RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481231.5

SMARCE1-210, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 695 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-210ENST00000481231 VWA1Q6PCB0 445 aa8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 IL17RELQ6ZVW7 336 aa8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 P4HA3Q7Z4N8 544 aa8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 BTLAQ7Z6A9 289 aa8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 UBQLNLQ8IYU4 475 aa8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 CCDC116Q8IYX3 515 aa8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 OR9A2Q8NGT5 310 aa8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF675Q8TD23 568 aa8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 RNF138Q8WVD3 245 aa8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 SELENOMQ8WWX9 145 aa8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 KAT2AQ92830 837 aa8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 FAM111AQ96PZ2 611 aa8.49□□□□□ -1.05
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SMARCE1-210ENST00000481231 RAB17Q9H0T7 212 aa8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 ACSS3Q9H6R3 686 aa8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 BRF2Q9HAW0 419 aa8.49□□□□□ -1.05
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SMARCE1-210ENST00000481231 TMCO1Q9UM00 188 aa8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 H0YC42 278 aa8.48□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 ADAM11O75078 769 aa8.48□□□□□ -1.05
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SMARCE1-210ENST00000481231 OTCP00480 354 aa8.48□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 PLAUP00749 431 aa8.48□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 IL3P08700 152 aa8.48□□□□□ -1.05
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SMARCE1-210ENST00000481231 IL12BP29460 328 aa8.48□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 KRT20P35900 424 aa8.48□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 UGT2B10P36537 528 aa8.48□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 CDH13P55290 713 aa8.48□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
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SMARCE1-210ENST00000481231 BCL2A1Q16548 175 aa8.48□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 C22orf34Q6ZV56 151 aa8.48□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 CTAGE4Q8IX94 777 aa8.48□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 FADS6Q8N9I5 356 aa8.48□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 OR4K17Q8NGC6 315 aa8.48□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 OR4N2Q8NGD1 307 aa8.48□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 FIG4Q92562 907 aa8.48□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 ERP27Q96DN0 273 aa8.48□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 DTNBP1Q96EV8 351 aa8.48□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 PGM2Q96G03 612 aa8.48□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 KCNK17Q96T54 332 aa8.48□□□□□ -1.05
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SMARCE1-210ENST00000481231 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 GRPEL1Q9HAV7 217 aa8.48□□□□□ -1.05
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SMARCE1-210ENST00000481231 NINJ2Q9NZG7 142 aa8.48□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 VPS29Q9UBQ0 182 aa8.48□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 SNX6Q9UNH7 406 aa8.48□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 LAMP3Q9UQV4 416 aa8.48□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 TENM1Q9UKZ4 2725 aa8.48□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa8.47□□□□□ -1.05
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SMARCE1-210ENST00000481231 MANBAO00462 879 aa8.47□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 SCO2O43819 266 aa8.47□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 CGAP01215 116 aa8.47□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 PEPDP12955 493 aa8.47□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 CHN1P15882 459 aa8.47□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 EGR1P18146 543 aa8.47□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 EVI2BP34910 448 aa8.47□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 PHBP35232 272 aa8.47□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 SLC7A5Q01650 507 aa8.47□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa8.47□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa8.47□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 RAET1LQ5VY80 246 aa8.47□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 CHMP1BQ7LBR1 199 aa8.47□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 CDYL2Q8N8U2 506 aa8.47□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 OR7G2Q8NG99 324 aa8.47□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 FNDC9Q8TBE3 224 aa8.47□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 SLC39A3Q9BRY0 314 aa8.47□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa8.47□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 SHARPINQ9H0F6 387 aa8.47□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa8.47□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 DSN1Q9H410 356 aa8.47□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa8.47□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 MCM8Q9UJA3 840 aa8.47□□□□□ -1.05
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF175Q9Y473 711 aa8.47□□□□□ -1.05
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