RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
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RABGEF1-206ENST00000461017 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 RETREG3Q86VR2 466 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC22A16Q86VW1 577 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 CLECL1Q8IZS7 167 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC16A11Q8NCK7 471 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 NEIL3Q8TAT5 605 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM110BQ8TC76 370 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
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RABGEF1-206ENST00000461017 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
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RABGEF1-206ENST00000461017 COL21A1Q96P44 957 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 SERHL2Q9H4I8 314 aa6.39□□□□□ -1.39
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RABGEF1-206ENST00000461017 SERHLQ9NQF3 203 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 GIMAP4Q9NUV9 329 aa6.39□□□□□ -1.39
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RABGEF1-206ENST00000461017 CBLCQ9ULV8 474 aa6.39□□□□□ -1.39
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RABGEF1-206ENST00000461017 PRR14LQ5THK1 2151 aa6.39□□□□□ -1.39
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RABGEF1-206ENST00000461017 AKAP9Q99996 3911 aa6.38□□□□□ -1.39
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RABGEF1-206ENST00000461017 CAPN14A8MX76 684 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 NPIPA7E9PJI5 369 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 ACOT7O00154 380 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 AQP7O14520 342 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 TP53I11O14683 189 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 EMC8O43402 210 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 SUSD5O60279 629 aa6.38□□□□□ -1.39
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RABGEF1-206ENST00000461017 IL33O95760 270 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 AVPP01185 164 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 HPNP05981 417 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 NPIPA8P0DM63 369 aa6.38□□□□□ -1.39
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RABGEF1-206ENST00000461017 DCTP40126 519 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 ADH7P40394 386 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 KIR3DL1P43629 444 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 MAN2A2P49641 1150 aa6.38□□□□□ -1.39
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RABGEF1-206ENST00000461017 NME5P56597 212 aa6.38□□□□□ -1.39
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RABGEF1-206ENST00000461017 PGS1Q32NB8 556 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 GRAMD1BQ3KR37 738 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 CCNJQ5T5M9 372 aa6.38□□□□□ -1.39
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RABGEF1-206ENST00000461017 CAMKMTQ7Z624 323 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 CROCCP2Q86T23 111 aa6.38□□□□□ -1.39
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RABGEF1-206ENST00000461017 PSMA8Q8TAA3 256 aa6.38□□□□□ -1.39
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RABGEF1-206ENST00000461017 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
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RABGEF1-206ENST00000461017 OR52B2Q96RD2 323 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 TIMP4Q99727 224 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 DUSP26Q9BV47 211 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 OSBPL11Q9BXB4 747 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 UCK2Q9BZX2 261 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 LDAHQ9H6V9 325 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 METTL7AQ9H8H3 244 aa6.38□□□□□ -1.39
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