RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519552.1

DCTN4-208, Transcript of dynactin subunit 4, human

TSL 4

Gene DCTN4, Length 662 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DCTN4-208	ENST00000519552	CYLC1	P35663	651 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DCTN4-208	ENST00000519552	PTGFR	P43088	359 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DCTN4-208	ENST00000519552	METAP1	P53582	386 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DCTN4-208	ENST00000519552	CXCL6	P80162	114 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DCTN4-208	ENST00000519552	PDZK1IP1	Q13113	114 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DCTN4-208	ENST00000519552	IL18R1	Q13478	541 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DCTN4-208	ENST00000519552	TMEM52B	Q4KMG9	183 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DCTN4-208	ENST00000519552	LGSN	Q5TDP6	509 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DCTN4-208	ENST00000519552	SLX4IP	Q5VYV7	408 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DCTN4-208	ENST00000519552	CGB2	Q6NT52	195 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DCTN4-208	ENST00000519552	ARSK	Q6UWY0	536 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DCTN4-208	ENST00000519552	LHFPL4	Q7Z7J7	247 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DCTN4-208	ENST00000519552	LINC00612	Q8N6U2	182 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DCTN4-208	ENST00000519552	VSTM2L	Q96N03	204 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DCTN4-208	ENST00000519552	APOBEC3C	Q9NRW3	190 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63
DCTN4-208	ENST00000519552	SLC7A10	Q9NS82	523 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DCTN4-208	ENST00000519552	ATP6V1H	Q9UI12	483 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DCTN4-208	ENST00000519552	DUSP12	Q9UNI6	340 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DCTN4-208	ENST00000519552	AURKC	Q9UQB9	309 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DCTN4-208	ENST00000519552	NAALAD2	Q9Y3Q0	740 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DCTN4-208	ENST00000519552	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DCTN4-208	ENST00000519552	FRG2C	A6NGY1	282 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DCTN4-208	ENST00000519552		G3V3Y1	287 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DCTN4-208	ENST00000519552	SDHD	O14521	159 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DCTN4-208	ENST00000519552	PHOX2A	O14813	284 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DCTN4-208	ENST00000519552	LCMT2	O60294	686 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
DCTN4-208	ENST00000519552	IGFBP1	P08833	259 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
DCTN4-208	ENST00000519552	GIG44	P09565	113 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
DCTN4-208	ENST00000519552	SLC35E2	P0CK97	266 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DCTN4-208	ENST00000519552	SDC1	P18827	310 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DCTN4-208	ENST00000519552	CYP2F1	P24903	491 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DCTN4-208	ENST00000519552	FAS	P25445	335 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DCTN4-208	ENST00000519552	IL2RG	P31785	369 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DCTN4-208	ENST00000519552	ERVPABLB-1	P60509	514 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DCTN4-208	ENST00000519552	SCGB2A2	Q13296	93 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DCTN4-208	ENST00000519552	TGIF1	Q15583	401 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DCTN4-208	ENST00000519552	CYBRD1	Q53TN4	286 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DCTN4-208	ENST00000519552	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DCTN4-208	ENST00000519552	TMEM184A	Q6ZMB5	413 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DCTN4-208	ENST00000519552		Q6ZR54	194 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DCTN4-208	ENST00000519552	UPRT	Q96BW1	309 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DCTN4-208	ENST00000519552	LIN28A	Q9H9Z2	209 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
DCTN4-208	ENST00000519552	AGPAT5	Q9NUQ2	364 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DCTN4-208	ENST00000519552	SENP1	Q9P0U3	644 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DCTN4-208	ENST00000519552		U3KQV3	271 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DCTN4-208	ENST00000519552	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DCTN4-208	ENST00000519552	WASH3P	C4AMC7	463 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DCTN4-208	ENST00000519552		K7EPI3	171 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DCTN4-208	ENST00000519552	SLC17A2	O00624	439 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DCTN4-208	ENST00000519552	CASK	O14936	926 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DCTN4-208	ENST00000519552	PPIH	O43447	177 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
