RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445241.5

PTPA-222, Transcript of protein phosphatase 2 phosphatase activator, human

TSL 3

Gene PTPA, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPA-222	ENST00000445241	SLC9A6	Q92581	669 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	NODAL	Q96S42	347 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	EBF4	Q9BQW3	602 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF703	Q9H7S9	590 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	ACKR4	Q9NPB9	350 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	KLRF1	Q9NZS2	232 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF835	Q9Y2P0	537 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PTPA-222	ENST00000445241	FLNC	Q14315	2725 aa		13.4	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	NCKAP5	O14513	1909 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	DIDO1	Q9BTC0	2240 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	RNF103-CHMP3	A0A140T963	221 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241		A0A1B0GVC2	190 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	OR14I1	A6ND48	311 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	SNPH	O15079	494 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	HCN1	O60741	890 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	ICOSLG	O75144	302 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	GUSB	P08236	651 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	ZCCHC18	P0CG32	403 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	EVI2B	P34910	448 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	SOAT1	P35610	550 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	PTGDS	P41222	190 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	ZFP36L2	P47974	494 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	UQCRFS1	P47985	274 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	MASP1	P48740	699 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	MAN2A2	P49641	1150 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	CLK3	P49761	638 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	ANXA11	P50995	505 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	NME5	P56597	212 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	POU6F2	P78424	691 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	MRPL49	Q13405	166 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	RCAN2	Q14206	197 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	SQLE	Q14534	574 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	SLC10A1	Q14973	349 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	DUSP5	Q16690	384 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	TIGD3	Q6B0B8	471 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	ARHGAP11A	Q6P4F7	1023 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM251	Q8N6I4	163 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	ADAMTS15	Q8TE58	950 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	OIT3	Q8WWZ8	545 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	EFHD2	Q96C19	240 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	NEURL3	Q96EH8	262 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	RMND5B	Q96G75	393 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	ITCH	Q96J02	903 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	PANX1	Q96RD7	426 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	UBQLN3	Q9H347	655 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	NPHS2	Q9NP85	383 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	SDHAF3	Q9NRP4	125 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	WIF1	Q9Y5W5	379 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	BAHCC1	Q9P281	2608 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	LRRK2	Q5S007	2527 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241		A0A1B0GUH1	482 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241		G3V3Y1	287 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	FADS1	O60427	444 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	NME6	O75414	186 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	KCNK2	O95069	426 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	CYP4B1	P13584	511 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	RFC3	P40938	356 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	TRPC1	P48995	793 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	DGKQ	P52824	942 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	CASP6	P55212	293 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	GUCY1A3	Q02108	690 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	FNDC7	Q5VTL7	733 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	AP1AR	Q63HQ0	302 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	SAXO2	Q658L1	398 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	C6orf120	Q7Z4R8	191 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	ANKRD46	Q86W74	232 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	EID3	Q8N140	333 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	OR52N2	Q8NGI0	321 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	OR1J4	Q8NGS1	313 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	TSPEAR	Q8WU66	669 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	JADE3	Q92613	823 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	SLC35G5	Q96KT7	338 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	MARK4	Q96L34	752 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	PHF12	Q96QT6	1004 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	HOXD1	Q9GZZ0	328 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	FGFR1OP2	Q9NVK5	253 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	C15orf41	Q9Y2V0	281 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	MRPS18C	Q9Y3D5	142 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241		A0A0G2JND7	137 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241		A0A1W2PQD3	144 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	GXYLT2	A0PJZ3	443 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	CCDC154	A6NI56	674 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	FAM166B	A8MTA8	275 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	RFXANK	O14593	260 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	SLC19A2	O60779	497 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	CBR3	O75828	277 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	CPSF4	O95639	269 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	HPN	P05981	417 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	VIM	P08670	466 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	ENDOU	P21128	410 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	TBXA2R	P21731	343 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	MATN1	P21941	496 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	MAGEA5	P43359	124 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	GAS1	P54826	345 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	KCNK10	P57789	538 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	C4orf17	Q53FE4	359 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	BICRAL	Q6AI39	1079 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	BLOC1S3	Q6QNY0	202 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	TRIL	Q7L0X0	811 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	WDR53	Q7Z5U6	358 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27

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