RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000353258.7

GDE1-201, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GDE1, Length 2,958 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-201ENST00000353258 CBSP35520 551 aa15.8■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 BLVRAP53004 296 aa15.8■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP15.8■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 B4GALNT1Q00973 533 aa15.8■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 ATRAIDQ6UW56 229 aa15.8■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 FGD2Q7Z6J4 655 aa15.8■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 OAFQ86UD1 273 aa15.8■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 SIAH3Q8IW03 269 aa15.8■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 UXS1Q8NBZ7 420 aa15.8■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 WFDC6Q9BQY6 131 aa15.8■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 CHIAQ9BZP6 476 aa15.8■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 C11orf49Q9H6J7 331 aa15.8■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 FAM170BA6NMN3 283 aa15.79■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 LEFTY2O00292 366 aa15.79■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 LRG1P02750 347 aa15.79■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 ACSL1P33121 698 aa15.79■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 SLC1A3P43003 542 aa15.79■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 TCTE1Q5JU00 501 aa15.79■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 LIPJQ5W064 366 aa15.79■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 TOMM5Q8N4H5 51 aa15.79■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 MOSPD2Q8NHP6 518 aa15.79■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 WDR48Q8TAF3 677 aa15.79■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 VOPP1Q96AW1 172 aa15.79■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 ELMOD3Q96FG2 381 aa15.79■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 CD93Q9NPY3 652 aa15.79■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa15.79■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 OR6C2Q9NZP2 312 aa15.79■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa15.79■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 ALDOBP05062 364 aa15.79■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP15.79■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 KIAA1024LP59773 190 aa15.79■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 RPS26P62854 115 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 PTSQ03393 145 aa15.79■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 GNA13Q14344 377 aa15.79■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 MPEG1Q2M385 716 aa15.79■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 VASNQ6EMK4 673 aa15.79■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 CHST14Q8NCH0 376 aa15.79■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 COQ8AQ8NI60 647 aa15.79■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 FIBINQ8TAL6 211 aa15.79■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 ASB11Q8WXH4 323 aa15.79■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 GIMAP5Q96F15 307 aa15.79■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 NPAS1Q99742 590 aa15.79■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 SLC46A2Q9BY10 475 aa15.79■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 SERHL2Q9H4I8 314 aa15.79■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 SGK2Q9HBY8 427 aa15.79■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 HPF1Q9NWY4 346 aa15.79■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 NPTNQ9Y639 398 aa15.79■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 EPHX1P07099 455 aa15.78■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 ACRP10323 421 aa15.78■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 DRD5P21918 477 aa15.78■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 RFX3P48380 749 aa15.78■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 REEP3Q6NUK4 255 aa15.78■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 FAM198BQ6UWH4 519 aa15.78■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 Q6ZVU0 165 aa15.78■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 HTR3DQ70Z44 454 aa15.78■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa15.78■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 OR4D11Q8NGI4 311 aa15.78■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 CFHR5Q9BXR6 569 aa15.78■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 SUV39H2Q9H5I1 410 aa15.78■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 REEP4Q9H6H4 257 aa15.78■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 FBXL2Q9UKC9 423 aa15.78■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 DENND4CQ5VZ89 1909 aa15.78■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 CDH23Q9H251 3354 aa15.78■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 CCL16O15467 120 aa15.78■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 BCHEP06276 602 aa15.78■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 C8GP07360 202 aa15.78■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 PEPDP12955 493 aa15.78■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 MMP11P24347 488 aa15.78■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 NSG1P42857 185 aa15.78■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 RPS7P62081 194 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 EOGTQ5NDL2 527 aa15.78■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 HBMQ6B0K9 141 aa15.78■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 C22orf39Q6P5X5 142 aa15.78■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa15.78■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 TPRG1Q6ZUI0 275 aa15.78■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 RRM2BQ7LG56 351 aa15.78■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa15.78■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 TMEM25Q86YD3 366 aa15.78■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 CLRN3Q8NCR9 226 aa15.78■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 OR4F15Q8NGB8 312 aa15.78■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 GPA33Q99795 319 aa15.78■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa15.78■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa15.78■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 CBLCQ9ULV8 474 aa15.78■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 PDCD5O14737 125 aa15.78■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 SOX30O94993 753 aa15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms