RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367364.5

PTPRC-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-202ENST00000367364 DMAC2Q9NW81 257 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 MAT2BQ9NZL9 334 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 EMC3Q9P0I2 261 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 OPTCQ9UBM4 332 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 EXTL2Q9UBQ6 330 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 MAD2L2Q9UI95 211 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 EMCNQ9ULC0 261 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 SNX8Q9Y5X2 465 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 FKBP7Q9Y680 259 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 CHD5Q8TDI0 1954 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 ASTN1O14525 1302 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 RGSL1A5PLK6 1076 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 CLDN24A6NM45 220 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 MPTX1A8MV57 137 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 LINC00587B1AMM8 73 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 H3BQ06 376 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 COPEO14579 308 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 CLDN3O15551 220 aa3.23□□□□□ -1.89
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PTPRC-202ENST00000367364 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 AVILO75366 819 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 LRCH4O75427 683 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 PRDM1O75626 825 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 TOM1L1O75674 476 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 SLC22A5O76082 557 aa3.23□□□□□ -1.89
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PTPRC-202ENST00000367364 APBB3O95704 486 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 TGM6O95932 706 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 FTH1P02794 183 aa3.23□□□□□ -1.89
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PTPRC-202ENST00000367364 RBP1P09455 135 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 PSKH1P11801 424 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 GFAPP14136 432 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF250P15622 560 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
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PTPRC-202ENST00000367364 HLA-FP30511 346 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 HOXC9P31274 260 aa3.23□□□□□ -1.89
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PTPRC-202ENST00000367364 GABRB2P47870 512 aa3.23□□□□□ -1.89
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PTPRC-202ENST00000367364 RGS1Q08116 209 aa3.23□□□□□ -1.89
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PTPRC-202ENST00000367364 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 RADILQ96JH8 1075 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 ELMO2Q96JJ3 720 aa3.23□□□□□ -1.89
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