RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612229.4

PTPRT-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 11,285 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-209ENST00000612229 SNHG28P0DPA3 235 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 BMXP51813 675 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 KEAP1Q14145 624 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 FAM58AQ8N1B3 248 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 KDM1BQ8NB78 822 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 C3orf58Q8NDZ4 430 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 ABHD11Q8NFV4 315 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 OR2T4Q8NH00 348 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 DCUN1D4Q92564 292 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 BCL9O00512 1426 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 HK3P52790 923 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 KCNE4Q8WWG9 221 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 MED30Q96HR3 178 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 SEC22CQ9BRL7 303 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 OR51J1Q9H342 316 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 SACM1LQ9NTJ5 587 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 SMOXQ9NWM0 555 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 HAS3O00219 553 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 SGCEO43556 437 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 MMP20O60882 483 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 EPOP01588 193 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 DAOAP59103 153 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 MAP4K2Q12851 820 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 GRIN2CQ14957 1233 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 DACT2Q5SW24 774 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 AWAT2Q6E213 333 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM225Q6GV28 225 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM200AQ86VY9 491 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 PLPP5Q8NEB5 264 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 OR5AK3PQ8NH89 298 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 TFAP2BQ92481 460 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 AKT1S1Q96B36 256 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 CENPMQ9NSP4 180 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 CPA4Q9UI42 421 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 OPRL1P41146 370 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 NDUFV1P49821 464 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 STC1P52823 247 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 CRMP1Q14194 572 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 TSSK4Q6SA08 328 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 SSX7Q7RTT5 188 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 NETO2Q8NC67 525 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF461Q8TAF7 563 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 PTERQ96BW5 349 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa6.65□□□□□ -1.35
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PTPRT-209ENST00000612229 A0A1W2PPL8 197 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 B4GALT5O43286 388 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 AKAIN1P0CW23 69 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 FGFBP1Q14512 234 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 TAC4Q86UU9 113 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 SORCS2Q96PQ0 1159 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF442Q9H7R0 627 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 SLC2A8Q9NY64 477 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 CACNG2Q9Y698 323 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 CCDC85CA6NKD9 419 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 CH25HO95992 272 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 UGT2B7P16662 529 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 OR1D2P34982 312 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 DAP3P51398 398 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 TGFBR3Q03167 851 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 DUSP7Q16829 419 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 STEAP4Q687X5 459 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 CNKSR3Q6P9H4 555 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa6.65□□□□□ -1.35
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PTPRT-209ENST00000612229 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 CERS4Q9HA82 394 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 GCM1Q9NP62 436 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 OARD1Q9Y530 152 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 MAST2Q6P0Q8 1798 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 ARHGEF15O94989 841 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 MAKP20794 623 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 BCKDHBP21953 392 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 BPIFA2Q96DR5 249 aa6.65□□□□□ -1.35
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