RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
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SPCS1-201ENST00000233025 IRF9Q00978 393 aa14.59□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 RAB35Q15286 201 aa14.59□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 TSC22D1Q15714 1073 aa14.59□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa14.59□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 RNF175Q8N4F7 328 aa14.59□□□□□ -0.07
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SPCS1-201ENST00000233025 RNF138Q8WVD3 245 aa14.59□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
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SPCS1-201ENST00000233025 A0A1W2PR48 441 aa14.58□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 FAM157AC9JC47 383 aa14.58□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 K7EPI3 171 aa14.58□□□□□ -0.08
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SPCS1-201ENST00000233025 KERAO60938 352 aa14.58□□□□□ -0.08
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SPCS1-201ENST00000233025 APEHP13798 732 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
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SPCS1-201ENST00000233025 GAS1P54826 345 aa14.58□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 SLMAPQ14BN4 828 aa14.58□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP14.58□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 MIDNQ504T8 468 aa14.58□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 GRTP1Q5TC63 336 aa14.58□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 RAET1LQ5VY80 246 aa14.58□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 MED27Q6P2C8 311 aa14.58□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 ZDHHC24Q6UX98 284 aa14.58□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 STK32CQ86UX6 486 aa14.58□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 CTAGE3PQ8IX95 158 aa14.58□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 GABRG1Q8N1C3 465 aa14.58□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 OR7G3Q8NG95 312 aa14.58□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 STAG3L4Q8TBR4 150 aa14.58□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 FBXO25Q8TCJ0 367 aa14.58□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 HSD17B8Q92506 261 aa14.58□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 KAT2AQ92830 837 aa14.58□□□□□ -0.08
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SPCS1-201ENST00000233025 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 RAB17Q9H0T7 212 aa14.58□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 ASB4Q9Y574 426 aa14.58□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa14.57□□□□□ -0.08
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SPCS1-201ENST00000233025 SUPT3HB4E1H0 165 aa14.57□□□□□ -0.08
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SPCS1-201ENST00000233025 PLPP1O14494 284 aa14.57□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 SUPT3HO75486 399 aa14.57□□□□□ -0.08
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SPCS1-201ENST00000233025 S100BP04271 92 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
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SPCS1-201ENST00000233025 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
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SPCS1-201ENST00000233025 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa14.57□□□□□ -0.08
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SPCS1-201ENST00000233025 HDHD5Q9BXW7 423 aa14.57□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 POTEKPQ9BYX7 375 aa14.57□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 OR51B5Q9H339 312 aa14.57□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 FOLH1BQ9HBA9 442 aa14.57□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 ARMCX1Q9P291 453 aa14.57□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 XPR1Q9UBH6 696 aa14.57□□□□□ -0.08
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SPCS1-201ENST00000233025 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
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SPCS1-201ENST00000233025 TMPRSS11DO60235 418 aa14.56□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 LY6HO94772 140 aa14.56□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
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SPCS1-201ENST00000233025 SERPINB1P30740 379 aa14.56□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 SRP14P37108 136 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 NR4A2P43354 598 aa14.56□□□□□ -0.08
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SPCS1-201ENST00000233025 PLTPP55058 493 aa14.56□□□□□ -0.08
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SPCS1-201ENST00000233025 P2RY6Q15077 328 aa14.56□□□□□ -0.08
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SPCS1-201ENST00000233025 HDXQ7Z353 690 aa14.56□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 GGNQ86UU5 652 aa14.56□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 OR4K17Q8NGC6 315 aa14.56□□□□□ -0.08
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SPCS1-201ENST00000233025 KCTD4Q8WVF5 259 aa14.56□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP14.56□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 UBE2E3Q969T4 207 aa14.56□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 NXNL1Q96CM4 212 aa14.56□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 TMCO6Q96DC7 493 aa14.56□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 CMTM7Q96FZ5 175 aa14.56□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 SLC35A4Q96G79 324 aa14.56□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 COL21A1Q96P44 957 aa14.56□□□□□ -0.08
SPCS1-201ENST00000233025 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
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