RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285199.11

USP43-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 43, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP43, Length 4,169 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43-201ENST00000285199 OPALINQ96PE5 141 aa14.81□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 COMMD4Q9H0A8 199 aa14.81□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 TMEM45AQ9NWC5 275 aa14.81□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 POLHQ9Y253 713 aa14.81□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa14.81□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 B4GALT2O60909 372 aa14.81□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 PPP1R3DO95685 299 aa14.81□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 GRK1Q15835 563 aa14.81□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa14.81□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 OR6N2Q8NGY6 317 aa14.81□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 GPR174Q9BXC1 333 aa14.81□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 ABCG4Q9H172 646 aa14.81□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 IMPA1P29218 277 aa14.81□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 CDC20Q12834 499 aa14.81□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 LRIF1Q5T3J3 769 aa14.81□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa14.81□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 NAXEQ8NCW5 288 aa14.81□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 C4orf36Q96KX1 117 aa14.81□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 TRIB3Q96RU7 358 aa14.81□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 TRAV27A0A087WT01 109 aa14.8□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 OR52A4PA6NMU1 304 aa14.8□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 ARAFP10398 606 aa14.8□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 TFPIP10646 304 aa14.8□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 HOXA9P31269 272 aa14.8□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 P2RX3P56373 397 aa14.8□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 KCNC3Q14003 757 aa14.8□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 GBX1Q14549 363 aa14.8□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 SLC25A24Q6NUK1 477 aa14.8□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 LINC00471Q8N535 108 aa14.8□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa14.8□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 OR9A2Q8NGT5 310 aa14.8□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 OR2A14Q96R47 310 aa14.8□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 DPEP2Q9H4A9 486 aa14.8□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 TMEM184CQ9NVA4 438 aa14.8□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 A0A0B4J203 849 aa14.8□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 HYKKA2RU49 373 aa14.8□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 GABRA3P34903 492 aa14.8□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 SLC1A3P43003 542 aa14.8□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 PFN3P60673 137 aa14.8□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 NKPD1Q17RQ9 610 aa14.8□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 FAM198BQ6UWH4 519 aa14.8□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 NSMAFQ92636 917 aa14.8□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 WDR26Q9H7D7 661 aa14.8□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 FKBP14Q9NWM8 211 aa14.8□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 C11orf98E9PRG8 122 aa14.8□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 INHBBP09529 407 aa14.8□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 MMP11P24347 488 aa14.8□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 NTHL1P78549 312 aa14.8□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 ACVR1Q04771 509 aa14.8□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 CHRNEQ04844 493 aa14.8□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 HDDC3Q8N4P3 179 aa14.8□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 ZNF527Q8NB42 609 aa14.8□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 OR4M1Q8NGD0 313 aa14.8□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 PPP1R14AQ96A00 147 aa14.8□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 P2RY12Q9H244 342 aa14.8□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 QPCTLQ9NXS2 382 aa14.8□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 MED16Q9Y2X0 877 aa14.8□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 ANTXRLA6NF34 631 aa14.79□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 UNC119BA6NIH7 251 aa14.79□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 WASH3PC4AMC7 463 aa14.79□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa14.79□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 AGPAT2O15120 278 aa14.79□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 PRR35P0CG20 571 aa14.79□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 PGAM2P15259 253 aa14.79□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 PLK5Q496M5 336 aa14.79□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 C3P1Q6ZMU1 363 aa14.79□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 PDZD9Q8IXQ8 264 aa14.79□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 SDR9C7Q8NEX9 313 aa14.79□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 SUN3Q8TAQ9 357 aa14.79□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 FOXN4Q96NZ1 517 aa14.79□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 MVB12BQ9H7P6 319 aa14.79□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 PADI2Q9Y2J8 665 aa14.79□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 ANKRD61A6NGH8 418 aa14.79□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 ADH1CP00326 375 aa14.79□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 TAS2R38P59533 333 aa14.79□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 PYHIN1Q6K0P9 492 aa14.79□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 BHLHA9Q7RTU4 235 aa14.79□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa14.79□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 OR56A1Q8NGH5 318 aa14.79□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 IRF7Q92985 503 aa14.79□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 SLC41A3Q96GZ6 507 aa14.79□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 MED30Q96HR3 178 aa14.79□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 IGSF21Q96ID5 467 aa14.79□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 C5orf34Q96MH7 638 aa14.79□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 MNTQ99583 582 aa14.79□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 PIGUQ9H490 435 aa14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.9 ms