RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376233.7

ZNF549-202, Transcript of zinc finger protein 549, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF549, Length 4,053 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF549-202ENST00000376233 STX11O75558 287 aa9.96□□□□□ -0.82
ZNF549-202ENST00000376233 NTN1O95631 604 aa9.96□□□□□ -0.82
ZNF549-202ENST00000376233 BMP8BP34820 402 aa9.96□□□□□ -0.82
ZNF549-202ENST00000376233 RPE65Q16518 533 aa9.96□□□□□ -0.82
ZNF549-202ENST00000376233 LRIT3Q3SXY7 679 aa9.96□□□□□ -0.82
ZNF549-202ENST00000376233 EIPR1Q53HC9 387 aa9.96□□□□□ -0.82
ZNF549-202ENST00000376233 SYT14P1Q58G82 188 aa9.96□□□□□ -0.82
ZNF549-202ENST00000376233 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa9.96□□□□□ -0.82
ZNF549-202ENST00000376233 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa9.96□□□□□ -0.82
ZNF549-202ENST00000376233 CAMKVQ8NCB2 501 aa9.96□□□□□ -0.82
ZNF549-202ENST00000376233 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
ZNF549-202ENST00000376233 OR52I1Q8NGK6 324 aa9.96□□□□□ -0.82
ZNF549-202ENST00000376233 ZG16BQ96DA0 208 aa9.96□□□□□ -0.82
ZNF549-202ENST00000376233 OPALINQ96PE5 141 aa9.96□□□□□ -0.82
ZNF549-202ENST00000376233 KCNN2Q9H2S1 579 aa9.96□□□□□ -0.82
ZNF549-202ENST00000376233 PHF11Q9UIL8 331 aa9.96□□□□□ -0.82
ZNF549-202ENST00000376233 A0A087WUU8 490 aa9.96□□□□□ -0.82
ZNF549-202ENST00000376233 HTR3EA5X5Y0 456 aa9.96□□□□□ -0.82
ZNF549-202ENST00000376233 A8MUA0 341 aa9.96□□□□□ -0.82
ZNF549-202ENST00000376233 LRRTM2O43300 516 aa9.96□□□□□ -0.82
ZNF549-202ENST00000376233 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
ZNF549-202ENST00000376233 IFNGP01579 166 aa9.96□□□□□ -0.82
ZNF549-202ENST00000376233 HLA-DQA2P01906 255 aa9.96□□□□□ -0.82
ZNF549-202ENST00000376233 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
ZNF549-202ENST00000376233 PYCR1P32322 319 aa9.96□□□□□ -0.82
ZNF549-202ENST00000376233 ETV5P41161 510 aa9.96□□□□□ -0.82
ZNF549-202ENST00000376233 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
ZNF549-202ENST00000376233 ETV1P50549 477 aa9.96□□□□□ -0.82
ZNF549-202ENST00000376233 ABATP80404 500 aa9.96□□□□□ -0.82
ZNF549-202ENST00000376233 PRKCDQ05655 676 aa9.96□□□□□ -0.82
ZNF549-202ENST00000376233 DPTQ07507 201 aa9.96□□□□□ -0.82
ZNF549-202ENST00000376233 E2F2Q14209 437 aa9.96□□□□□ -0.82
ZNF549-202ENST00000376233 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
ZNF549-202ENST00000376233 MINDY4Q4G0A6 757 aa9.96□□□□□ -0.82
ZNF549-202ENST00000376233 ABHD17CQ6PCB6 329 aa9.96□□□□□ -0.82
ZNF549-202ENST00000376233 FAM111BQ6SJ93 734 aa9.96□□□□□ -0.82
ZNF549-202ENST00000376233 GDPD3Q7L5L3 318 aa9.96□□□□□ -0.82
ZNF549-202ENST00000376233 NKAIN4Q8IVV8 208 aa9.96□□□□□ -0.82
ZNF549-202ENST00000376233 SAMD12Q8N8I0 201 aa9.96□□□□□ -0.82
ZNF549-202ENST00000376233 TBC1D20Q96BZ9 403 aa9.96□□□□□ -0.82
ZNF549-202ENST00000376233 COQ7Q99807 217 aa9.96□□□□□ -0.82
ZNF549-202ENST00000376233 SIAEQ9HAT2 523 aa9.96□□□□□ -0.82
ZNF549-202ENST00000376233 FGF22Q9HCT0 170 aa9.96□□□□□ -0.82
ZNF549-202ENST00000376233 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
ZNF549-202ENST00000376233 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
ZNF549-202ENST00000376233 EXTL2Q9UBQ6 330 aa9.96□□□□□ -0.82
ZNF549-202ENST00000376233 MED31Q9Y3C7 131 aa9.96□□□□□ -0.82
ZNF549-202ENST00000376233 A0A1W2PRG6 482 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF549-202ENST00000376233 FFAR1O14842 300 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF549-202ENST00000376233 IL7P13232 177 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF549-202ENST00000376233 ALAS2P22557 587 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF549-202ENST00000376233 MAN2A2P49641 1150 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF549-202ENST00000376233 MVDP53602 400 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF549-202ENST00000376233 CRYBA2P53672 197 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF549-202ENST00000376233 RHAGQ02094 409 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF549-202ENST00000376233 PDE7AQ13946 482 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF549-202ENST00000376233 TMEM52BQ4KMG9 183 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF549-202ENST00000376233 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF549-202ENST00000376233 ABHD13Q7L211 337 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF549-202ENST00000376233 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
