RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 C9orf85Q96MD7 179 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 RAB33BQ9H082 229 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 KIF16BQ96L93 1317 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 H0YCG3 227 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 PPIHO43447 177 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 IGHV3-9P01782 118 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 BCKDHAP12694 445 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 PRG2P13727 222 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 PVRP15151 417 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 RPL34P49207 117 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 VEGFCP49767 419 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF33BQ06732 778 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 ABRAXAS2Q15018 415 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 PDK4Q16654 411 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 LINC01620Q4KN68 170 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 DCST2Q5T1A1 773 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 GSG1LQ6UXU4 331 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 SUMF1Q8NBK3 374 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 OR4Q3Q8NH05 313 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 FBXO30Q8TB52 745 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 TBCKQ8TEA7 893 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 C4orf36Q96KX1 117 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 ERP44Q9BS26 406 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 SLC25A51Q9H1U9 297 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 A0A1W2PPR1 153 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF487B1APH4 448 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 MAGEB3O15480 346 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 RHOBTB1O94844 696 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 IGHV3-13P01766 116 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 WNT2P09544 360 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 ANXA3P12429 323 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 ATP6V1C1P21283 382 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 RPS6P62753 249 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 SCYL2Q6P3W7 929 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 CES3Q6UWW8 571 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 TBC1D21Q8IYX1 336 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 RFESDQ8TAC1 157 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 CASD1Q96PB1 797 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 CALHM2Q9HA72 323 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 NTNG1Q9Y2I2 539 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 GMPPBQ9Y5P6 360 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 ACOD1A6NK06 481 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 SHISA9B4DS77 424 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 PPIAL4DF5H284 164 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 DUX1O43812 170 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 SH3BGRLO75368 114 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 STX11O75558 287 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 RENP00797 406 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 H2AFZP0C0S5 128 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 CLUP10909 449 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 IGFBP5P24593 272 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 CRMP1Q14194 572 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 MICAQ29983 383 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 ANKRD37Q7Z713 158 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 CRACR2AQ9BSW2 395 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 TEX13BQ9BXU2 312 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM117Q9H0C3 514 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 NT5C3AQ9H0P0 336 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 GNB4Q9HAV0 340 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 CYTH4Q9UIA0 394 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 DUSP12Q9UNI6 340 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 OR10H1Q9Y4A9 318 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 SPACA6W5XKT8 324 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 GPR89AB7ZAQ6 455 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 CTAGE5O15320 804 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 LRRTM2O43300 516 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 MELTFP08582 738 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 GPR89BP0CG08 455 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 RPA2P15927 270 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 SDC1P18827 310 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 ELK3P41970 407 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 POU3F4P49335 361 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 NTHL1P78549 312 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 NHLRC3Q5JS37 347 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 LGSNQ5TDP6 509 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 LEMD1Q68G75 181 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 SLC25A42Q86VD7 318 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 SLC47A2Q86VL8 602 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 TOMM40LQ969M1 308 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-212ENST00000491302 MYLPFQ96A32 169 aa6.1□□□□□ -1.43
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