RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620854.4

NEDD9-216, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 9, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NEDD9, Length 4,086 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9-216ENST00000620854 SLC30A6Q6NXT4 461 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD9-216ENST00000620854 VITQ6UXI7 678 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD9-216ENST00000620854 TPRG1Q6ZUI0 275 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD9-216ENST00000620854 ZER1Q7Z7L7 766 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD9-216ENST00000620854 SYT9Q86SS6 491 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD9-216ENST00000620854 KLBQ86Z14 1044 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD9-216ENST00000620854 OXR1Q8N573 874 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD9-216ENST00000620854 SAMD12Q8N8I0 201 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD9-216ENST00000620854 ZNF680Q8NEM1 530 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD9-216ENST00000620854 GPR32P1Q8NGA4 272 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD9-216ENST00000620854 OR11H4Q8NGC9 324 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD9-216ENST00000620854 CEP76Q8TAP6 659 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD9-216ENST00000620854 PIGXQ8TBF5 258 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD9-216ENST00000620854 C16orf78Q8WTQ4 265 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD9-216ENST00000620854 ZFPM2Q8WW38 1151 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD9-216ENST00000620854 IFT27Q9BW83 186 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD9-216ENST00000620854 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD9-216ENST00000620854 PHF11Q9UIL8 331 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD9-216ENST00000620854 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD9-216ENST00000620854 LRRC72A6NJI9 287 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD9-216ENST00000620854 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
NEDD9-216ENST00000620854 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
NEDD9-216ENST00000620854 PRMT3O60678 531 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD9-216ENST00000620854 RECKO95980 971 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD9-216ENST00000620854 CD3GP09693 182 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD9-216ENST00000620854 ELK1P19419 428 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD9-216ENST00000620854 MMP11P24347 488 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD9-216ENST00000620854 LMAN2Q12907 356 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD9-216ENST00000620854 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD9-216ENST00000620854 GGTA1PQ4G0N0 100 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD9-216ENST00000620854 PRSS58Q8IYP2 241 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD9-216ENST00000620854 TET1Q8NFU7 2136 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD9-216ENST00000620854 HMGB4Q8WW32 186 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD9-216ENST00000620854 SORCS1Q8WY21 1168 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD9-216ENST00000620854 LMLNQ96KR4 655 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD9-216ENST00000620854 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
NEDD9-216ENST00000620854 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
NEDD9-216ENST00000620854 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD9-216ENST00000620854 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD9-216ENST00000620854 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
NEDD9-216ENST00000620854 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD9-216ENST00000620854 DAPL1A0PJW8 107 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD9-216ENST00000620854 POM121CA8CG34 1229 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD9-216ENST00000620854 B8ZZF3 427 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD9-216ENST00000620854 CHST10O43529 356 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD9-216ENST00000620854 PI15O43692 258 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD9-216ENST00000620854 IFNGP01579 166 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD9-216ENST00000620854 HLA-DMAP28067 261 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD9-216ENST00000620854 IMPA1P29218 277 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD9-216ENST00000620854 PKLRP30613 574 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD9-216ENST00000620854 VIPR2P41587 438 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD9-216ENST00000620854 SOX9P48436 509 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD9-216ENST00000620854 CCR6P51684 374 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD9-216ENST00000620854 ILKQ13418 452 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD9-216ENST00000620854 GPR176Q14439 515 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD9-216ENST00000620854 TAF13Q15543 124 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD9-216ENST00000620854 GPR68Q15743 365 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD9-216ENST00000620854 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
NEDD9-216ENST00000620854 KLHL22Q53GT1 634 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD9-216ENST00000620854 TMEM240Q5SV17 173 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD9-216ENST00000620854 FAAH2Q6GMR7 532 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD9-216ENST00000620854 HSDL2Q6YN16 418 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD9-216ENST00000620854 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD9-216ENST00000620854 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD9-216ENST00000620854 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD9-216ENST00000620854 CREB3L2Q70SY1 520 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD9-216ENST00000620854 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD9-216ENST00000620854 TCTE3Q8IZS6 198 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD9-216ENST00000620854 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD9-216ENST00000620854 CHTF18Q8WVB6 975 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD9-216ENST00000620854 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
NEDD9-216ENST00000620854 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD9-216ENST00000620854 KLHL21Q9UJP4 597 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD9-216ENST00000620854 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD9-216ENST00000620854 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
NEDD9-216ENST00000620854 RIIAD1A6NNX1 92 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD9-216ENST00000620854 HIDE1A8MVS5 230 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD9-216ENST00000620854 GFYI3L273 518 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD9-216ENST00000620854 GPR37L1O60883 481 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD9-216ENST00000620854 SLC22A5O76082 557 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD9-216ENST00000620854 ADAP00813 363 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD9-216ENST00000620854 FURINP09958 794 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD9-216ENST00000620854 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD9-216ENST00000620854 CBSLP0DN79 551 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD9-216ENST00000620854 ACP5P13686 325 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD9-216ENST00000620854 ITGA3P26006 1051 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD9-216ENST00000620854 ITGB7P26010 798 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD9-216ENST00000620854 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
NEDD9-216ENST00000620854 CBSP35520 551 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD9-216ENST00000620854 MTNR1AP48039 350 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD9-216ENST00000620854 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP6.55□□□□□ -1.36
NEDD9-216ENST00000620854 ERVFC1P60507 584 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD9-216ENST00000620854 SLC3A1Q07837 685 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD9-216ENST00000620854 C19orf57Q0VDD7 668 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD9-216ENST00000620854 BTN1A1Q13410 526 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD9-216ENST00000620854 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
NEDD9-216ENST00000620854 UBXN2BQ14CS0 331 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD9-216ENST00000620854 PLK5Q496M5 336 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD9-216ENST00000620854 ZBTB37Q5TC79 503 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD9-216ENST00000620854 ZNF767PQ75MW2 155 aa6.55□□□□□ -1.36
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