RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572680.1

NEURL4-208, Transcript of neuralized E3 ubiquitin protein ligase 4, human

TSL 2

Gene NEURL4, Length 819 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEURL4-208	ENST00000572680	CLK3	P49761	638 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
NEURL4-208	ENST00000572680	ANXA8L1	Q5VT79	327 aa		13.9	□□□□□ -0.18
NEURL4-208	ENST00000572680	FNDC7	Q5VTL7	733 aa		13.9	□□□□□ -0.18
NEURL4-208	ENST00000572680	OR4F3	Q6IEY1	312 aa		13.9	□□□□□ -0.18
NEURL4-208	ENST00000572680	BHLHB9	Q6PI77	547 aa		13.9	□□□□□ -0.18
NEURL4-208	ENST00000572680	CD163	Q86VB7	1156 aa		13.9	□□□□□ -0.18
NEURL4-208	ENST00000572680	SFXN5	Q8TD22	340 aa		13.9	□□□□□ -0.18
NEURL4-208	ENST00000572680	ACTRT2	Q8TDY3	377 aa		13.9	□□□□□ -0.18
NEURL4-208	ENST00000572680	PIK3R3	Q92569	461 aa		13.9	□□□□□ -0.18
NEURL4-208	ENST00000572680	JADE3	Q92613	823 aa		13.9	□□□□□ -0.18
NEURL4-208	ENST00000572680	SARAF	Q96BY9	339 aa		13.9	□□□□□ -0.18
NEURL4-208	ENST00000572680	RMND5B	Q96G75	393 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
NEURL4-208	ENST00000572680	MAEL	Q96JY0	434 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
NEURL4-208	ENST00000572680	CXorf36	Q9H7Y0	433 aa		13.9	□□□□□ -0.18
NEURL4-208	ENST00000572680	GALNT9	Q9HCQ5	603 aa		13.9	□□□□□ -0.18
NEURL4-208	ENST00000572680	MEMO1	Q9Y316	297 aa		13.9	□□□□□ -0.18
NEURL4-208	ENST00000572680	WIF1	Q9Y5W5	379 aa		13.9	□□□□□ -0.18
NEURL4-208	ENST00000572680	USH1C	Q9Y6N9	552 aa		13.9	□□□□□ -0.18
NEURL4-208	ENST00000572680	GXYLT2	A0PJZ3	443 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NEURL4-208	ENST00000572680		E9PBE3	544 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NEURL4-208	ENST00000572680		E9PLN8	166 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NEURL4-208	ENST00000572680	ANKRD28	O15084	1053 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NEURL4-208	ENST00000572680	ZG16	O60844	167 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NEURL4-208	ENST00000572680	DIAPH2	O60879	1101 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NEURL4-208	ENST00000572680	SOX30	O94993	753 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NEURL4-208	ENST00000572680	HMGN2	P05204	90 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
NEURL4-208	ENST00000572680	HPN	P05981	417 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NEURL4-208	ENST00000572680	ACP2	P11117	423 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NEURL4-208	ENST00000572680	IDO1	P14902	403 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NEURL4-208	ENST00000572680	PTPN6	P29350	595 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NEURL4-208	ENST00000572680	S100A3	P33764	101 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NEURL4-208	ENST00000572680	EVI2B	P34910	448 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NEURL4-208	ENST00000572680	SOAT1	P35610	550 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NEURL4-208	ENST00000572680	HBA1	P69905	142 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NEURL4-208	ENST00000572680	TP53BP2	Q13625	1128 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NEURL4-208	ENST00000572680	LASP1	Q14847	261 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
NEURL4-208	ENST00000572680	SLC9B1	Q4ZJI4	515 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NEURL4-208	ENST00000572680	RPTN	Q6XPR3	784 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NEURL4-208	ENST00000572680	SLC16A11	Q8NCK7	471 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NEURL4-208	ENST00000572680	NEIL3	Q8TAT5	605 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NEURL4-208	ENST00000572680	FBXO30	Q8TB52	745 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NEURL4-208	ENST00000572680	CHMP6	Q96FZ7	201 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NEURL4-208	ENST00000572680	C16orf58	Q96GQ5	468 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NEURL4-208	ENST00000572680	CCDC120	Q96HB5	630 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NEURL4-208	ENST00000572680	PHF12	Q96QT6	1004 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NEURL4-208	ENST00000572680	STAC	Q99469	402 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NEURL4-208	