RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471538.1

SPEN-204, Transcript of spen family transcriptional repressor, humanhuman

TSL 2

Gene SPEN, Length 1,404 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEN-204ENST00000471538 SFTPA2Q8IWL1 248 aa5.99□□□□□ -1.45
SPEN-204ENST00000471538 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
SPEN-204ENST00000471538 OR4N4Q8N0Y3 316 aa5.99□□□□□ -1.45
SPEN-204ENST00000471538 SHISA5Q8N114 240 aa5.99□□□□□ -1.45
SPEN-204ENST00000471538 STX19Q8N4C7 294 aa5.99□□□□□ -1.45
SPEN-204ENST00000471538 CAMKVQ8NCB2 501 aa5.99□□□□□ -1.45
SPEN-204ENST00000471538 SIMC1Q8NDZ2 872 aa5.99□□□□□ -1.45
SPEN-204ENST00000471538 OR4K5Q8NGD3 323 aa5.99□□□□□ -1.45
SPEN-204ENST00000471538 OR4K14Q8NGD5 310 aa5.99□□□□□ -1.45
SPEN-204ENST00000471538 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa5.99□□□□□ -1.45
SPEN-204ENST00000471538 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa5.99□□□□□ -1.45
SPEN-204ENST00000471538 FAM174AQ8TBP5 190 aa5.99□□□□□ -1.45
SPEN-204ENST00000471538 SLC37A2Q8TED4 501 aa5.99□□□□□ -1.45
SPEN-204ENST00000471538 FAM3CQ92520 227 aa5.99□□□□□ -1.45
SPEN-204ENST00000471538 NR4A3Q92570 626 aa5.99□□□□□ -1.45
SPEN-204ENST00000471538 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
SPEN-204ENST00000471538 ZG16BQ96DA0 208 aa5.99□□□□□ -1.45
SPEN-204ENST00000471538 MS4A4EQ96PG1 132 aa5.99□□□□□ -1.45
SPEN-204ENST00000471538 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa5.99□□□□□ -1.45
SPEN-204ENST00000471538 FNDC11Q9BVV2 318 aa5.99□□□□□ -1.45
SPEN-204ENST00000471538 TAPBPLQ9BX59 468 aa5.99□□□□□ -1.45
SPEN-204ENST00000471538 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
SPEN-204ENST00000471538 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
SPEN-204ENST00000471538 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
SPEN-204ENST00000471538 CHRDQ9H2X0 955 aa5.99□□□□□ -1.45
SPEN-204ENST00000471538 ANKRD19PQ9H560 264 aa5.99□□□□□ -1.45
SPEN-204ENST00000471538 ANKHQ9HCJ1 492 aa5.99□□□□□ -1.45
SPEN-204ENST00000471538 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa5.99□□□□□ -1.45
SPEN-204ENST00000471538 SEMA4GQ9NTN9 838 aa5.99□□□□□ -1.45
SPEN-204ENST00000471538 FAIMQ9NVQ4 179 aa5.99□□□□□ -1.45
SPEN-204ENST00000471538 CLN6Q9NWW5 311 aa5.99□□□□□ -1.45
SPEN-204ENST00000471538 TAS2R16Q9NYV7 291 aa5.99□□□□□ -1.45
SPEN-204ENST00000471538 CALML5Q9NZT1 146 aa5.99□□□□□ -1.45
SPEN-204ENST00000471538 PTGFRNQ9P2B2 879 aa5.99□□□□□ -1.45
SPEN-204ENST00000471538 CPNE7Q9UBL6 633 aa5.99□□□□□ -1.45
SPEN-204ENST00000471538 WNT16Q9UBV4 365 aa5.99□□□□□ -1.45
SPEN-204ENST00000471538 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP5.99□□□□□ -1.45
SPEN-204ENST00000471538 ERGIC3Q9Y282 383 aa5.99□□□□□ -1.45
SPEN-204ENST00000471538 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa5.99□□□□□ -1.45
SPEN-204ENST00000471538 F5P12259 2224 aa5.99□□□□□ -1.45
SPEN-204ENST00000471538 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
SPEN-204ENST00000471538 A0A087WV62 115 aa5.99□□□□□ -1.45
SPEN-204ENST00000471538 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa5.99□□□□□ -1.45
SPEN-204ENST00000471538 A0A0G2JNG1 304 aa5.99□□□□□ -1.45
SPEN-204ENST00000471538 A0A0J9YY10 115 aa5.99□□□□□ -1.45
SPEN-204ENST00000471538 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa5.99□□□□□ -1.45
SPEN-204ENST00000471538 GSAPA4D1B5 854 aa5.99□□□□□ -1.45
