RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356183.8

GTF3C1-201, Transcript of general transcription factor IIIC subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene GTF3C1, Length 7,018 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1-201ENST00000356183 NPIPA7E9PJI5 369 aa10.48□□□□□ -0.73
GTF3C1-201ENST00000356183 SMLR1H3BR10 107 aa10.48□□□□□ -0.73
GTF3C1-201ENST00000356183 HCRTO43612 131 aa10.48□□□□□ -0.73
GTF3C1-201ENST00000356183 NPIPA8P0DM63 369 aa10.48□□□□□ -0.73
GTF3C1-201ENST00000356183 PNMTP11086 282 aa10.48□□□□□ -0.73
GTF3C1-201ENST00000356183 ETFAP13804 333 aa10.48□□□□□ -0.73
GTF3C1-201ENST00000356183 PRSS3P35030 304 aa10.48□□□□□ -0.73
GTF3C1-201ENST00000356183 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
GTF3C1-201ENST00000356183 SRYQ05066 204 aa10.48□□□□□ -0.73
GTF3C1-201ENST00000356183 RAB31Q13636 194 aa10.48□□□□□ -0.73
GTF3C1-201ENST00000356183 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
GTF3C1-201ENST00000356183 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa10.48□□□□□ -0.73
GTF3C1-201ENST00000356183 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
GTF3C1-201ENST00000356183 SAMD8Q96LT4 415 aa10.48□□□□□ -0.73
GTF3C1-201ENST00000356183 ANKRD28O15084 1053 aa10.48□□□□□ -0.73
GTF3C1-201ENST00000356183 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
GTF3C1-201ENST00000356183 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
GTF3C1-201ENST00000356183 OR51D1Q8NGF3 324 aa10.48□□□□□ -0.73
GTF3C1-201ENST00000356183 MITD1Q8WV92 249 aa10.48□□□□□ -0.73
GTF3C1-201ENST00000356183 ELP4Q96EB1 424 aa10.48□□□□□ -0.73
GTF3C1-201ENST00000356183 HS6ST2Q96MM7 605 aa10.48□□□□□ -0.73
GTF3C1-201ENST00000356183 MICU1Q9BPX6 476 aa10.48□□□□□ -0.73
GTF3C1-201ENST00000356183 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
GTF3C1-201ENST00000356183 INPP5KQ9BT40 448 aa10.48□□□□□ -0.73
GTF3C1-201ENST00000356183 CRB3Q9BUF7 120 aa10.48□□□□□ -0.73
GTF3C1-201ENST00000356183 SUCNR1Q9BXA5 334 aa10.48□□□□□ -0.73
GTF3C1-201ENST00000356183 OR51B6Q9H340 312 aa10.48□□□□□ -0.73
GTF3C1-201ENST00000356183 NTN4Q9HB63 628 aa10.48□□□□□ -0.73
GTF3C1-201ENST00000356183 GMEB2Q9UKD1 530 aa10.48□□□□□ -0.73
GTF3C1-201ENST00000356183 POU2F3Q9UKI9 436 aa10.48□□□□□ -0.73
GTF3C1-201ENST00000356183 TRAPPC13A5PLN9 417 aa10.48□□□□□ -0.73
GTF3C1-201ENST00000356183 PEX12O00623 359 aa10.48□□□□□ -0.73
GTF3C1-201ENST00000356183 YY2O15391 372 aa10.48□□□□□ -0.73
GTF3C1-201ENST00000356183 CD1DP15813 335 aa10.48□□□□□ -0.73
GTF3C1-201ENST00000356183 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
GTF3C1-201ENST00000356183 FBXW12Q6X9E4 464 aa10.48□□□□□ -0.73
GTF3C1-201ENST00000356183 OR51L1Q8NGJ5 315 aa10.48□□□□□ -0.73
GTF3C1-201ENST00000356183 SLC2A12Q8TD20 617 aa10.48□□□□□ -0.73
GTF3C1-201ENST00000356183 TMEM234Q8WY98 164 aa10.48□□□□□ -0.73
GTF3C1-201ENST00000356183 UQCC2Q9BRT2 126 aa10.48□□□□□ -0.73
GTF3C1-201ENST00000356183 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
GTF3C1-201ENST00000356183 SLC28A3Q9HAS3 691 aa10.48□□□□□ -0.73
GTF3C1-201ENST00000356183 RICTORQ6R327 1708 aa10.47□□□□□ -0.73
GTF3C1-201ENST00000356183 EMC8O43402 210 aa10.47□□□□□ -0.73
GTF3C1-201ENST00000356183 ACTL6BO94805 426 aa10.47□□□□□ -0.73
GTF3C1-201ENST00000356183 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
GTF3C1-201ENST00000356183 VEGFCP49767 419 aa10.47□□□□□ -0.73
GTF3C1-201ENST00000356183 CDKN2DP55273 166 aa10.47□□□□□ -0.73
GTF3C1-201ENST00000356183 RGMBQ6NW40 437 aa10.47□□□□□ -0.73
