RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 ELOCQ15369 112 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 OCLNQ16625 522 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 NDUFA9Q16795 377 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 C14orf28Q4W4Y0 310 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 FGD3Q5JSP0 725 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 GARNL3Q5VVW2 1013 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 GPR107Q5VW38 600 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 RNLSQ5VYX0 342 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF836Q6ZNA1 936 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 FAM92BQ6ZTR7 304 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 VRK2Q86Y07 508 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 OR4N5Q8IXE1 308 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 LINC00471Q8N535 108 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 FAM26EQ8N5C1 309 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 OR4K5Q8NGD3 323 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 OR9A4Q8NGU2 314 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 FAM81AQ8TBF8 368 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 TBC1D15Q8TC07 691 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 RAB2BQ8WUD1 216 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 GAB3Q8WWW8 586 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 GGHQ92820 318 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 CDS1Q92903 461 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 TCTN2Q96GX1 697 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 SHDQ96IW2 340 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 VSTM2LQ96N03 204 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 CD180Q99467 661 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 MAP3K3Q99759 626 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 PRSS27Q9BQR3 290 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 FUNDC2Q9BWH2 189 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 CDCA4Q9BXL8 241 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 UCK2Q9BZX2 261 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 ADNPQ9H2P0 1102 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 TBC1D17Q9HA65 648 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 VCX3AQ9NNX9 186 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 POLE3Q9NRF9 147 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 SEMA4GQ9NTN9 838 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 FBXO34Q9NWN3 711 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 UCKL1Q9NWZ5 548 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 TRPC4Q9UBN4 977 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 ENOPH1Q9UHY7 261 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 NCOR1O75376 2440 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 HEATR5AQ86XA9 2040 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 BLACEA4D250 179 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 CDHR4A6H8M9 788 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM247A6NEH6 219 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 CLCA1A8K7I4 914 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 SGK494L7N484 410 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 M0R129 80 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 FRS3O43559 492 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 BRINP1O60477 761 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 FMO6PO60774 539 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 CTNSO60931 367 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 LDB3O75112 727 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 UGT2B17O75795 530 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 OR5F1O95221 314 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 NTN1O95631 604 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 AK1P00568 194 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 IGKV1D-16P01601 117 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 ALPPP05187 535 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 CTSEP14091 401 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 NID1P14543 1247 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 MAOBP27338 520 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 HTR2AP28223 471 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 CSF2RBP32927 897 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 GALNSP34059 522 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 MAP2K4P45985 399 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 PRKAG1P54619 331 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 GFERP55789 205 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 PSG6Q00889 435 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 ID2Q02363 134 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 DMWDQ09019 674 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 FUT7Q11130 342 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 SQSTM1Q13501 440 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 SPCS2Q15005 226 aa5.25□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40 ms