RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542557.5

PTPRO-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRO, Length 2,946 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-208ENST00000542557 LTB4RQ15722 352 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 ATAT1Q5SQI0 421 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 ZNF730Q6ZMV8 503 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 USP53Q70EK8 1073 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 KCT2Q8NC54 265 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 OR7G2Q8NG99 324 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 OR4E2Q8NGC2 313 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 OR8D4Q8NGM9 314 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 SETD6Q8TBK2 473 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 RSC1A1Q92681 617 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 OSTF1Q92882 214 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 SLC35A4Q96G79 324 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 CEP19Q96LK0 163 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 OR2A5Q96R48 311 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 CNPPD1Q9BV87 410 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 SAP130Q9H0E3 1048 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 SLC6A17Q9H1V8 727 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 IGFLR1Q9H665 355 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 EGLN3Q9H6Z9 239 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 EQTNQ9NQ60 294 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 KCMF1Q9P0J7 381 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 CDH23Q9H251 3354 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 ALOX12P18054 663 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 CPN2P22792 545 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 ETV5P41161 510 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 MTNR1AP48039 350 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 ETV1P50549 477 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 TPBGQ13641 420 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 EIPR1Q53HC9 387 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 FBXO42Q6P3S6 717 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 PAQR6Q6TCH4 344 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 ENPP7Q6UWV6 458 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 HMGN2P46Q86SG4 172 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 POGLUT1Q8NBL1 392 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 ANKK1Q8NFD2 765 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 OR4K14Q8NGD5 310 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 ZFPM2Q8WW38 1151 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 KAT2AQ92830 837 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 RFKQ969G6 155 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 SLC25A46Q96AG3 418 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 RNFT2Q96EX2 444 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 NELL2Q99435 816 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
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PTPRO-208ENST00000542557 TEX12Q9BXU0 123 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 PBX4Q9BYU1 374 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 BARHL1Q9BZE3 327 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 LYRM4Q9HD34 91 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 CTPS2Q9NRF8 586 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 IL20Q9NYY1 176 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 DAPP1Q9UN19 280 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 C5orf42Q9H799 3197 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 COL4A2P08572 1712 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 CTDSP2O14595 271 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 LINC01565O15544 149 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 B3GALT2O43825 422 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 KCNK2O95069 426 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 GAAP10253 952 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 AK4P27144 223 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 TNFSF8P32971 234 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 SEPHS1P49903 392 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 PSPHP78330 225 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 RUNX1T1Q06455 604 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 HYAL1Q12794 435 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 DUSP8Q13202 625 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 PLK5Q496M5 336 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 LIPKQ5VXJ0 399 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 ZNF620Q6ZNG0 422 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 ABHD13Q7L211 337 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 RRM2BQ7LG56 351 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 LAPTM4BQ86VI4 370 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 PEX5LQ8IYB4 626 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 FAM181AQ8N9Y4 354 aa6.12□□□□□ -1.43
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