RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000396352.8

HOXA3-202, Transcript of homeobox A3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXA3, Length 3,263 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3-202ENST00000396352 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP14.71□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 AVPR1BP47901 424 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 ST3GAL3Q11203 375 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 ZNF697Q5TEC3 545 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 TRILQ7L0X0 811 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 ACOT4Q8N9L9 421 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 PIGXQ8TBF5 258 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 NR4A3Q92570 626 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 ANKRD19PQ9H560 264 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 IL20Q9NYY1 176 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXA3-202ENST00000396352 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
HOXA3-202ENST00000396352 LYRM1O43325 122 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXA3-202ENST00000396352 ERI3O43414 337 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
HOXA3-202ENST00000396352 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
HOXA3-202ENST00000396352 ALX3O95076 343 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXA3-202ENST00000396352 HLA-DPB1P04440 258 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXA3-202ENST00000396352 CLTBP09497 229 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXA3-202ENST00000396352 CLDN20P56880 219 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXA3-202ENST00000396352 WSCD2Q2TBF2 565 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXA3-202ENST00000396352 TIGD3Q6B0B8 471 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXA3-202ENST00000396352 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
HOXA3-202ENST00000396352 GJD3Q8N144 294 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXA3-202ENST00000396352 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
HOXA3-202ENST00000396352 MOAP1Q96BY2 351 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXA3-202ENST00000396352 FERD3LQ96RJ6 166 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXA3-202ENST00000396352 BTBD1Q9H0C5 482 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXA3-202ENST00000396352 SYNPO2LQ9H987 977 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXA3-202ENST00000396352 EQTNQ9NQ60 294 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXA3-202ENST00000396352 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXA3-202ENST00000396352 TRPM6Q9BX84 2022 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXA3-202ENST00000396352 MYO7AQ13402 2215 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXA3-202ENST00000396352 FAM25AB3EWG3 89 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXA3-202ENST00000396352 FAM25CB3EWG5 89 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXA3-202ENST00000396352 FAM25GB3EWG6 89 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXA3-202ENST00000396352 FKTNO75072 461 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXA3-202ENST00000396352 SLC2A10O95528 541 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXA3-202ENST00000396352 MC3RP41968 323 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXA3-202ENST00000396352 GPR4P46093 362 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXA3-202ENST00000396352 FAPQ12884 760 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXA3-202ENST00000396352 ABHD17CQ6PCB6 329 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXA3-202ENST00000396352 TMEM91Q6ZNR0 172 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXA3-202ENST00000396352 KLHL36Q8N4N3 616 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXA3-202ENST00000396352 TTLQ8NG68 377 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXA3-202ENST00000396352 OR52N1Q8NH53 320 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXA3-202ENST00000396352 ZFAND1Q8TCF1 268 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXA3-202ENST00000396352 OSTF1Q92882 214 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXA3-202ENST00000396352 SLC6A20Q9NP91 592 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXA3-202ENST00000396352 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXA3-202ENST00000396352 NLKQ9UBE8 527 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXA3-202ENST00000396352 CBLCQ9ULV8 474 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXA3-202ENST00000396352 POLHQ9Y253 713 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXA3-202ENST00000396352 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXA3-202ENST00000396352 IGLON5A6NGN9 336 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXA3-202ENST00000396352 CD8B2A6NJW9 211 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXA3-202ENST00000396352 PIP5K1CO60331 668 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXA3-202ENST00000396352 CCNYL3P0C7X3 344 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXA3-202ENST00000396352 PRKAR1AP10644 381 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXA3-202ENST00000396352 CD8BP10966 210 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXA3-202ENST00000396352 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
HOXA3-202ENST00000396352 HTR1FP30939 366 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXA3-202ENST00000396352 DECR1Q16698 335 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXA3-202ENST00000396352 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
HOXA3-202ENST00000396352 PGGHGQ32M88 737 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXA3-202ENST00000396352 C1orf53Q5VUE5 145 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXA3-202ENST00000396352 MZT2BQ6NZ67 158 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXA3-202ENST00000396352 SLC48A1Q6P1K1 146 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXA3-202ENST00000396352 ZNF620Q6ZNG0 422 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXA3-202ENST00000396352 NR2C2APQ86WQ0 139 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXA3-202ENST00000396352 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
HOXA3-202ENST00000396352 CHFRQ96EP1 664 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXA3-202ENST00000396352 C12orf66Q96MD2 445 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXA3-202ENST00000396352 HDAC8Q9BY41 377 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXA3-202ENST00000396352 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
HOXA3-202ENST00000396352 J3QRE1 110 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXA3-202ENST00000396352 SGK494L7N484 410 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXA3-202ENST00000396352 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
HOXA3-202ENST00000396352 CCL5P13501 91 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXA3-202ENST00000396352 F3P13726 295 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXA3-202ENST00000396352 VIPR2P41587 438 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXA3-202ENST00000396352 STAT5AP42229 794 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXA3-202ENST00000396352 DEFB115Q30KQ5 88 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXA3-202ENST00000396352 SIRT6Q8N6T7 355 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXA3-202ENST00000396352 OR9A2Q8NGT5 310 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXA3-202ENST00000396352 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
HOXA3-202ENST00000396352 MARVELD1Q9BSK0 173 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXA3-202ENST00000396352 JAM3Q9BX67 310 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXA3-202ENST00000396352 MED17Q9NVC6 651 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXA3-202ENST00000396352 IL20RAQ9UHF4 553 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXA3-202ENST00000396352 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXA3-202ENST00000396352 EMC8O43402 210 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXA3-202ENST00000396352 CHST10O43529 356 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXA3-202ENST00000396352 CERS1P27544 350 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXA3-202ENST00000396352 RAB28P51157 221 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXA3-202ENST00000396352 ABATP80404 500 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXA3-202ENST00000396352 PRR5P85299 388 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXA3-202ENST00000396352 TGM3Q08188 693 aa14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.6 ms