RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639525.1

SPIN3-223, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5 BASIC

Gene SPIN3, Length 3,958 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-223	ENST00000639525	C1orf216	Q8TAB5	229 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SPIN3-223	ENST00000639525	ZFPM2	Q8WW38	1151 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SPIN3-223	ENST00000639525	HHATL	Q9HCP6	504 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SPIN3-223	ENST00000639525	SLAMF7	Q9NQ25	335 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SPIN3-223	ENST00000639525	GPATCH2	Q9NW75	528 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SPIN3-223	ENST00000639525	WSB2	Q9NYS7	404 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
SPIN3-223	ENST00000639525	MARK1	Q9P0L2	795 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SPIN3-223	ENST00000639525	EXOSC1	Q9Y3B2	195 aa	Known RBP	11.07	□□□□□ -0.64
SPIN3-223	ENST00000639525	PCDHGB1	Q9Y5G3	927 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SPIN3-223	ENST00000639525	TDRD15	B5MCY1	1934 aa	Known RBP	11.07	□□□□□ -0.64
SPIN3-223	ENST00000639525	TRAV27	A0A087WT01	109 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SPIN3-223	ENST00000639525	FOXE1	O00358	373 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
SPIN3-223	ENST00000639525	HMGN4	O00479	90 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SPIN3-223	ENST00000639525	EDNRA	P25101	427 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SPIN3-223	ENST00000639525	KCNJ5	P48544	419 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SPIN3-223	ENST00000639525	TAF8	Q7Z7C8	310 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SPIN3-223	ENST00000639525	SLC16A11	Q8NCK7	471 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SPIN3-223	ENST00000639525	OR4K14	Q8NGD5	310 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SPIN3-223	ENST00000639525	DEDD2	Q8WXF8	326 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SPIN3-223	ENST00000639525	HERVK_113	Q902F9	699 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SPIN3-223	ENST00000639525	ZMYND19	Q96E35	227 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
SPIN3-223	ENST00000639525	SLC41A3	Q96GZ6	507 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SPIN3-223	ENST00000639525	LRIG1	Q96JA1	1093 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SPIN3-223	ENST00000639525	ERMAP	Q96PL5	475 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
SPIN3-223	ENST00000639525	PITX2	Q99697	317 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SPIN3-223	ENST00000639525		A0A087WUU8	490 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SPIN3-223	ENST00000639525	ZAR1L	A6NP61	321 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SPIN3-223	ENST00000639525	HR	O43593	1189 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SPIN3-223	ENST00000639525	MRPS14	O60783	128 aa	Known RBP	11.06	□□□□□ -0.64
SPIN3-223	ENST00000639525	AHCY	P23526	432 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SPIN3-223	ENST00000639525	ACVR2A	P27037	513 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SPIN3-223	ENST00000639525	ENTPD8	Q5MY95	495 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SPIN3-223	ENST00000639525	FBXO15	Q8NCQ5	510 aa	Predicted RBP	11.06	□□□□□ -0.64
SPIN3-223	ENST00000639525	GRPEL2	Q8TAA5	225 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SPIN3-223	ENST00000639525	SPACA7	Q96KW9	195 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SPIN3-223	ENST00000639525	GAL3ST4	Q96RP7	486 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SPIN3-223	ENST00000639525	GSDMC	Q9BYG8	508 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SPIN3-223	ENST00000639525	TMEM38A	Q9H6F2	299 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SPIN3-223	ENST00000639525	MED31	Q9Y3C7	131 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SPIN3-223	ENST00000639525	SBF1	O95248	1867 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SPIN3-223	ENST00000639525	MRPL19	P49406	292 aa	Known RBP	11.06	□□□□□ -0.64
