RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000309641.10

PDE4D-201, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,025 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-201ENST00000309641 TSPEARQ8WU66 669 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 MAL2Q969L2 176 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 RCN3Q96D15 328 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 KLHDC3Q9BQ90 382 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 DOHHQ9BU89 302 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 METTL7AQ9H8H3 244 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 CNIH4Q9P003 139 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 KCNE5Q9UJ90 142 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 MKLN1Q9UL63 735 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF407Q9C0G0 2248 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 FREM3P0C091 2139 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 PRAMEF25A6NGN4 478 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 TTC36A6NLP5 189 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 FAM166BA8MTA8 275 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 CDK2AP1O14519 115 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 TP53I11O14683 189 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 SCO2O43819 266 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 HS6ST1O60243 411 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 FADS1O60427 444 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 CELA3AP09093 270 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 COX4I1P13073 169 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 EVI2BP34910 448 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 GAS1P54826 345 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 MTPNP58546 118 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 KCNJ2P63252 427 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 TLE1Q04724 770 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 RGNQ15493 299 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 MARCH3Q86UD3 253 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 ANKFN1Q8N957 763 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 GATSQ8NAP1 163 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 POGLUT1Q8NBL1 392 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 OR52N2Q8NGI0 321 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 CPT1CQ8TCG5 803 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 RNF138Q8WVD3 245 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 ARSGQ96EG1 525 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 GNRHR2Q96P88 292 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 CGREF1Q99674 301 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 ANGPTL4Q9BY76 406 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 TTTY12Q9BZ98 90 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 RUBCNLQ9H714 662 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 DNAJC13O75165 2243 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 ANKRD33BA6NCL7 494 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 GNB5O14775 395 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 MRASO14807 208 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 KRT75O95678 551 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 CHRM4P08173 479 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 CPA2P48052 419 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 KHKP50053 298 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 STX5Q13190 355 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 MAPK14Q16539 360 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 RUNDC3AQ59EK9 446 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 RABL3Q5HYI8 236 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 ZGRF1Q86YA3 2104 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 FITM2Q8N6M3 262 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 WDSUB1Q8N9V3 476 aa8.31□□□□□ -1.08
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PDE4D-201ENST00000309641 ROPN1LQ96C74 230 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 TMCO6Q96DC7 493 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 ANKRD27Q96NW4 1050 aa8.31□□□□□ -1.08
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PDE4D-201ENST00000309641 FAM173AQ9BQD7 235 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 OSBPL11Q9BXB4 747 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 PIF1Q9H611 641 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 KLRF1Q9NZS2 232 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 FLNCQ14315 2725 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 DUXAA6NLW8 204 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 NPIPB9F8W1W9 429 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 AIM2O14862 343 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 SLC22A2O15244 555 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 ASNA1O43681 348 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 SLC28A2O43868 658 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 GMFGO60234 142 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 TNFRSF21O75509 655 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 GLSO94925 669 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 H6PDO95479 791 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 KRT16P08779 473 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 MAGEA5P43359 124 aa8.3□□□□□ -1.08
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PDE4D-201ENST00000309641 CHRNEQ04844 493 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 EFR3AQ14156 821 aa8.3□□□□□ -1.08
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