RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 SNX8Q9Y5X2 465 aa17.79■□□□□ 0.44
PTPRCAP-201ENST00000326294 CELSR2Q9HCU4 2923 aa17.79■□□□□ 0.44
PTPRCAP-201ENST00000326294 UTS2O95399 124 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRCAP-201ENST00000326294 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
PTPRCAP-201ENST00000326294 ALOX5P09917 674 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRCAP-201ENST00000326294 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
PTPRCAP-201ENST00000326294 CHRNB4P30926 498 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRIM2P49643 509 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRCAP-201ENST00000326294 WNT3P56703 355 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRCAP-201ENST00000326294 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
PTPRCAP-201ENST00000326294 PGS1Q32NB8 556 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRCAP-201ENST00000326294 GRAMD1BQ3KR37 738 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRCAP-201ENST00000326294 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
PTPRCAP-201ENST00000326294 TTMPQ5BVD1 217 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR4F3Q6IEY1 312 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRCAP-201ENST00000326294 OGFOD2Q6N063 350 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRCAP-201ENST00000326294 GALNT10Q86SR1 603 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRIM42Q8IWZ5 723 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRCAP-201ENST00000326294 FADS6Q8N9I5 356 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR56A1Q8NGH5 318 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR14L1PQ8NHC6 308 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRCAP-201ENST00000326294 SFXN5Q8TD22 340 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRCAP-201ENST00000326294 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRCAP-201ENST00000326294 ASB5Q8WWX0 329 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRCAP-201ENST00000326294 JADE3Q92613 823 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRCAP-201ENST00000326294 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRCAP-201ENST00000326294 MANSC1Q9H8J5 431 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRCAP-201ENST00000326294 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRCAP-201ENST00000326294 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRCAP-201ENST00000326294 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.44
PTPRCAP-201ENST00000326294 HDAC3O15379 428 aa17.77■□□□□ 0.44
PTPRCAP-201ENST00000326294 KCNK2O95069 426 aa17.77■□□□□ 0.44
PTPRCAP-201ENST00000326294 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.44
PTPRCAP-201ENST00000326294 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.44
PTPRCAP-201ENST00000326294 PTGER4P35408 488 aa17.77■□□□□ 0.44
PTPRCAP-201ENST00000326294 ADH7P40394 386 aa17.77■□□□□ 0.44
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCT3P49368 545 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.44
PTPRCAP-201ENST00000326294 HBA1P69905 142 aa17.77■□□□□ 0.44
PTPRCAP-201ENST00000326294 STX5Q13190 355 aa17.77■□□□□ 0.44
PTPRCAP-201ENST00000326294 TP53BP2Q13625 1128 aa17.77■□□□□ 0.44
PTPRCAP-201ENST00000326294 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.44
PTPRCAP-201ENST00000326294 FIGNL1Q6PIW4 674 aa17.77■□□□□ 0.44
PTPRCAP-201ENST00000326294 APOOLQ6UXV4 268 aa17.77■□□□□ 0.44
PTPRCAP-201ENST00000326294 SEM1Q6ZVN7 128 aa17.77■□□□□ 0.44
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZAR1Q86SH2 424 aa17.77■□□□□ 0.44
PTPRCAP-201ENST00000326294 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.44
PTPRCAP-201ENST00000326294 CLECL1Q8IZS7 167 aa17.77■□□□□ 0.44
PTPRCAP-201ENST00000326294 COX18Q8N8Q8 333 aa17.77■□□□□ 0.44
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR2M3Q8NG83 312 aa17.77■□□□□ 0.44
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR4K17Q8NGC6 315 aa17.77■□□□□ 0.44
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM110BQ8TC76 370 aa17.77■□□□□ 0.44
PTPRCAP-201ENST00000326294 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.44
PTPRCAP-201ENST00000326294 WDYHV1Q96HA8 205 aa17.77■□□□□ 0.44
PTPRCAP-201ENST00000326294 DPY30Q9C005 99 aa17.77■□□□□ 0.44
PTPRCAP-201ENST00000326294 CHST11Q9NPF2 352 aa17.77■□□□□ 0.44
PTPRCAP-201ENST00000326294 GPATCH2Q9NW75 528 aa17.77■□□□□ 0.44
PTPRCAP-201ENST00000326294 TAS2R10Q9NYW0 307 aa17.77■□□□□ 0.44
PTPRCAP-201ENST00000326294 DKKL1Q9UK85 242 aa17.77■□□□□ 0.44
PTPRCAP-201ENST00000326294 PCNX3Q9H6A9 2034 aa17.77■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 A0A0G2JNJ9 132 aa17.76■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 KLF11O14901 512 aa17.76■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 CFLARO15519 480 aa17.76■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 ACTL6AO96019 429 aa17.76■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 KITP10721 976 aa17.76■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 EPHA3P29320 983 aa17.76■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 GFRA1P56159 465 aa17.76■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP17.76■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPDYE7PQ495Y7 208 aa17.76■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 CDC73Q6P1J9 531 aa17.76■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 MAVSQ7Z434 540 aa17.76■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 MARCH3Q86UD3 253 aa17.76■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 IFNEQ86WN2 208 aa17.76■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 PM20D2Q8IYS1 436 aa17.76■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR8J2Q8NGG1 315 aa17.76■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR5AK3PQ8NH89 298 aa17.76■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 CDS1Q92903 461 aa17.76■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 MARVELD3Q96A59 401 aa17.76■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 TESCQ96BS2 214 aa17.76■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 MOAP1Q96BY2 351 aa17.76■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 STACQ99469 402 aa17.76■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 DSN1Q9H410 356 aa17.76■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 DUSP22Q9NRW4 184 aa17.76■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 AIG1Q9NVV5 245 aa17.76■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 FBXO34Q9NWN3 711 aa17.76■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 Q9UFV3 132 aa17.76■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 CAMK2AQ9UQM7 478 aa17.76■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 HCFC1P51610 2035 aa17.76■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 ABCA12Q86UK0 2595 aa17.75■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa17.75■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 GOLGA8OA6NCC3 632 aa17.75■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRPC5OSA6NMA1 111 aa17.75■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM90A27PA6NNH2 459 aa17.75■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 AHRRA9YTQ3 701 aa17.75■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 GOLGA8NF8WBI6 632 aa17.75■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 SCN2BO60939 215 aa17.75■□□□□ 0.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 NGFRP08138 427 aa17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.9 ms