ZNF549-202ENST00000376233 DEFB119Q8N690 84 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF549-202ENST00000376233 LINC01555Q8NAE3 123 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF549-202ENST00000376233 OR4C15Q8NGM1 316 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF549-202ENST00000376233 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
ZNF549-202ENST00000376233 HCAR2Q8TDS4 363 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF549-202ENST00000376233 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
ZNF549-202ENST00000376233 NEDD4LQ96PU5 975 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF549-202ENST00000376233 PINK1Q9BXM7 581 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF549-202ENST00000376233 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
ZNF549-202ENST00000376233 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF549-202ENST00000376233 A6NL46 340 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF549-202ENST00000376233 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
ZNF549-202ENST00000376233 PROM1O43490 865 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF549-202ENST00000376233 UBXN7O94888 489 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF549-202ENST00000376233 ITPKBP27987 946 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF549-202ENST00000376233 RCVRNP35243 200 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF549-202ENST00000376233 PDX1P52945 283 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF549-202ENST00000376233 EPHA5P54756 1037 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF549-202ENST00000376233 ZNF793Q6ZN11 406 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF549-202ENST00000376233 NLRP8Q86W28 1048 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF549-202ENST00000376233 PHC2Q8IXK0 858 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF549-202ENST00000376233 OR2A1Q8NGT9 310 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF549-202ENST00000376233 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
ZNF549-202ENST00000376233 ING3Q9NXR8 418 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF549-202ENST00000376233 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF549-202ENST00000376233 SPTBP11277 2137 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF549-202ENST00000376233 POM121BA6NF01 834 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF549-202ENST00000376233 PRAMEF25A6NGN4 478 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF549-202ENST00000376233 DSCR3O14972 297 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF549-202ENST00000376233 SSX4O60224 188 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF549-202ENST00000376233 PIP5K1CO60331 668 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF549-202ENST00000376233 TGM1P22735 817 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF549-202ENST00000376233 NDUFS1P28331 727 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF549-202ENST00000376233 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
ZNF549-202ENST00000376233 FLYWCH1Q4VC44 716 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF549-202ENST00000376233 CNIH2Q6PI25 160 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF549-202ENST00000376233 FIGLAQ6QHK4 219 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF549-202ENST00000376233 RTL4Q6ZR62 310 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF549-202ENST00000376233 OAFQ86UD1 273 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF549-202ENST00000376233 ACBD7Q8N6N7 88 aa9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.3 ms