ENST00000572680	ZBTB18	Q99592	522 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NEURL4-208	ENST00000572680	VKORC1	Q9BQB6	163 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NEURL4-208	ENST00000572680	YIPF4	Q9BSR8	244 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NEURL4-208	ENST00000572680	ACTRT3	Q9BYD9	372 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NEURL4-208	ENST00000572680	SLC6A15	Q9H2J7	730 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NEURL4-208	ENST00000572680	UBQLN3	Q9H347	655 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NEURL4-208	ENST00000572680	TP63	Q9H3D4	680 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
NEURL4-208	ENST00000572680	SDHAF3	Q9NRP4	125 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NEURL4-208	ENST00000572680	GIN1	Q9NXP7	522 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NEURL4-208	ENST00000572680	ACAD8	Q9UKU7	415 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NEURL4-208	ENST00000572680	FAF1	Q9UNN5	650 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
NEURL4-208	ENST00000572680	ABCG2	Q9UNQ0	655 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NEURL4-208	ENST00000572680	GPR45	Q9Y5Y3	372 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NEURL4-208	ENST00000572680	PRSS51	A0A1B0GVH4	220 aa		13.88	□□□□□ -0.19
NEURL4-208	ENST00000572680	ZNF195	O14628	629 aa		13.88	□□□□□ -0.19
NEURL4-208	ENST00000572680	CBR3	O75828	277 aa		13.88	□□□□□ -0.19
NEURL4-208	ENST00000572680	TGDS	O95455	350 aa		13.88	□□□□□ -0.19
NEURL4-208	ENST00000572680	TRPC1	P48995	793 aa		13.88	□□□□□ -0.19
NEURL4-208	ENST00000572680	SMS	P52788	366 aa		13.88	□□□□□ -0.19
NEURL4-208	ENST00000572680	NME5	P56597	212 aa		13.88	□□□□□ -0.19
NEURL4-208	ENST00000572680	WNT3	P56703	355 aa		13.88	□□□□□ -0.19
NEURL4-208	ENST00000572680	UFM1	P61960	85 aa		13.88	□□□□□ -0.19
NEURL4-208	ENST00000572680	DUSP5	Q16690	384 aa		13.88	□□□□□ -0.19
NEURL4-208	ENST00000572680	GSTA3	Q16772	222 aa		13.88	□□□□□ -0.19
NEURL4-208	ENST00000572680	FAM174B	Q3ZCQ3	159 aa		13.88	□□□□□ -0.19
NEURL4-208	ENST00000572680	GXYLT1	Q4G148	440 aa		13.88	□□□□□ -0.19
NEURL4-208	ENST00000572680	SPANXN4	Q5MJ08	99 aa		13.88	□□□□□ -0.19
NEURL4-208	ENST00000572680	WLS	Q5T9L3	541 aa		13.88	□□□□□ -0.19
NEURL4-208	ENST00000572680	CDC73	Q6P1J9	531 aa		13.88	□□□□□ -0.19
NEURL4-208	ENST00000572680	ACAD11	Q709F0	780 aa		13.88	□□□□□ -0.19
NEURL4-208	ENST00000572680	MAVS	Q7Z434	540 aa		13.88	□□□□□ -0.19
NEURL4-208	ENST00000572680	PLCZ1	Q86YW0	608 aa		13.88	□□□□□ -0.19
NEURL4-208	ENST00000572680	CLECL1	Q8IZS7	167 aa		13.88	□□□□□ -0.19
NEURL4-208	ENST00000572680	COX18	Q8N8Q8	333 aa		13.88	□□□□□ -0.19
NEURL4-208	ENST00000572680	OR4A15	Q8NGL6	344 aa		13.88	□□□□□ -0.19
NEURL4-208	ENST00000572680	RNF138	Q8WVD3	245 aa		13.88	□□□□□ -0.19
NEURL4-208	ENST00000572680	MAGEB18	Q96M61	343 aa		13.88	□□□□□ -0.19
NEURL4-208	ENST00000572680	PIGU	Q9H490	435 aa		13.88	□□□□□ -0.19
NEURL4-208	ENST00000572680	SLCO1B3	Q9NPD5	702 aa		13.88	□□□□□ -0.19
NEURL4-208	ENST00000572680	DUSP22	Q9NRW4	184 aa		13.88	□□□□□ -0.19
NEURL4-208	ENST00000572680	FAM120C	Q9NX05	1096 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
NEURL4-208	ENST00000572680	USP9X	Q93008	2570 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
NEURL4-208	ENST00000572680	ICE1	Q9Y2F5	2266 aa		13.87	□□□□□ -0.19
NEURL4-208	ENST00000572680	UBD	O15205	165 aa		13.87	□□□□□ -0.19
NEURL4-208	ENST00000572680	SCO2	O43819	266 aa		13.87	□□□□□ -0.19
NEURL4-208	ENST00000572680	FADS1	O60427	444 aa		13.87	□□□□□ -0.19
NEURL4-208	ENST00000572680	UTS2	O95399	124 aa		13.87	□□□□□ -0.19
NEURL4-208	ENST00000572680	CPSF4	O95639	269 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
NEURL4-208	ENST00000572680	LCN1	P31025	176 aa		13.87	□□□□□ -0.19
NEURL4-208	ENST00000572680	GCK	P35557	465 aa		13.87	□□□□□ -0.19
NEURL4-208	ENST00000572680	GAS1	P54826	345 aa		13.87	□□□□□ -0.19
NEURL4-208	ENST00000572680	POU6F2	P78424	691 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
NEURL4-208	ENST00000572680	PDCD4	Q53EL6	469 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
NEURL4-208	ENST00000572680	EXOSC6	Q5RKV6	272 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19

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