RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488243.1

NISCH-211, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-211ENST00000488243 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP10.82□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP10.82□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 IGFBP7Q16270 282 aa10.82□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 FXNQ16595 210 aa10.82□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 DUSP5Q16690 384 aa10.82□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 DECR1Q16698 335 aa10.82□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP10.82□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 VMACQ2NL98 169 aa10.82□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 CT45A2Q5DJT8 189 aa10.82□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 COX20Q5RI15 118 aa10.82□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 FAM69BQ5VUD6 431 aa10.82□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 REEP3Q6NUK4 255 aa10.82□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP10.82□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa10.82□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 C16orf62Q7Z3J2 963 aa10.82□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP10.82□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP10.82□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa10.82□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 MICU2Q8IYU8 434 aa10.82□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 CLEC4FQ8N1N0 589 aa10.82□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 HIPK4Q8NE63 616 aa10.82□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 OR52E4Q8NGH9 312 aa10.82□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 FAM110BQ8TC76 370 aa10.82□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP10.82□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 GPR151Q8TDV0 419 aa10.82□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 JADE3Q92613 823 aa10.82□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 SLC35A4Q96G79 324 aa10.82□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 C16orf58Q96GQ5 468 aa10.82□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 ZNF354BQ96LW1 612 aa10.82□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 THTPAQ9BU02 230 aa10.82□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa10.82□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 ITPAQ9BY32 194 aa10.82□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP10.82□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 HOXD1Q9GZZ0 328 aa10.82□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 IKZF5Q9H5V7 419 aa10.82□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP10.82□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 BCL2L10Q9HD36 194 aa10.82□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 ABI3Q9P2A4 366 aa10.82□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 MYOTQ9UBF9 498 aa10.82□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP10.82□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa10.82□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP10.82□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 CBLCQ9ULV8 474 aa10.82□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 ANGPT4Q9Y264 503 aa10.82□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP10.82□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 OR10H1Q9Y4A9 318 aa10.82□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP10.82□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP10.82□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 NBASA2RRP1 2371 aa10.81□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 PRORSD1PA6NEY8 169 aa10.81□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 A8MVJ9 347 aa10.81□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 STX11O75558 287 aa10.81□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 PDE9AO76083 593 aa10.81□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 IFNA14P01570 189 aa10.81□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 NR2F1P10589 423 aa10.81□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 ETS2P15036 469 aa10.81□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 PNLIPRP2P54317 469 aa10.81□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 RPP38P78345 283 aaKnown RBP10.81□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 CDK6Q00534 326 aa10.81□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 SELPLGQ14242 412 aa10.81□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP10.81□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 ADRM1Q16186 407 aa10.81□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 MEP1AQ16819 746 aa10.81□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 ZSWIM7Q19AV6 140 aa10.81□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 MTX3Q5HYI7 312 aa10.81□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 OPN5Q6U736 354 aa10.81□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 CCDC80Q76M96 950 aa10.81□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP10.81□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP10.81□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 KRT73Q86Y46 540 aa10.81□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 C10orf67Q8IYJ2 551 aa10.81□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 SLC34A3Q8N130 599 aa10.81□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 ZNF321PQ8N8H1 164 aa10.81□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 SIMC1Q8NDZ2 872 aa10.81□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP10.81□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 BBS10Q8TAM1 723 aa10.81□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 RASSF5Q8WWW0 418 aa10.81□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 ASB9Q96DX5 294 aa10.81□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 RNF145Q96MT1 663 aa10.81□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 GAL3ST4Q96RP7 486 aa10.81□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 ZNF607Q96SK3 696 aa10.81□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 SAP130Q9H0E3 1048 aa10.81□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 SERHL2Q9H4I8 314 aa10.81□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 EVA1AQ9H8M9 152 aa10.81□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP10.81□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 ANKRA2Q9H9E1 313 aa10.81□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP10.81□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 PRDM4Q9UKN5 801 aa10.81□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 CROCCQ5TZA2 2017 aa10.8□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 GSTA4O15217 222 aa10.8□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 NKX2-8O15522 239 aa10.8□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 KCNK2O95069 426 aa10.8□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 IL33O95760 270 aa10.8□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP10.8□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 ATP6V1C1P21283 382 aa10.8□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP10.8□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 MLF1P58340 268 aa10.8□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 RPS26P62854 115 aaKnown RBP10.8□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 CEACAM7Q14002 265 aa10.8□□□□□ -0.68
NISCH-211ENST00000488243 SCARB2Q14108 478 aa10.8□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.9 ms