RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575783.5

CTDNEP1-211, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 876 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-211ENST00000575783 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa14.52□□□□□ -0.09
CTDNEP1-211ENST00000575783 CES1P1Q9UKY3 287 aa14.52□□□□□ -0.09
CTDNEP1-211ENST00000575783 SNX8Q9Y5X2 465 aa14.52□□□□□ -0.09
CTDNEP1-211ENST00000575783 AP4B1Q9Y6B7 739 aa14.52□□□□□ -0.09
CTDNEP1-211ENST00000575783 EXPH5Q8NEV8 1989 aa14.51□□□□□ -0.09
CTDNEP1-211ENST00000575783 SHISA8B8ZZ34 492 aa14.51□□□□□ -0.09
CTDNEP1-211ENST00000575783 RAMP1O60894 148 aa14.51□□□□□ -0.09
CTDNEP1-211ENST00000575783 NTN1O95631 604 aa14.51□□□□□ -0.09
CTDNEP1-211ENST00000575783 CT45A8P0DMV1 189 aa14.51□□□□□ -0.09
CTDNEP1-211ENST00000575783 CT45A9P0DMV2 189 aa14.51□□□□□ -0.09
CTDNEP1-211ENST00000575783 IL32P24001 234 aa14.51□□□□□ -0.09
CTDNEP1-211ENST00000575783 IGFBP5P24593 272 aa14.51□□□□□ -0.09
CTDNEP1-211ENST00000575783 ADH6P28332 368 aa14.51□□□□□ -0.09
CTDNEP1-211ENST00000575783 FNTAP49354 379 aa14.51□□□□□ -0.09
CTDNEP1-211ENST00000575783 C21orf58P58505 322 aa14.51□□□□□ -0.09
CTDNEP1-211ENST00000575783 CT45A2Q5DJT8 189 aa14.51□□□□□ -0.09
CTDNEP1-211ENST00000575783 FAM120AOSQ5T036 256 aa14.51□□□□□ -0.09
CTDNEP1-211ENST00000575783 LGSNQ5TDP6 509 aa14.51□□□□□ -0.09
CTDNEP1-211ENST00000575783 FIGNL1Q6PIW4 674 aa14.51□□□□□ -0.09
CTDNEP1-211ENST00000575783 UBTD2Q8WUN7 234 aa14.51□□□□□ -0.09
CTDNEP1-211ENST00000575783 HSD17B8Q92506 261 aa14.51□□□□□ -0.09
CTDNEP1-211ENST00000575783 LRRC39Q96DD0 335 aa14.51□□□□□ -0.09
CTDNEP1-211ENST00000575783 SERPINI1Q99574 410 aa14.51□□□□□ -0.09
CTDNEP1-211ENST00000575783 FAIMQ9NVQ4 179 aa14.51□□□□□ -0.09
CTDNEP1-211ENST00000575783 FBXO34Q9NWN3 711 aa14.51□□□□□ -0.09
CTDNEP1-211ENST00000575783 RNF11Q9Y3C5 154 aa14.51□□□□□ -0.09
CTDNEP1-211ENST00000575783 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa14.51□□□□□ -0.09
CTDNEP1-211ENST00000575783 PRR14LQ5THK1 2151 aa14.5□□□□□ -0.09
CTDNEP1-211ENST00000575783 DPRXA6NFQ7 191 aa14.5□□□□□ -0.09
CTDNEP1-211ENST00000575783 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CTDNEP1-211ENST00000575783 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CTDNEP1-211ENST00000575783 GMFGO60234 142 aa14.5□□□□□ -0.09
CTDNEP1-211ENST00000575783 OPN1LWP04000 364 aa14.5□□□□□ -0.09
CTDNEP1-211ENST00000575783 PGRP06401 933 aa14.5□□□□□ -0.09
CTDNEP1-211ENST00000575783 PYGBP11216 843 aa14.5□□□□□ -0.09
CTDNEP1-211ENST00000575783 SLC25A16P16260 332 aa14.5□□□□□ -0.09
CTDNEP1-211ENST00000575783 EVI2BP34910 448 aa14.5□□□□□ -0.09
CTDNEP1-211ENST00000575783 MAPK12P53778 367 aa14.5□□□□□ -0.09
CTDNEP1-211ENST00000575783 PNLIPRP2P54317 469 aa14.5□□□□□ -0.09
CTDNEP1-211ENST00000575783 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CTDNEP1-211ENST00000575783 GANABQ14697 944 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CTDNEP1-211ENST00000575783 ELOA3BQ3SY89 546 aa14.5□□□□□ -0.09
CTDNEP1-211ENST00000575783 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CTDNEP1-211ENST00000575783 MFSD12Q6NUT3 480 aa14.5□□□□□ -0.09
CTDNEP1-211ENST00000575783 C12orf54Q6X4T0 127 aa14.5□□□□□ -0.09
CTDNEP1-211ENST00000575783 ISCA2Q86U28 154 aa14.5□□□□□ -0.09
CTDNEP1-211ENST00000575783 GGNQ86UU5 652 aa14.5□□□□□ -0.09
CTDNEP1-211ENST00000575783 DTX2Q86UW9 622 aa14.5□□□□□ -0.09
CTDNEP1-211ENST00000575783 ZNF525Q8N782 197 aa14.5□□□□□ -0.09
