RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559460.5

SMAD3-211, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD3, Length 568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-211ENST00000559460 NPIPA8P0DM63 369 aa8.56□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 CD22P20273 847 aa8.56□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 EPHA1P21709 976 aa8.56□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 PTAFRP25105 342 aa8.56□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 CDH15P55291 814 aa8.56□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 PHC1P78364 1004 aa8.56□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 PHEXP78562 749 aa8.56□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 KIF5AQ12840 1032 aa8.56□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 STX5Q13190 355 aa8.56□□□□□ -1.04
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SMAD3-211ENST00000559460 MLC1Q15049 377 aa8.56□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 PDK4Q16654 411 aa8.56□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 PPP1R3AQ16821 1122 aa8.56□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 FAM45BPQ6NSW5 357 aa8.56□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 MED27Q6P2C8 311 aa8.56□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 TFAP2EQ6VUC0 442 aa8.56□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP8.56□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa8.56□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa8.56□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 LUZP1Q86V48 1076 aa8.56□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 SYCE1Q8N0S2 351 aa8.56□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 TCAIMQ8N3R3 496 aa8.56□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 SPATA6LQ8N4H0 392 aa8.56□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 OR4K14Q8NGD5 310 aa8.56□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 FAM45AQ8TCE6 357 aa8.56□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 MTBPQ96DY7 904 aa8.56□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 INPP5KQ9BT40 448 aa8.56□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 SAP130Q9H0E3 1048 aa8.56□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 OR51B5Q9H339 312 aa8.56□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 FKRPQ9H9S5 495 aa8.56□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 ZBTB26Q9HCK0 441 aa8.56□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 SMYD2Q9NRG4 433 aa8.56□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 EXPH5Q8NEV8 1989 aa8.55□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 GOLGA6L10A6NI86 522 aa8.55□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 WASHC1A8K0Z3 465 aa8.55□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 GOLGA6L22H0YM25 854 aa8.55□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 CBFA2T2O43439 604 aa8.55□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 CXCL13O43927 109 aa8.55□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 IL33O95760 270 aa8.55□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 BCL10O95999 233 aa8.55□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 CCDC175P0C221 793 aa8.55□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 PORP16435 677 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 GGT1P19440 569 aa8.55□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 DRD5P21918 477 aa8.55□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 ME2P23368 584 aa8.55□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 PPICP45877 212 aa8.55□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 CLK3P49761 638 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 XKP51811 444 aa8.55□□□□□ -1.04
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SMAD3-211ENST00000559460 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP8.55□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 FBLN7Q53RD9 439 aa8.55□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 TIMM23BQ5SRD1 257 aa8.55□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 MFSD12Q6NUT3 480 aa8.55□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 GALNT10Q86SR1 603 aa8.55□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 P2RY8Q86VZ1 359 aa8.55□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 TDRPQ86YL5 185 aa8.55□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 OR2M3Q8NG83 312 aa8.55□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 FBXO17Q96EF6 278 aa8.55□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 SLC35A4Q96G79 324 aa8.55□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 SORCS2Q96PQ0 1159 aa8.55□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 SNX18Q96RF0 628 aa8.55□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 LRRC1Q9BTT6 524 aa8.55□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 TSPY26PQ9H489 355 aa8.55□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 MED11Q9P086 117 aa8.55□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa8.55□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 ASIC3Q9UHC3 531 aa8.55□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 PLLPQ9Y342 182 aa8.55□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa8.55□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 A0A1W2PR48 441 aa8.54□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 CCT8L1PA6NM43 557 aa8.54□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 B4DSR2 109 aa8.54□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 M0R1B8 84 aa8.54□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 PLPP1O14494 284 aa8.54□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 TO15178 435 aa8.54□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 KERAO60938 352 aa8.54□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 NTN1O95631 604 aa8.54□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 MBD3O95983 291 aa8.54□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 HKR1P10072 659 aa8.54□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 CPMP14384 443 aa8.54□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 DDX5P17844 614 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 RBMXP38159 391 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
SMAD3-211ENST00000559460 ZNF83P51522 516 aa8.54□□□□□ -1.04
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