GTF3C1-201ENST00000356183 MAPK15Q8TD08 544 aa10.47□□□□□ -0.73
GTF3C1-201ENST00000356183 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
GTF3C1-201ENST00000356183 ZNF382Q96SR6 550 aa10.47□□□□□ -0.73
GTF3C1-201ENST00000356183 FEVQ99581 238 aa10.47□□□□□ -0.73
GTF3C1-201ENST00000356183 SLC19A3Q9BZV2 496 aa10.47□□□□□ -0.73
GTF3C1-201ENST00000356183 MYH7BA7E2Y1 1941 aa10.47□□□□□ -0.73
GTF3C1-201ENST00000356183 GSRP00390 522 aa10.47□□□□□ -0.73
GTF3C1-201ENST00000356183 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
GTF3C1-201ENST00000356183 ALKAL2Q6UX46 152 aa10.47□□□□□ -0.73
GTF3C1-201ENST00000356183 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
GTF3C1-201ENST00000356183 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa10.47□□□□□ -0.73
GTF3C1-201ENST00000356183 OR5H6Q8NGV6 325 aa10.47□□□□□ -0.73
GTF3C1-201ENST00000356183 PEBP4Q96S96 227 aa10.47□□□□□ -0.73
GTF3C1-201ENST00000356183 MRI1Q9BV20 369 aa10.47□□□□□ -0.73
GTF3C1-201ENST00000356183 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
GTF3C1-201ENST00000356183 HEBP1Q9NRV9 189 aa10.47□□□□□ -0.73
GTF3C1-201ENST00000356183 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
GTF3C1-201ENST00000356183 MYH3P11055 1940 aa10.47□□□□□ -0.73
GTF3C1-201ENST00000356183 WASH4PA8MWX3 477 aa10.47□□□□□ -0.73
GTF3C1-201ENST00000356183 FBXO24O75426 580 aa10.47□□□□□ -0.73
GTF3C1-201ENST00000356183 GMPRP36959 345 aa10.47□□□□□ -0.73
GTF3C1-201ENST00000356183 KCNQ1P51787 676 aa10.47□□□□□ -0.73
GTF3C1-201ENST00000356183 IL13RA1P78552 427 aa10.47□□□□□ -0.73
GTF3C1-201ENST00000356183 SORDQ00796 357 aa10.47□□□□□ -0.73
GTF3C1-201ENST00000356183 KCNC3Q14003 757 aa10.47□□□□□ -0.73
GTF3C1-201ENST00000356183 UNC50Q53HI1 259 aa10.47□□□□□ -0.73
GTF3C1-201ENST00000356183 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
GTF3C1-201ENST00000356183 IL20RBQ6UXL0 311 aa10.47□□□□□ -0.73
GTF3C1-201ENST00000356183 ZNF100Q8IYN0 542 aa10.47□□□□□ -0.73
GTF3C1-201ENST00000356183 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
GTF3C1-201ENST00000356183 OR8J1Q8NGP2 316 aa10.47□□□□□ -0.73
GTF3C1-201ENST00000356183 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
GTF3C1-201ENST00000356183 DPF1Q92782 380 aa10.47□□□□□ -0.73
GTF3C1-201ENST00000356183 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
GTF3C1-201ENST00000356183 FBXL12Q9NXK8 326 aa10.47□□□□□ -0.73
GTF3C1-201ENST00000356183 SERTAD3Q9UJW9 196 aa10.47□□□□□ -0.73
GTF3C1-201ENST00000356183 A0A0B4J2A0 478 aa10.47□□□□□ -0.73
GTF3C1-201ENST00000356183 DCDC2BA2VCK2 349 aa10.47□□□□□ -0.73
GTF3C1-201ENST00000356183 CD300LBA8K4G0 201 aa10.47□□□□□ -0.73
GTF3C1-201ENST00000356183 PHYHO14832 338 aa10.47□□□□□ -0.73
GTF3C1-201ENST00000356183 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
GTF3C1-201ENST00000356183 SERPINA5P05154 406 aa10.47□□□□□ -0.73
GTF3C1-201ENST00000356183 TFAP2AP05549 437 aa10.47□□□□□ -0.73
GTF3C1-201ENST00000356183 CSF1P09603 554 aa10.47□□□□□ -0.73
GTF3C1-201ENST00000356183 PSMB10P40306 273 aa10.47□□□□□ -0.73
GTF3C1-201ENST00000356183 TAS2R31P59538 309 aa10.47□□□□□ -0.73
GTF3C1-201ENST00000356183 FAM69BQ5VUD6 431 aa10.47□□□□□ -0.73
GTF3C1-201ENST00000356183 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa10.47□□□□□ -0.73
GTF3C1-201ENST00000356183 BRAT1Q6PJG6 821 aa10.47□□□□□ -0.73
GTF3C1-201ENST00000356183 C6orf120Q7Z4R8 191 aa10.47□□□□□ -0.73
GTF3C1-201ENST00000356183 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.6 ms