CTDNEP1-211ENST00000575783 CEP112Q8N8E3 955 aa14.5□□□□□ -0.09
CTDNEP1-211ENST00000575783 FBXO36Q8NEA4 188 aa14.5□□□□□ -0.09
CTDNEP1-211ENST00000575783 ELOA3Q8NG57 546 aa14.5□□□□□ -0.09
CTDNEP1-211ENST00000575783 OR4N2Q8NGD1 307 aa14.5□□□□□ -0.09
CTDNEP1-211ENST00000575783 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CTDNEP1-211ENST00000575783 WDR20Q8TBZ3 569 aa14.5□□□□□ -0.09
CTDNEP1-211ENST00000575783 DUSP19Q8WTR2 217 aa14.5□□□□□ -0.09
CTDNEP1-211ENST00000575783 RNF138Q8WVD3 245 aa14.5□□□□□ -0.09
CTDNEP1-211ENST00000575783 KLHL29Q96CT2 875 aa14.5□□□□□ -0.09
CTDNEP1-211ENST00000575783 PBKQ96KB5 322 aa14.5□□□□□ -0.09
CTDNEP1-211ENST00000575783 UBXN10Q96LJ8 280 aa14.5□□□□□ -0.09
CTDNEP1-211ENST00000575783 BTBD9Q96Q07 612 aa14.5□□□□□ -0.09
CTDNEP1-211ENST00000575783 CACNG6Q9BXT2 260 aa14.5□□□□□ -0.09
CTDNEP1-211ENST00000575783 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CTDNEP1-211ENST00000575783 ZBTB26Q9HCK0 441 aa14.5□□□□□ -0.09
CTDNEP1-211ENST00000575783 SDHAF3Q9NRP4 125 aa14.5□□□□□ -0.09
CTDNEP1-211ENST00000575783 XPR1Q9UBH6 696 aa14.5□□□□□ -0.09
CTDNEP1-211ENST00000575783 PSME2Q9UL46 239 aa14.5□□□□□ -0.09
CTDNEP1-211ENST00000575783 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CTDNEP1-211ENST00000575783 KCNS2Q9ULS6 477 aa14.5□□□□□ -0.09
CTDNEP1-211ENST00000575783 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa14.5□□□□□ -0.09
CTDNEP1-211ENST00000575783 ALPK2Q86TB3 2170 aa14.49□□□□□ -0.09
CTDNEP1-211ENST00000575783 C1orf226A1L170 272 aa14.49□□□□□ -0.09
CTDNEP1-211ENST00000575783 SLC35F4A4IF30 521 aa14.49□□□□□ -0.09
CTDNEP1-211ENST00000575783 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CTDNEP1-211ENST00000575783 SEMA3DO95025 777 aa14.49□□□□□ -0.09
CTDNEP1-211ENST00000575783 SYNGR4O95473 234 aa14.49□□□□□ -0.09
CTDNEP1-211ENST00000575783 CFPP27918 469 aa14.49□□□□□ -0.09
CTDNEP1-211ENST00000575783 ALDH9A1P49189 494 aa14.49□□□□□ -0.09
CTDNEP1-211ENST00000575783 ARL4CP56559 192 aa14.49□□□□□ -0.09
CTDNEP1-211ENST00000575783 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CTDNEP1-211ENST00000575783 IRF9Q00978 393 aa14.49□□□□□ -0.09
CTDNEP1-211ENST00000575783 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CTDNEP1-211ENST00000575783 AGAP6Q5VW22 663 aa14.49□□□□□ -0.09
CTDNEP1-211ENST00000575783 NPSR1Q6W5P4 371 aa14.49□□□□□ -0.09
CTDNEP1-211ENST00000575783 PAGE2Q7Z2X7 111 aa14.49□□□□□ -0.09
CTDNEP1-211ENST00000575783 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
CTDNEP1-211ENST00000575783 OR10D3Q8NH80 312 aa14.49□□□□□ -0.09
CTDNEP1-211ENST00000575783 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CTDNEP1-211ENST00000575783 FAM168AQ92567 244 aa14.49□□□□□ -0.09
CTDNEP1-211ENST00000575783 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa14.49□□□□□ -0.09
CTDNEP1-211ENST00000575783 GRIP2Q9C0E4 1043 aa14.49□□□□□ -0.09
CTDNEP1-211ENST00000575783 PFDN4Q9NQP4 134 aa14.49□□□□□ -0.09
CTDNEP1-211ENST00000575783 AHSPQ9NZD4 102 aa14.49□□□□□ -0.09
CTDNEP1-211ENST00000575783 TXNDC16Q9P2K2 825 aa14.49□□□□□ -0.09
CTDNEP1-211ENST00000575783 STOML1Q9UBI4 398 aa14.49□□□□□ -0.09
CTDNEP1-211ENST00000575783 OR10H1Q9Y4A9 318 aa14.49□□□□□ -0.09
CTDNEP1-211ENST00000575783 TENM1Q9UKZ4 2725 aa14.49□□□□□ -0.09
CTDNEP1-211ENST00000575783 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa14.48□□□□□ -0.09
CTDNEP1-211ENST00000575783 CXCL13O43927 109 aa14.48□□□□□ -0.09
CTDNEP1-211ENST00000575783 KERAO60938 352 aa14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.1 ms