RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000371219.2

RBM38-204, Transcript of RNA binding motif protein 38, human

TSL 2 BASIC

Gene RBM38, Length 760 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM38-204	ENST00000371219	CNOT11	Q9UKZ1	510 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	LIPT1	Q9Y234	373 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	PCDHB14	Q9Y5E9	798 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	ZNF462	Q96JM2	2506 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	DNAJC13	O75165	2243 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	NBAS	A2RRP1	2371 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	PRAMEF25	A6NGN4	478 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219		B8ZZF3	427 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	UGT2B11	O75310	529 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	REM1	O75628	298 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	CCL3	P10147	92 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	BMP2	P12643	396 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	CNR1	P21554	472 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	ELAVL4	P26378	380 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	PRDX6	P30041	224 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	EVI2B	P34910	448 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	CYLC2	Q14093	348 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	GNA13	Q14344	377 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	HYAL4	Q2M3T9	481 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	ARHGAP11B	Q3KRB8	267 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	PAGE3	Q5JUK9	113 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	DCST2	Q5T1A1	773 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	HEPHL1	Q6MZM0	1159 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	SLC30A6	Q6NXT4	461 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	FAM180A	Q6UWF9	173 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	ANGPTL8	Q6UXH0	198 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	BNC2	Q6ZN30	1099 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	GALNTL5	Q7Z4T8	443 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	DHDDS	Q86SQ9	333 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	RNF130	Q86XS8	419 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	PTRH1	Q86Y79	214 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	PRR22	Q8IZ63	422 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	ZNF843	Q8N446	348 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	ZNF527	Q8NB42	609 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	OR4N2	Q8NGD1	307 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	CDS1	Q92903	461 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	CMTM5	Q96DZ9	223 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	TMEM41A	Q96HV5	264 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	FRMD6	Q96NE9	622 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	LRRC37B	Q96QE4	947 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	ADO	Q96SZ5	270 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	BARD1	Q99728	777 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	CCDC106	Q9BWC9	280 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	ANGPTL4	Q9BY76	406 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	OR51I1	Q9H343	314 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	SERHL2	Q9H4I8	314 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	METTL7A	Q9H8H3	244 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	SLC6A13	Q9NSD5	602 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	BOK	Q9UMX3	212 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	ACOT7	O00154	380 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	CLIC1	O00299	241 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	PEX1	O43933	1283 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	NME6	O75414	186 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	C1QL1	O75973	258 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	GSN	P06396	782 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	FREM3	P0C091	2139 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	ENDOU	P21128	410 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	ATP6V1C1	P21283	382 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	CASP3	P42574	277 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	MVD	P53602	400 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	HPCA	P84074	193 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	MMEL1	Q495T6	779 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	DLEU7	Q6UYE1	221 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	C16orf62	Q7Z3J2	963 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	WDR53	Q7Z5U6	358 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	PACS2	Q86VP3	889 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	SNX32	Q86XE0	403 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	ZGRF1	Q86YA3	2104 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	SULF2	Q8IWU5	870 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	CCDC197	Q8NCU1	140 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	OR2M7	Q8NG81	312 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	FBXO30	Q8TB52	745 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	PIK3R3	Q92569	461 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	EFHD2	Q96C19	240 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	ROPN1L	Q96C74	230 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	ZNF597	Q96LX8	424 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	TRNT1	Q96Q11	434 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	SH3GL1	Q99961	368 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	DOHH	Q9BU89	302 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	OSBPL11	Q9BXB4	747 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	ZNF350	Q9GZX5	532 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	KLHL1	Q9NR64	748 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	UBQLN4	Q9NRR5	601 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	AGPAT4	Q9NRZ5	378 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	SLC25A37	Q9NYZ2	338 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	CALML5	Q9NZT1	146 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	VAPA	Q9P0L0	249 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	ARMCX1	Q9P291	453 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	P2RX2	Q9UBL9	471 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	ZNF407	Q9C0G0	2248 aa		13.52	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	C15orf38-AP3S2	A0A0A6YYH1	394 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBM38-204	ENST00000371219		A0A1W2PQD3	144 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBM38-204	ENST00000371219	GXYLT2	A0PJZ3	443 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBM38-204	ENST00000371219	TMEM247	A6NEH6	219 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBM38-204	ENST00000371219	EVPLL	A8MZ36	301 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBM38-204	ENST00000371219	HMGN4	O00479	90 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBM38-204	ENST00000371219	MRAS	O14807	208 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBM38-204	ENST00000371219	ICOSLG	O75144	302 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBM38-204	ENST00000371219	TRIM3	O75382	744 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
RBM38-204	ENST00000371219	STX11	O75558	287 aa		13.52	□□□□□ -0.25

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