RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635997.1

NEDD4L-238, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 5 BASIC

Gene NEDD4L, Length 4,402 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4L-238	ENST00000635997	OR4K13	Q8NH42	304 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NEDD4L-238	ENST00000635997	FANK1	Q8TC84	345 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NEDD4L-238	ENST00000635997	SLC37A2	Q8TED4	501 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NEDD4L-238	ENST00000635997	RAB2B	Q8WUD1	216 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NEDD4L-238	ENST00000635997	MOAP1	Q96BY2	351 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NEDD4L-238	ENST00000635997	HDAC8	Q9BY41	377 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NEDD4L-238	ENST00000635997	HYKK	A2RU49	373 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NEDD4L-238	ENST00000635997	FABP12	A6NFH5	140 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NEDD4L-238	ENST00000635997	SCRG1	O75711	98 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NEDD4L-238	ENST00000635997	NPRL3	Q12980	569 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NEDD4L-238	ENST00000635997	ARHGAP19	Q14CB8	494 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NEDD4L-238	ENST00000635997	C14orf28	Q4W4Y0	310 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NEDD4L-238	ENST00000635997	CLEC14A	Q86T13	490 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NEDD4L-238	ENST00000635997	DTX3	Q8N9I9	347 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NEDD4L-238	ENST00000635997	CADM4	Q8NFZ8	388 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NEDD4L-238	ENST00000635997	OR6C1	Q96RD1	312 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NEDD4L-238	ENST00000635997	QRSL1	Q9H0R6	528 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
NEDD4L-238	ENST00000635997	TEX10	Q9NXF1	929 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
NEDD4L-238	ENST00000635997	FBXO9	Q9UK97	447 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
NEDD4L-238	ENST00000635997	RABL2B	Q9UNT1	228 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NEDD4L-238	ENST00000635997	AP1M2	Q9Y6Q5	423 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NEDD4L-238	ENST00000635997	UBE2QL1	A1L167	161 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NEDD4L-238	ENST00000635997	WWP2	O00308	870 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NEDD4L-238	ENST00000635997	AKAP8	O43823	692 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
NEDD4L-238	ENST00000635997	SERPINA3	P01011	423 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NEDD4L-238	ENST00000635997	IGLV3-27	P01718	113 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NEDD4L-238	ENST00000635997	C8B	P07358	591 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NEDD4L-238	ENST00000635997	GGT1	P19440	569 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NEDD4L-238	ENST00000635997	SDC2	P34741	201 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NEDD4L-238	ENST00000635997	SELPLG	Q14242	412 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NEDD4L-238	ENST00000635997	FCRLB	Q6BAA4	426 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NEDD4L-238	ENST00000635997	LIN54	Q6MZP7	749 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NEDD4L-238	ENST00000635997	ASB18	Q6ZVZ8	466 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NEDD4L-238	ENST00000635997	C1orf216	Q8TAB5	229 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NEDD4L-238	ENST00000635997	TMEM234	Q8WY98	164 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NEDD4L-238	ENST00000635997	PDLIM5	Q96HC4	596 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
NEDD4L-238	ENST00000635997	LRR1	Q96L50	414 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NEDD4L-238	ENST00000635997	PCED1A	Q9H1Q7	454 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NEDD4L-238	ENST00000635997	CLEC4M	Q9H2X3	399 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
NEDD4L-238	ENST00000635997	TBC1D29	Q9UFV1	150 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NEDD4L-238	ENST00000635997	ZNF221	Q9UK13	617 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NEDD4L-238	ENST00000635997	ACAD8	Q9UKU7	415 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NEDD4L-238	ENST00000635997	TNFSF14	O43557	240 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NEDD4L-238	ENST00000635997	UGDH	O60701	494 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NEDD4L-238	ENST00000635997	STS	P08842	583 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NEDD4L-238	ENST00000635997	HSD17B1	P14061	328 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NEDD4L-238	ENST00000635997	PYCR1	P32322	319 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NEDD4L-238	ENST00000635997	CDKL4	Q5MAI5	379 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NEDD4L-238	ENST00000635997	FAM111B	Q6SJ93	734 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NEDD4L-238	ENST00000635997	ZNF101	Q8IZC7	436 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NEDD4L-238	ENST00000635997	PIK3R3	Q92569	461 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NEDD4L-238	ENST00000635997	NSMAF	Q92636	917 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NEDD4L-238	ENST00000635997	COL25A1	Q9BXS0	654 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
