RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472326.2

SGCE-210, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 2

Gene SGCE, Length 453 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-210ENST00000472326 ZP4Q12836 540 aa4.57□□□□□ -1.68
SGCE-210ENST00000472326 CBX3Q13185 183 aa4.57□□□□□ -1.68
SGCE-210ENST00000472326 ZSWIM7Q19AV6 140 aa4.57□□□□□ -1.68
SGCE-210ENST00000472326 SLX4IPQ5VYV7 408 aa4.57□□□□□ -1.68
SGCE-210ENST00000472326 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa4.57□□□□□ -1.68
SGCE-210ENST00000472326 SNX32Q86XE0 403 aa4.57□□□□□ -1.68
SGCE-210ENST00000472326 TICAM2Q86XR7 235 aa4.57□□□□□ -1.68
SGCE-210ENST00000472326 BATF2Q8N1L9 274 aa4.57□□□□□ -1.68
SGCE-210ENST00000472326 ART4Q93070 314 aa4.57□□□□□ -1.68
SGCE-210ENST00000472326 TADA1Q96BN2 335 aa4.57□□□□□ -1.68
SGCE-210ENST00000472326 GLT8D2Q9H1C3 349 aa4.57□□□□□ -1.68
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SGCE-210ENST00000472326 PDE10AQ9Y233 779 aa4.57□□□□□ -1.68
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SGCE-210ENST00000472326 AKT2P31751 481 aa4.56□□□□□ -1.68
SGCE-210ENST00000472326 NF2P35240 595 aa4.56□□□□□ -1.68
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SGCE-210ENST00000472326 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
SGCE-210ENST00000472326 ZNF562Q6V9R5 426 aa4.56□□□□□ -1.68
SGCE-210ENST00000472326 WDR88Q6ZMY6 472 aa4.56□□□□□ -1.68
SGCE-210ENST00000472326 ATP6V0A1Q93050 837 aa4.56□□□□□ -1.68
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SGCE-210ENST00000472326 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
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SGCE-210ENST00000472326 CXCL10P02778 98 aa4.55□□□□□ -1.68
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SGCE-210ENST00000472326 AHCYP23526 432 aa4.55□□□□□ -1.68
SGCE-210ENST00000472326 HSPA1LP34931 641 aa4.55□□□□□ -1.68
SGCE-210ENST00000472326 EFNA3P52797 238 aa4.55□□□□□ -1.68
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SGCE-210ENST00000472326 HERVK_113P63132 956 aa4.55□□□□□ -1.68
SGCE-210ENST00000472326 ERVK-8P63133 956 aa4.55□□□□□ -1.68
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SGCE-210ENST00000472326 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
SGCE-210ENST00000472326 TFAP2EQ6VUC0 442 aa4.55□□□□□ -1.68
SGCE-210ENST00000472326 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
SGCE-210ENST00000472326 MSANTD4Q8NCY6 345 aa4.55□□□□□ -1.68
SGCE-210ENST00000472326 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
SGCE-210ENST00000472326 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
SGCE-210ENST00000472326 IMMP1LQ96LU5 166 aa4.55□□□□□ -1.68
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SGCE-210ENST00000472326 BCAP29Q9UHQ4 241 aa4.55□□□□□ -1.68
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SGCE-210ENST00000472326 GPC3P51654 580 aa4.54□□□□□ -1.68
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SGCE-210ENST00000472326 DPYSQ14117 519 aa4.54□□□□□ -1.68
SGCE-210ENST00000472326 PRR4Q16378 134 aa4.54□□□□□ -1.68
SGCE-210ENST00000472326 CYP51A1Q16850 503 aa4.54□□□□□ -1.68
SGCE-210ENST00000472326 SLC39A4Q6P5W5 647 aa4.54□□□□□ -1.68
SGCE-210ENST00000472326 FAM159AQ6UWV7 190 aa4.54□□□□□ -1.68
SGCE-210ENST00000472326 BTNL3Q6UXE8 466 aa4.54□□□□□ -1.68
SGCE-210ENST00000472326 OR10H4Q8NGA5 316 aa4.54□□□□□ -1.68
SGCE-210ENST00000472326 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
SGCE-210ENST00000472326 ZNF285Q96NJ3 590 aa4.54□□□□□ -1.68
SGCE-210ENST00000472326 KCNN3Q9UGI6 736 aa4.54□□□□□ -1.68
SGCE-210ENST00000472326 TTC26A0AVF1 554 aa4.53□□□□□ -1.68
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SGCE-210ENST00000472326 ZBTB14O43829 449 aa4.53□□□□□ -1.68
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SGCE-210ENST00000472326 TSPAN8P19075 237 aa4.53□□□□□ -1.68
SGCE-210ENST00000472326 HLA-DPA1P20036 260 aa4.53□□□□□ -1.68
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SGCE-210ENST00000472326 PRDX2P32119 198 aa4.53□□□□□ -1.68
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SGCE-210ENST00000472326 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
SGCE-210ENST00000472326 RPL32P62910 135 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
SGCE-210ENST00000472326 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
SGCE-210ENST00000472326 PAQR9Q6ZVX9 377 aa4.53□□□□□ -1.68
SGCE-210ENST00000472326 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa4.53□□□□□ -1.68
SGCE-210ENST00000472326 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
SGCE-210ENST00000472326 TAF8Q7Z7C8 310 aa4.53□□□□□ -1.68
SGCE-210ENST00000472326 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
SGCE-210ENST00000472326 EHFQ9NZC4 300 aa4.53□□□□□ -1.68
SGCE-210ENST00000472326 IL20RAQ9UHF4 553 aa4.53□□□□□ -1.68
SGCE-210ENST00000472326 TM9SF1O15321 606 aa4.52□□□□□ -1.69
SGCE-210ENST00000472326 EMC8O43402 210 aa4.52□□□□□ -1.69
SGCE-210ENST00000472326 ZNF861PO60384 105 aa4.52□□□□□ -1.69
SGCE-210ENST00000472326 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
SGCE-210ENST00000472326 JCHAINP01591 159 aa4.52□□□□□ -1.69
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