.25■■□□□ 1.95
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ECHS1-201ENST00000368547 C16orf62Q7Z3J2 963 aa27.24■■□□□ 1.95
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ECHS1-201ENST00000368547 TMEM156Q8N614 296 aa27.23■■□□□ 1.95
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ECHS1-201ENST00000368547 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP27.23■■□□□ 1.95
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ECHS1-201ENST00000368547 C19orf48Q6RUI8 117 aa27.22■■□□□ 1.95
ECHS1-201ENST00000368547 PQLC1Q8N2U9 271 aa27.22■■□□□ 1.95
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ECHS1-201ENST00000368547 SDF2Q99470 211 aa27.22■■□□□ 1.95
ECHS1-201ENST00000368547 ANKRD10Q9NXR5 420 aa27.22■■□□□ 1.95
ECHS1-201ENST00000368547 ANAPC2Q9UJX6 822 aa27.22■■□□□ 1.95
ECHS1-201ENST00000368547 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
ECHS1-201ENST00000368547 LIPT1Q9Y234 373 aa27.22■■□□□ 1.95
ECHS1-201ENST00000368547 AK1P00568 194 aa27.21■■□□□ 1.95
ECHS1-201ENST00000368547 TFPTP0C1Z6 253 aa27.21■■□□□ 1.95
ECHS1-201ENST00000368547 FBXO45P0C2W1 286 aa27.21■■□□□ 1.95
ECHS1-201ENST00000368547 ARAFP10398 606 aa27.21■■□□□ 1.95
ECHS1-201ENST00000368547 NR2F1P10589 423 aa27.21■■□□□ 1.95
ECHS1-201ENST00000368547 GPAT3Q53EU6 434 aa27.21■■□□□ 1.95
ECHS1-201ENST00000368547 IL20RBQ6UXL0 311 aa27.21■■□□□ 1.95
ECHS1-201ENST00000368547 OLIG3Q7RTU3 272 aa27.21■■□□□ 1.95
ECHS1-201ENST00000368547 ANKFN1Q8N957 763 aa27.21■■□□□ 1.95
ECHS1-201ENST00000368547 SLC38A5Q8WUX1 472 aa27.21■■□□□ 1.95
ECHS1-201ENST00000368547 DIO2Q92813 273 aa27.21■■□□□ 1.95
ECHS1-201ENST00000368547 ADOQ96SZ5 270 aa27.21■■□□□ 1.95
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ECHS1-201ENST00000368547 IL33O95760 270 aa27.2■■□□□ 1.95
ECHS1-201ENST00000368547 F10P00742 488 aa27.2■■□□□ 1.95
ECHS1-201ENST00000368547 BCHEP06276 602 aa27.2■■□□□ 1.95
ECHS1-201ENST00000368547 NAGAP17050 411 aa27.2■■□□□ 1.95
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ECHS1-201ENST00000368547 TMED10P49755 219 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.95
ECHS1-201ENST00000368547 MAPK11Q15759 364 aa27.2■■□□□ 1.95
ECHS1-201ENST00000368547 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.95
ECHS1-201ENST00000368547 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.95
ECHS1-201ENST00000368547 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.95
ECHS1-201ENST00000368547 UGT2B28Q9BY64 529 aa27.2■■□□□ 1.95
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa27.2■■□□□ 1.95
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM247A6NEH6 219 aa27.19■■□□□ 1.94
ECHS1-201ENST00000368547 MKRN2OSH3BPM6 223 aa27.19■■□□□ 1.94
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