RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640634.1

SCARB2-222, Transcript of scavenger receptor class B member 2, human

TSL 5

Gene SCARB2, Length 1,734 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SCARB2-222	ENST00000640634	IL6	P05231	212 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SCARB2-222	ENST00000640634	CCL3	P10147	92 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SCARB2-222	ENST00000640634	HOXB9	P17482	250 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
SCARB2-222	ENST00000640634	TRHR	P34981	398 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
SCARB2-222	ENST00000640634	RFC3	P40938	356 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SCARB2-222	ENST00000640634	PPIC	P45877	212 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SCARB2-222	ENST00000640634	RFX3	P48380	749 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SCARB2-222	ENST00000640634	CYB561	P49447	251 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SCARB2-222	ENST00000640634	RNF144A	P50876	292 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
SCARB2-222	ENST00000640634	KCNK10	P57789	538 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SCARB2-222	ENST00000640634	KLF10	Q13118	480 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SCARB2-222	ENST00000640634	ZNF791	Q3KP31	576 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
SCARB2-222	ENST00000640634	C6orf10	Q5SRN2	563 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SCARB2-222	ENST00000640634	CCNJ	Q5T5M9	372 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SCARB2-222	ENST00000640634	ANXA8L1	Q5VT79	327 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SCARB2-222	ENST00000640634	PRAMEF20	Q5VT98	475 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SCARB2-222	ENST00000640634	BNC2	Q6ZN30	1099 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
SCARB2-222	ENST00000640634		Q6ZS92	163 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SCARB2-222	ENST00000640634	MTDH	Q86UE4	582 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
SCARB2-222	ENST00000640634	MSRB3	Q8IXL7	192 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SCARB2-222	ENST00000640634	C10orf111	Q8N326	155 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SCARB2-222	ENST00000640634	CPSF7	Q8N684	471 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
SCARB2-222	ENST00000640634	FAM13C	Q8NE31	585 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SCARB2-222	ENST00000640634	GTF2H4	Q92759	462 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SCARB2-222	ENST00000640634	CDS1	Q92903	461 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SCARB2-222	ENST00000640634	OMA1	Q96E52	524 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SCARB2-222	ENST00000640634	WBP1	Q96G27	269 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SCARB2-222	ENST00000640634	RSRC1	Q96IZ7	334 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
SCARB2-222	ENST00000640634	SLC35A5	Q9BS91	424 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SCARB2-222	ENST00000640634	RNF32	Q9H0A6	362 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SCARB2-222	ENST00000640634	SLC25A37	Q9NYZ2	338 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SCARB2-222	ENST00000640634	PRODH2	Q9UF12	536 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SCARB2-222	ENST00000640634	BTNL2	Q9UIR0	455 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SCARB2-222	ENST00000640634	B3GNT3	Q9Y2A9	372 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SCARB2-222	ENST00000640634	NTNG1	Q9Y2I2	539 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SCARB2-222	ENST00000640634	FRG2C	A6NGY1	282 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SCARB2-222	ENST00000640634		A8MVJ9	347 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SCARB2-222	ENST00000640634	FBP2	O00757	339 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SCARB2-222	ENST00000640634	RFXANK	O14593	260 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SCARB2-222	ENST00000640634	DPM1	O60762	260 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SCARB2-222	ENST00000640634	UGT2B11	O75310	529 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SCARB2-222	ENST00000640634	SLC25A12	O75746	678 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SCARB2-222	ENST00000640634	SLITRK5	O94991	958 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SCARB2-222	ENST00000640634	BAG2	O95816	211 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SCARB2-222	ENST00000640634	DRD5	P21918	477 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SCARB2-222	ENST00000640634	GABRA3	P34903	492 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SCARB2-222	ENST00000640634	MAP3K8	P41279	467 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SCARB2-222	ENST00000640634	MAN2A2	P49641	1150 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SCARB2-222	ENST00000640634	PLCXD2	Q0VAA5	305 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SCARB2-222	ENST00000640634	ZNF169	Q14929	603 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