DCTN4-208	ENST00000519552	AK1	P00568	194 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DCTN4-208	ENST00000519552	IFNB1	P01574	187 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DCTN4-208	ENST00000519552	NCF1	P14598	390 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
DCTN4-208	ENST00000519552	DPP4	P27487	766 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DCTN4-208	ENST00000519552	ACVR1B	P36896	505 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DCTN4-208	ENST00000519552	MAGEA9	P43362	315 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DCTN4-208	ENST00000519552	POLR2F	P61218	127 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
DCTN4-208	ENST00000519552	PRKCE	Q02156	737 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DCTN4-208	ENST00000519552	PLOD1	Q02809	727 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
DCTN4-208	ENST00000519552	TRIP10	Q15642	601 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DCTN4-208	ENST00000519552	ZNF57	Q68EA5	555 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
DCTN4-208	ENST00000519552	WASH2P	Q6VEQ5	465 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DCTN4-208	ENST00000519552	ERICH1	Q86X53	443 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DCTN4-208	ENST00000519552	CBWD2	Q8IUF1	395 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DCTN4-208	ENST00000519552	GCNT2	Q8N0V5	402 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DCTN4-208	ENST00000519552	GIPC3	Q8TF64	312 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DCTN4-208	ENST00000519552	TAF4B	Q92750	862 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DCTN4-208	ENST00000519552	TADA1	Q96BN2	335 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DCTN4-208	ENST00000519552	PPP1R16A	Q96I34	528 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DCTN4-208	ENST00000519552	TMEM121	Q9BTD3	319 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DCTN4-208	ENST00000519552	TBCD	Q9BTW9	1192 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DCTN4-208	ENST00000519552	MRPL13	Q9BYD1	178 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
DCTN4-208	ENST00000519552	SLC25A51	Q9H1U9	297 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DCTN4-208	ENST00000519552	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
DCTN4-208	ENST00000519552	LPAR2	Q9HBW0	351 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DCTN4-208	ENST00000519552	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
DCTN4-208	ENST00000519552	UTP6	Q9NYH9	597 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
DCTN4-208	ENST00000519552	B9D1	Q9UPM9	204 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DCTN4-208	ENST00000519552	CCDC7	Q96M83	1385 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DCTN4-208	ENST00000519552		A0A087WZY1	265 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DCTN4-208	ENST00000519552		A0A1B0GUL7	405 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DCTN4-208	ENST00000519552	ZSCAN5B	A6NJL1	495 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DCTN4-208	ENST00000519552	WASHC1	A8K0Z3	465 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DCTN4-208	ENST00000519552		A8MX80	341 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DCTN4-208	ENST00000519552	RAMP1	O60894	148 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DCTN4-208	ENST00000519552	OR4F21	O95013	312 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DCTN4-208	ENST00000519552	THRB	P10828	461 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DCTN4-208	ENST00000519552	XRCC1	P18887	633 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
DCTN4-208	ENST00000519552	PTBP1	P26599	531 aa	Known RBP eCLIP	4.83	□□□□□ -1.64
DCTN4-208	ENST00000519552	RPL4	P36578	427 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
DCTN4-208	ENST00000519552	TRPC1	P48995	793 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DCTN4-208	ENST00000519552	PAMR1	Q6UXH9	720 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DCTN4-208	ENST00000519552	GET4	Q7L5D6	327 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
DCTN4-208	ENST00000519552	CD177	Q8N6Q3	437 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DCTN4-208	ENST00000519552		Q8N9G6	341 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
DCTN4-208	ENST00000519552	ZBTB44	Q8NCP5	570 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DCTN4-208	ENST00000519552	CCDC110	Q8TBZ0	833 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DCTN4-208	ENST00000519552	ADAMTS16	Q8TE57	1224 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DCTN4-208	ENST00000519552	PINX1	Q96BK5	328 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64

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