RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	DUSP8	Q13202	625 aa		15.79	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	HSPB2	Q16082	182 aa		15.79	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	LSM12	Q3MHD2	195 aa	Known RBP	15.79	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM180B	Q6P0A1	224 aa		15.79	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF585A	Q6P3V2	769 aa		15.79	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	NCCRP1	Q6ZVX7	275 aa	Predicted RBP	15.79	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	ULK2	Q8IYT8	1036 aa		15.79	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF295-AS1	Q8N0V1	137 aa		15.79	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	VPS37A	Q8NEZ2	397 aa		15.79	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	OR1J4	Q8NGS1	313 aa		15.79	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	ACTRT2	Q8TDY3	377 aa		15.79	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	RNF138	Q8WVD3	245 aa		15.79	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	OMA1	Q96E52	524 aa		15.79	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	VSTM2L	Q96N03	204 aa		15.79	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	COL21A1	Q96P44	957 aa		15.79	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	ZBTB18	Q99592	522 aa		15.79	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	HHATL	Q9HCP6	504 aa		15.79	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	ACSS1	Q9NUB1	689 aa	Predicted RBP	15.79	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	SPRR3	Q9UBC9	169 aa		15.79	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	GOLGA8Q	A0A0J9YX86	632 aa		15.78	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	GOLGA8O	A6NCC3	632 aa		15.78	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	GOLGA8N	F8WBI6	632 aa		15.78	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	C19orf84	I3L1E1	186 aa		15.78	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	POLR3G	O15318	223 aa	Predicted RBP	15.78	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	COQ9	O75208	318 aa		15.78	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	ACTL6A	O96019	429 aa		15.78	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	CT45A8	P0DMV1	189 aa		15.78	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	CT45A9	P0DMV2	189 aa		15.78	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	IDO1	P14902	403 aa		15.78	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	PTPN6	P29350	595 aa		15.78	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	GCK	P35557	465 aa		15.78	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	DUSP2	Q05923	314 aa		15.78	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	CRYZ	Q08257	329 aa	Known RBP	15.78	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	PDE7A	Q13946	482 aa		15.78	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	PTGR1	Q14914	329 aa		15.78	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	EXOSC7	Q15024	291 aa	Known RBP	15.78	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	PGS1	Q32NB8	556 aa		15.78	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	CYP27C1	Q4G0S4	372 aa		15.78	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	CT45A2	Q5DJT8	189 aa		15.78	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	OR5M9	Q8NGP3	310 aa		15.78	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	OR9A2	Q8NGT5	310 aa		15.78	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	JSRP1	Q96MG2	331 aa	Predicted RBP	15.78	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	AMDHD1	Q96NU7	426 aa		15.78	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	TIMP4	Q99727	224 aa		15.78	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	SIKE1	Q9BRV8	207 aa		15.78	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	WDR55	Q9H6Y2	383 aa	Predicted RBP	15.78	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	METTL7A	Q9H8H3	244 aa		15.78	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	C3orf14	Q9HBI5	128 aa		15.78	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	SLCO1B3	Q9NPD5	702 aa		15.78	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	PCDHGB4	Q9UN71	923 aa		15.78	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	C19orf53	Q9UNZ5	99 aa	Predicted RBP	15.78	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	SNPH	O15079	494 aa		15.77	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	ICOSLG	O75144	302 aa		15.77	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	CEACAM8	P31997	349 aa	Predicted RBP	15.77	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	KRT20	P35900	424 aa		15.77	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	C21orf58	P58505	322 aa		15.77	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	LTB4R	Q15722	352 aa		15.77	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	GSTA3	Q16772	222 aa		15.77	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	DPY19L1	Q2PZI1	675 aa		15.77	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	ANKRD26P1	Q6NSI1	321 aa		15.77	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	EPGN	Q6UW88	154 aa		15.77	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM64	Q6YI46	380 aa		15.77	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	LACC1	Q8IV20	430 aa		15.77	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	DMRTC2	Q8IXT2	367 aa	Predicted RBP	15.77	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	KAT2A	Q92830	837 aa		15.77	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	GNRHR2	Q96P88	292 aa		15.77	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	OSBPL11	Q9BXB4	747 aa		15.77	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	BHLHE41	Q9C0J9	482 aa	Predicted RBP	15.77	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	GLIPR2	Q9H4G4	154 aa		15.77	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	CALHM2	Q9HA72	323 aa		15.77	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	MCCC2	Q9HCC0	563 aa		15.77	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	DDX18	Q9NVP1	670 aa	Known RBP	15.77	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF629	Q9UEG4	869 aa	Predicted RBP	15.77	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	KCNN3	Q9UGI6	736 aa		15.77	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	FREM3	P0C091	2139 aa		15.77	■□□□□ 0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	FBN2	P35556	2912 aa		15.76	■□□□□ 0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	NIN	Q8N4C6	2090 aa		15.76	■□□□□ 0.11
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A1W2PRB8	838 aa		15.76	■□□□□ 0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	CD8B2	A6NJW9	211 aa		15.76	■□□□□ 0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	UBD	O15205	165 aa		15.76	■□□□□ 0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	TSPAN2	O60636	221 aa		15.76	■□□□□ 0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	UGT2B11	O75310	529 aa		15.76	■□□□□ 0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	ERN1	O75460	977 aa	Known RBP	15.76	■□□□□ 0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	PSMG1	O95456	288 aa		15.76	■□□□□ 0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	VIM	P08670	466 aa	Known RBP	15.76	■□□□□ 0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	TROVE2	P10155	538 aa	Known RBP eCLIP	15.76	■□□□□ 0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	CPN1	P15169	458 aa		15.76	■□□□□ 0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	PTGDS	P41222	190 aa		15.76	■□□□□ 0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	DIO3	P55073	304 aa		15.76	■□□□□ 0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	STX1B	P61266	288 aa		15.76	■□□□□ 0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	IRX1	P78414	480 aa	Predicted RBP	15.76	■□□□□ 0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	MRPS35	P82673	323 aa	Known RBP	15.76	■□□□□ 0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	HSPB3	Q12988	150 aa		15.76	■□□□□ 0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	MLC1	Q15049	377 aa		15.76	■□□□□ 0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNHIT3	Q15649	155 aa	Predicted RBP	15.76	■□□□□ 0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC9B1	Q4ZJI4	515 aa		15.76	■□□□□ 0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	ANXA8L1	Q5VT79	327 aa		15.76	■□□□□ 0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	MEX3B	Q6ZN04	569 aa	Known RBP	15.76	■□□□□ 0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	OR2L13	Q8N349	312 aa		15.76	■□□□□ 0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	RPRML	Q8N4K4	120 aa		15.76	■□□□□ 0.11

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