RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428120.5

FAAP20-209, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAAP20, Length 2,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-209ENST00000428120 TMEM9Q9P0T7 183 aa21.61■■□□□ 1.05
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FAAP20-209ENST00000428120 GALNT12Q8IXK2 581 aa21.6■■□□□ 1.05
FAAP20-209ENST00000428120 SLC35F3Q8IY50 421 aa21.6■■□□□ 1.05
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FAAP20-209ENST00000428120 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
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FAAP20-209ENST00000428120 ILKQ13418 452 aa21.6■■□□□ 1.05
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FAAP20-209ENST00000428120 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
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FAAP20-209ENST00000428120 GGHQ92820 318 aa21.6■■□□□ 1.05
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FAAP20-209ENST00000428120 STX11O75558 287 aa21.59■■□□□ 1.05
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FAAP20-209ENST00000428120 FAM53BQ14153 422 aa21.59■■□□□ 1.05
FAAP20-209ENST00000428120 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
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FAAP20-209ENST00000428120 ARSGQ96EG1 525 aa21.59■■□□□ 1.05
FAAP20-209ENST00000428120 ACOT13Q9NPJ3 140 aa21.59■■□□□ 1.05
FAAP20-209ENST00000428120 IFT52Q9Y366 437 aa21.59■■□□□ 1.05
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FAAP20-209ENST00000428120 TMBIM6P55061 237 aa21.58■■□□□ 1.05
FAAP20-209ENST00000428120 CFHR1Q03591 330 aa21.58■■□□□ 1.05
FAAP20-209ENST00000428120 OCA2Q04671 838 aa21.58■■□□□ 1.05
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FAAP20-209ENST00000428120 UBALD2Q8IYN6 164 aa21.58■■□□□ 1.05
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FAAP20-209ENST00000428120 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.04
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FAAP20-209ENST00000428120 SLC38A4Q969I6 547 aa21.58■■□□□ 1.04
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FAAP20-209ENST00000428120 STACQ99469 402 aa21.58■■□□□ 1.04
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FAAP20-209ENST00000428120 GKN3PP0CG01 181 aa21.57■■□□□ 1.04
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FAAP20-209ENST00000428120 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
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FAAP20-209ENST00000428120 FKBP10Q96AY3 582 aa21.57■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa21.57■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 CNIH4Q9P003 139 aa21.57■■□□□ 1.04
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FAAP20-209ENST00000428120 DTX4Q9Y2E6 619 aa21.57■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 CLDN16Q9Y5I7 305 aa21.57■■□□□ 1.04
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FAAP20-209ENST00000428120 OR4N2Q8NGD1 307 aa21.57■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 OR6C4Q8NGE1 309 aa21.57■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 OR51Q1Q8NH59 317 aa21.57■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 RNF31Q96EP0 1072 aa21.57■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 EPHA6Q9UF33 1036 aa21.57■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 STSP08842 583 aa21.56■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 CCNA2P20248 432 aa21.56■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 PGDP52209 483 aa21.56■■□□□ 1.04
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