SCARB2-222	ENST00000640634	MAPKAPK3	Q16644	382 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SCARB2-222	ENST00000640634	EXOSC6	Q5RKV6	272 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
SCARB2-222	ENST00000640634	METTL21C	Q5VZV1	264 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SCARB2-222	ENST00000640634	TNFAIP8L2	Q6P589	184 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
SCARB2-222	ENST00000640634	ZNF621	Q6ZSS3	439 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SCARB2-222	ENST00000640634	C6orf120	Q7Z4R8	191 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SCARB2-222	ENST00000640634	GALNTL5	Q7Z4T8	443 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SCARB2-222	ENST00000640634	PIGW	Q7Z7B1	504 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SCARB2-222	ENST00000640634	ZNF843	Q8N446	348 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SCARB2-222	ENST00000640634	POU5F2	Q8N7G0	328 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SCARB2-222	ENST00000640634	SLC22A8	Q8TCC7	542 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SCARB2-222	ENST00000640634	GPR151	Q8TDV0	419 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SCARB2-222	ENST00000640634	RAB8B	Q92930	207 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SCARB2-222	ENST00000640634	SPACA9	Q96E40	222 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
SCARB2-222	ENST00000640634	RMND5B	Q96G75	393 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
SCARB2-222	ENST00000640634	TAAR6	Q96RI8	345 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SCARB2-222	ENST00000640634	CCT8L2	Q96SF2	557 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SCARB2-222	ENST00000640634	LMF2	Q9BU23	707 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
SCARB2-222	ENST00000640634	PAIP1	Q9H074	479 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
SCARB2-222	ENST00000640634	NSRP1	Q9H0G5	558 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
SCARB2-222	ENST00000640634	IL1RL2	Q9HB29	575 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SCARB2-222	ENST00000640634	C3orf14	Q9HBI5	128 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SCARB2-222	ENST00000640634	HPF1	Q9NWY4	346 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SCARB2-222	ENST00000640634	NPFFR2	Q9Y5X5	522 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SCARB2-222	ENST00000640634	EML6	Q6ZMW3	1958 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SCARB2-222	ENST00000640634	TRBV23-1	A0A0A0MS06	115 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SCARB2-222	ENST00000640634	SUSD5	O60279	629 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SCARB2-222	ENST00000640634	BCAS2	O75934	225 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
SCARB2-222	ENST00000640634	SORBS2	O94875	1100 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
SCARB2-222	ENST00000640634	CELA3A	P09093	270 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SCARB2-222	ENST00000640634	DDX5	P17844	614 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
SCARB2-222	ENST00000640634	PIGA	P37287	484 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SCARB2-222	ENST00000640634	MLLT10	P55197	1068 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SCARB2-222	ENST00000640634	PRR5	P85299	388 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SCARB2-222	ENST00000640634	INPP5J	Q15735	1006 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
SCARB2-222	ENST00000640634	ZNF766	Q5HY98	468 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SCARB2-222	ENST00000640634	SAXO2	Q658L1	398 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SCARB2-222	ENST00000640634	FIGNL1	Q6PIW4	674 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SCARB2-222	ENST00000640634	ANGPTL8	Q6UXH0	198 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SCARB2-222	ENST00000640634	RNF130	Q86XS8	419 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SCARB2-222	ENST00000640634	NATD1	Q8N6N6	113 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SCARB2-222	ENST00000640634	BCORP1	Q8N888	145 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SCARB2-222	ENST00000640634	PSD4	Q8NDX1	1056 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SCARB2-222	ENST00000640634	C17orf47	Q8NEP4	570 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SCARB2-222	ENST00000640634	OR56A1	Q8NGH5	318 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SCARB2-222	ENST00000640634	GOT1L1	Q8NHS2	421 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
SCARB2-222	ENST00000640634	SFXN5	Q8TD22	340 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SCARB2-222	ENST00000640634	TM9SF4	Q92544	642 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SCARB2-222	ENST00000640634	HOXB13	Q92826	284 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
SCARB2-222	ENST00000640634	TP53INP1	Q96A56	240 aa		10.05	□□□□□ -0.8

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