SPIN3-223	ENST00000639525	PPP3R1	P63098	170 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SPIN3-223	ENST00000639525	SSX1	Q16384	188 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SPIN3-223	ENST00000639525	TP53I3	Q53FA7	332 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SPIN3-223	ENST00000639525	PRRT3	Q5FWE3	981 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SPIN3-223	ENST00000639525	OR52E1	Q8NGJ3	308 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SPIN3-223	ENST00000639525	TM9SF4	Q92544	642 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SPIN3-223	ENST00000639525	PMEPA1	Q969W9	287 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SPIN3-223	ENST00000639525	RFT1	Q96AA3	541 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SPIN3-223	ENST00000639525	PDXP	Q96GD0	296 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SPIN3-223	ENST00000639525	TXNDC15	Q96J42	360 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SPIN3-223	ENST00000639525	MS4A8	Q9BY19	250 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SPIN3-223	ENST00000639525	PPIL3	Q9H2H8	161 aa	Known RBP	11.06	□□□□□ -0.64
SPIN3-223	ENST00000639525	GALNT9	Q9HCQ5	603 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SPIN3-223	ENST00000639525	AK6	Q9Y3D8	172 aa	Known RBP	11.06	□□□□□ -0.64
SPIN3-223	ENST00000639525	GREB1	Q4ZG55	1949 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SPIN3-223	ENST00000639525	RTTN	Q86VV8	2226 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SPIN3-223	ENST00000639525	C1orf226	A1L170	272 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF670-ZNF695	F2Z2N8	137 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SPIN3-223	ENST00000639525	MEN1	O00255	615 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SPIN3-223	ENST00000639525	CSN2	P05814	226 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SPIN3-223	ENST00000639525	HOXB3	P14651	431 aa	Predicted RBP	11.06	□□□□□ -0.64
SPIN3-223	ENST00000639525	HIST1H1T	P22492	207 aa	Predicted RBP	11.06	□□□□□ -0.64
SPIN3-223	ENST00000639525	MESP2	Q0VG99	397 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SPIN3-223	ENST00000639525	MLLT11	Q13015	90 aa	Predicted RBP	11.06	□□□□□ -0.64
SPIN3-223	ENST00000639525	FGFBP1	Q14512	234 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SPIN3-223	ENST00000639525	EXOSC7	Q15024	291 aa	Known RBP	11.06	□□□□□ -0.64
SPIN3-223	ENST00000639525	NTRK2	Q16620	822 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SPIN3-223	ENST00000639525	XKRX	Q6PP77	449 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SPIN3-223	ENST00000639525	IKBIP	Q70UQ0	350 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SPIN3-223	ENST00000639525	PIAS4	Q8N2W9	510 aa	Predicted RBP	11.06	□□□□□ -0.64
SPIN3-223	ENST00000639525	TTL	Q8NG68	377 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF563	Q8TA94	476 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SPIN3-223	ENST00000639525	NKD1	Q969G9	470 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SPIN3-223	ENST00000639525	NEURL3	Q96EH8	262 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SPIN3-223	ENST00000639525	OR7D2	Q96RA2	312 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SPIN3-223	ENST00000639525	PLA2G12A	Q9BZM1	189 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SPIN3-223	ENST00000639525	SLITRK2	Q9H156	845 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SPIN3-223	ENST00000639525	RASD1	Q9Y272	281 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SPIN3-223	ENST00000639525	GRIP1	Q9Y3R0	1128 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SPIN3-223	ENST00000639525	KCNE3	Q9Y6H6	103 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SPIN3-223	ENST00000639525	PLXNA1	Q9UIW2	1896 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SPIN3-223	ENST00000639525	KIAA0355	O15063	1070 aa		11.05	□□□□□ -0.64
SPIN3-223	ENST00000639525	PIP5K1C	O60331	668 aa		11.05	□□□□□ -0.64
SPIN3-223	ENST00000639525	AIFM1	O95831	613 aa		11.05	□□□□□ -0.64
SPIN3-223	ENST00000639525	HBQ1	P09105	142 aa		11.05	□□□□□ -0.64
SPIN3-223	ENST00000639525	SHC1	P29353	583 aa		11.05	□□□□□ -0.64
SPIN3-223	ENST00000639525	RHAG	Q02094	409 aa		11.05	□□□□□ -0.64
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF33B	Q06732	778 aa		11.05	□□□□□ -0.64
SPIN3-223	ENST00000639525	CRYZ	Q08257	329 aa	Known RBP	11.05	□□□□□ -0.64
SPIN3-223	ENST00000639525	CDKN3	Q16667	212 aa		11.05	□□□□□ -0.64
SPIN3-223	ENST00000639525	FAM27D1	Q5T7N8	215 aa		11.05	□□□□□ -0.64
SPIN3-223	ENST00000639525	LCTL	Q6UWM7	567 aa		11.05	□□□□□ -0.64
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF438	Q7Z4V0	828 aa		11.05	□□□□□ -0.64
SPIN3-223	ENST00000639525	ANKRD53	Q8N9V6	530 aa		11.05	□□□□□ -0.64
SPIN3-223	ENST00000639525	BBS1	Q8NFJ9	593 aa		11.05	□□□□□ -0.64
SPIN3-223	ENST00000639525	TMEM255B	Q8WV15	326 aa		11.05	□□□□□ -0.64
SPIN3-223	ENST00000639525	AMDHD1	Q96NU7	426 aa		11.05	□□□□□ -0.64
SPIN3-223	ENST00000639525	ALG8	Q9BVK2	526 aa		11.05	□□□□□ -0.64
SPIN3-223	ENST00000639525	PPIE	Q9UNP9	301 aa	Known RBP	11.05	□□□□□ -0.64

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