NEDD4L-238	ENST00000635997	ACTRT3	Q9BYD9	372 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NEDD4L-238	ENST00000635997	FGF21	Q9NSA1	209 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NEDD4L-238	ENST00000635997	SMOX	Q9NWM0	555 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NEDD4L-238	ENST00000635997		A0A1W2PPL8	197 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NEDD4L-238	ENST00000635997	ECD	O95905	644 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
NEDD4L-238	ENST00000635997	F10	P00742	488 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NEDD4L-238	ENST00000635997	CHRNB1	P11230	501 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NEDD4L-238	ENST00000635997	RPL34	P49207	117 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
NEDD4L-238	ENST00000635997	VBP1	P61758	197 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NEDD4L-238	ENST00000635997	GALK2	Q01415	458 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NEDD4L-238	ENST00000635997	C18orf63	Q68DL7	685 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NEDD4L-238	ENST00000635997	TMEM92	Q6UXU6	159 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NEDD4L-238	ENST00000635997	OR2T11	Q8NH01	316 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NEDD4L-238	ENST00000635997	GTF2H4	Q92759	462 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NEDD4L-238	ENST00000635997	OSTF1	Q92882	214 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NEDD4L-238	ENST00000635997	LOXL2	Q9Y4K0	774 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NEDD4L-238	ENST00000635997	OR2B6	P58173	313 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NEDD4L-238	ENST00000635997	PPP2CB	P62714	309 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NEDD4L-238	ENST00000635997	PPP2CA	P67775	309 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NEDD4L-238	ENST00000635997	ZNF750	Q32MQ0	723 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NEDD4L-238	ENST00000635997	RBM48	Q5RL73	367 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
NEDD4L-238	ENST00000635997	C6orf141	Q5SZD1	244 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NEDD4L-238	ENST00000635997	SLCO4C1	Q6ZQN7	724 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NEDD4L-238	ENST00000635997	KCNN1	Q92952	543 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NEDD4L-238	ENST00000635997	GAL3ST3	Q96A11	431 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NEDD4L-238	ENST00000635997	FER1L6-AS2	Q96M78	137 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NEDD4L-238	ENST00000635997	CCNL2	Q96S94	520 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
NEDD4L-238	ENST00000635997	SERINC2	Q96SA4	455 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NEDD4L-238	ENST00000635997	TMEM121B	Q9BXQ6	578 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
NEDD4L-238	ENST00000635997	BTNL2	Q9UIR0	455 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NEDD4L-238	ENST00000635997	ASB1	Q9Y576	335 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NEDD4L-238	ENST00000635997	DNMT3A	Q9Y6K1	912 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
NEDD4L-238	ENST00000635997	C17orf113	A0A1B0GUU1	675 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NEDD4L-238	ENST00000635997	CDRT1	O95170	752 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NEDD4L-238	ENST00000635997	HK1	P19367	917 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NEDD4L-238	ENST00000635997	BCKDHB	P21953	392 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NEDD4L-238	ENST00000635997	OR1D5	P58170	312 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NEDD4L-238	ENST00000635997	AKAP6	Q13023	2319 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NEDD4L-238	ENST00000635997	GAS6	Q14393	721 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NEDD4L-238	ENST00000635997	CD300LG	Q6UXG3	332 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NEDD4L-238	ENST00000635997	SLC22A16	Q86VW1	577 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NEDD4L-238	ENST00000635997	OR2T33	Q8NG76	320 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NEDD4L-238	ENST00000635997	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NEDD4L-238	ENST00000635997	BRF2	Q9HAW0	419 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NEDD4L-238	ENST00000635997	FSCN3	Q9NQT6	498 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NEDD4L-238	ENST00000635997	ERVK-18	Q9QC07	812 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NEDD4L-238	ENST00000635997	ALPK2	Q86TB3	2170 aa		13.47	□□□□□ -0.25

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.5 ms