RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560631.1

RNF31-222, Transcript of ring finger protein 31, human

TSL 2

Gene RNF31, Length 320 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF31-222	ENST00000560631	TMEM41A	Q96HV5	264 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	MAGED4	Q96JG8	741 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	GPR137	Q96N19	417 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	OR52E6	Q96RD3	313 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	NODAL	Q96S42	347 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	ACTRT3	Q9BYD9	372 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	ZNF385D	Q9H6B1	395 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	ZDHHC11	Q9H8X9	412 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	ZFP64	Q9NPA5	681 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	SLC52A3	Q9NQ40	469 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	ZCCHC3	Q9NUD5	404 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	MRGBP	Q9NV56	204 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	GMEB1	Q9Y692	573 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	ICE1	Q9Y2F5	2266 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	RELN	P78509	3460 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	INTS1	Q8N201	2190 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631		A0A0G2JMM0	328 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631		A0A1B0GVC2	190 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631		A0A1W2PPB8	328 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631		A0A1W2PRS3	328 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	GXYLT2	A0PJZ3	443 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	KIR3DP1	A8MWS1	328 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	ADAM10	O14672	748 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	ASNA1	O43681	348 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	FADS1	O60427	444 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	NME6	O75414	186 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	KCNK2	O95069	426 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	KCNH1	O95259	989 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	IGHG3	P01860	377 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	NGFR	P08138	427 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	GUSB	P08236	651 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	VIM	P08670	466 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	ALOX5	P09917	674 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	MATN1	P21941	496 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	IL12B	P29460	328 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	ADSL	P30566	484 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	KRT20	P35900	424 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	DGKQ	P52824	942 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	GAS1	P54826	345 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	GPR85	P60893	370 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	STX1B	P61266	288 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	PMP22	Q01453	160 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	RCAN2	Q14206	197 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	SQLE	Q14534	574 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	LASP1	Q14847	261 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	NNAT	Q16517	81 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	DUSP5	Q16690	384 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	ZNF800	Q2TB10	664 aa	Predicted RBP eCLIP	7.36	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	FNDC7	Q5VTL7	733 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	CGB2	Q6NT52	195 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	PAOX	Q6QHF9	649 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631		Q6ZPB1	254 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	C6orf120	Q7Z4R8	191 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	SLC22A16	Q86VW1	577 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	ATCAY	Q86WG3	371 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	GHDC	Q8N2G8	530 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	TRIML2	Q8N7C3	387 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	CHDH	Q8NE62	594 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	OR4N2	Q8NGD1	307 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	OR4A15	Q8NGL6	344 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	NEURL3	Q96EH8	262 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	MARK4	Q96L34	752 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	ZNF597	Q96LX8	424 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	DOHH	Q9BU89	302 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	BTBD2	Q9BX70	525 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	OSBPL11	Q9BXB4	747 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	TTTY12	Q9BZ98	90 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	RABEP2	Q9H5N1	569 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	RMND5A	Q9H871	391 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	HHATL	Q9HCP6	504 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	NPHS2	Q9NP85	383 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	ACKR4	Q9NPB9	350 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	SERHL	Q9NQF3	203 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	FGFR1OP2	Q9NVK5	253 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	TUBA8	Q9NY65	449 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	DCTN4	Q9UJW0	460 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	BOK	Q9UMX3	212 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	VPS4A	Q9UN37	437 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	ABCG2	Q9UNQ0	655 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	TRIM33	Q9UPN9	1127 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	ZNF835	Q9Y2P0	537 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	MRPS18C	Q9Y3D5	142 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	OR10H1	Q9Y4A9	318 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	PCDHGB3	Q9Y5G1	929 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	SNX8	Q9Y5X2	465 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	SEC23IP	Q9Y6Y8	1000 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	CACNA1C	Q13936	2221 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	RNF103-CHMP3	A0A140T963	221 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	CLEC18A	A5D8T8	446 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	ANKUB1	A6NFN9	424 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	PRAMEF25	A6NGN4	478 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	CCDC154	A6NI56	674 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	LRRC3C	A6NJW4	275 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	ACOT7	O00154	380 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	RFXANK	O14593	260 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	SUSD5	O60279	629 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	ICOSLG	O75144	302 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	WISP2	O76076	250 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	CPSF4	O95639	269 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	AGR2	O95994	175 aa		7.35	□□□□□ -1.23

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