SPEN-204ENST00000471538 URADA6NGE7 173 aa5.99□□□□□ -1.45
SPEN-204ENST00000471538 OR5K4A6NMS3 321 aa5.99□□□□□ -1.45
SPEN-204ENST00000471538 KIR2DS3K7RE56 304 aa5.99□□□□□ -1.45
SPEN-204ENST00000471538 M0R3G1 203 aa5.99□□□□□ -1.45
SPEN-204ENST00000471538 CYR61O00622 381 aa5.99□□□□□ -1.45
SPEN-204ENST00000471538 DSCR3O14972 297 aa5.99□□□□□ -1.45
SPEN-204ENST00000471538 MAGEB3O15480 346 aa5.99□□□□□ -1.45
SPEN-204ENST00000471538 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
SPEN-204ENST00000471538 KLF4O43474 513 aa5.99□□□□□ -1.45
SPEN-204ENST00000471538 B3GALT2O43825 422 aa5.99□□□□□ -1.45
SPEN-204ENST00000471538 AIREO43918 545 aa5.99□□□□□ -1.45
SPEN-204ENST00000471538 PRKYO43930 277 aa5.99□□□□□ -1.45
SPEN-204ENST00000471538 FCMRO60667 390 aa5.99□□□□□ -1.45
SPEN-204ENST00000471538 CYP7B1O75881 506 aa5.99□□□□□ -1.45
SPEN-204ENST00000471538 NADKO95544 446 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
SPEN-204ENST00000471538 AGR2O95994 175 aa5.99□□□□□ -1.45
SPEN-204ENST00000471538 ATP1B1P05026 303 aa5.99□□□□□ -1.45
SPEN-204ENST00000471538 DBTP11182 482 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
SPEN-204ENST00000471538 BMP4P12644 408 aa5.99□□□□□ -1.45
SPEN-204ENST00000471538 CPMP14384 443 aa5.99□□□□□ -1.45
SPEN-204ENST00000471538 PVRP15151 417 aa5.99□□□□□ -1.45
SPEN-204ENST00000471538 ZNF12P17014 697 aa5.99□□□□□ -1.45
SPEN-204ENST00000471538 ALOX12P18054 663 aa5.99□□□□□ -1.45
SPEN-204ENST00000471538 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
SPEN-204ENST00000471538 POU1F1P28069 291 aa5.99□□□□□ -1.45
SPEN-204ENST00000471538 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
SPEN-204ENST00000471538 OMPP47874 163 aa5.99□□□□□ -1.45
SPEN-204ENST00000471538 PCYT1AP49585 367 aa5.99□□□□□ -1.45
SPEN-204ENST00000471538 RGS6P49758 472 aa5.99□□□□□ -1.45
SPEN-204ENST00000471538 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
SPEN-204ENST00000471538 TUBA1BP68363 451 aa5.99□□□□□ -1.45
SPEN-204ENST00000471538 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
SPEN-204ENST00000471538 RHAGQ02094 409 aa5.99□□□□□ -1.45
SPEN-204ENST00000471538 OCA2Q04671 838 aa5.99□□□□□ -1.45
SPEN-204ENST00000471538 ZNF91Q05481 1191 aa5.99□□□□□ -1.45
SPEN-204ENST00000471538 MGAT2Q10469 447 aa5.99□□□□□ -1.45
SPEN-204ENST00000471538 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP5.99□□□□□ -1.45
SPEN-204ENST00000471538 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
SPEN-204ENST00000471538 FZD2Q14332 565 aa5.99□□□□□ -1.45
SPEN-204ENST00000471538 KIR2DS5Q14953 304 aa5.99□□□□□ -1.45
SPEN-204ENST00000471538 NCF4Q15080 339 aa5.99□□□□□ -1.45
SPEN-204ENST00000471538 SSX1Q16384 188 aa5.99□□□□□ -1.45
SPEN-204ENST00000471538 DUSP5Q16690 384 aa5.99□□□□□ -1.45
SPEN-204ENST00000471538 FAM214AQ32MH5 1076 aa5.99□□□□□ -1.45
SPEN-204ENST00000471538 ARMCX4Q5H9R4 360 aa5.99□□□□□ -1.45
SPEN-204ENST00000471538 ZNF311Q5JNZ3 666 aa5.99□□□□□ -1.45
SPEN-204ENST00000471538 MANEAQ5SRI9 462 aa5.99□□□□□ -1.45
SPEN-204ENST00000471538 ACSM5Q6NUN0 579 aa5.99□□□□□ -1.45
SPEN-204ENST00000471538 Q6ZS52 159 aa5.99□□□□□ -1.45
SPEN-204ENST00000471538 TUBA1AQ71U36 451 aa5.99□□□□□ -1.45
SPEN-204ENST00000471538 ABHD13Q7L211 337 aa5.99□□□□□ -1.45
SPEN-204ENST00000471538 PRSS41Q7RTY9 318 aa5.99□□□□□ -1.45
SPEN-204ENST00000471538 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa5.99□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms