RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335475.5

KCNQ1-202, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNQ1, Length 2,159 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-202ENST00000335475 PTGFRNQ9P2B2 879 aa19.39■□□□□ 0.69
KCNQ1-202ENST00000335475 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP19.38■□□□□ 0.69
KCNQ1-202ENST00000335475 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP19.38■□□□□ 0.69
KCNQ1-202ENST00000335475 HYKKA2RU49 373 aa19.38■□□□□ 0.69
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF860A6NHJ4 632 aa19.38■□□□□ 0.69
KCNQ1-202ENST00000335475 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP19.38■□□□□ 0.69
KCNQ1-202ENST00000335475 AGR2O95994 175 aa19.38■□□□□ 0.69
KCNQ1-202ENST00000335475 CPMP14384 443 aa19.38■□□□□ 0.69
KCNQ1-202ENST00000335475 FPR3P25089 353 aa19.38■□□□□ 0.69
KCNQ1-202ENST00000335475 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP19.38■□□□□ 0.69
KCNQ1-202ENST00000335475 CDC20Q12834 499 aa19.38■□□□□ 0.69
KCNQ1-202ENST00000335475 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa19.38■□□□□ 0.69
KCNQ1-202ENST00000335475 PRSS41Q7RTY9 318 aa19.38■□□□□ 0.69
KCNQ1-202ENST00000335475 GDF7Q7Z4P5 450 aa19.38■□□□□ 0.69
KCNQ1-202ENST00000335475 PIGXQ8TBF5 258 aa19.38■□□□□ 0.69
KCNQ1-202ENST00000335475 SLC9A6Q92581 669 aa19.38■□□□□ 0.69
KCNQ1-202ENST00000335475 ITFG2Q969R8 447 aa19.38■□□□□ 0.69
KCNQ1-202ENST00000335475 MCHR1Q99705 422 aa19.38■□□□□ 0.69
KCNQ1-202ENST00000335475 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa19.38■□□□□ 0.69
KCNQ1-202ENST00000335475 CNPPD1Q9BV87 410 aa19.38■□□□□ 0.69
KCNQ1-202ENST00000335475 KLHL28Q9NXS3 571 aa19.38■□□□□ 0.69
KCNQ1-202ENST00000335475 URADA6NGE7 173 aa19.37■□□□□ 0.69
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa19.37■□□□□ 0.69
KCNQ1-202ENST00000335475 OR5F1O95221 314 aa19.37■□□□□ 0.69
KCNQ1-202ENST00000335475 YPEL5P62699 121 aa19.37■□□□□ 0.69
KCNQ1-202ENST00000335475 SLC13A2Q13183 592 aa19.37■□□□□ 0.69
KCNQ1-202ENST00000335475 MINDY4Q4G0A6 757 aa19.37■□□□□ 0.69
KCNQ1-202ENST00000335475 CAMKVQ8NCB2 501 aa19.37■□□□□ 0.69
KCNQ1-202ENST00000335475 FAM3CQ92520 227 aa19.37■□□□□ 0.69
KCNQ1-202ENST00000335475 SP140LQ9H930 580 aa19.37■□□□□ 0.69
KCNQ1-202ENST00000335475 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP19.37■□□□□ 0.69
KCNQ1-202ENST00000335475 CARD8Q9Y2G2 431 aa19.37■□□□□ 0.69
KCNQ1-202ENST00000335475 GPR52Q9Y2T5 361 aa19.37■□□□□ 0.69
KCNQ1-202ENST00000335475 WDR45Q9Y484 360 aa19.37■□□□□ 0.69
KCNQ1-202ENST00000335475 AP3D1O14617 1153 aa19.37■□□□□ 0.69
KCNQ1-202ENST00000335475 PIP5K1CO60331 668 aa19.37■□□□□ 0.69
KCNQ1-202ENST00000335475 PVRP15151 417 aa19.37■□□□□ 0.69
KCNQ1-202ENST00000335475 ALOX12P18054 663 aa19.37■□□□□ 0.69
KCNQ1-202ENST00000335475 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP19.37■□□□□ 0.69
KCNQ1-202ENST00000335475 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP19.37■□□□□ 0.69
KCNQ1-202ENST00000335475 RPS19P39019 145 aaKnown RBP19.37■□□□□ 0.69
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF136P52737 540 aa19.37■□□□□ 0.69
KCNQ1-202ENST00000335475 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP19.37■□□□□ 0.69
KCNQ1-202ENST00000335475 C1DQ13901 141 aaKnown RBP19.37■□□□□ 0.69
KCNQ1-202ENST00000335475 LIPKQ5VXJ0 399 aa19.37■□□□□ 0.69
KCNQ1-202ENST00000335475 ABHD13Q7L211 337 aa19.37■□□□□ 0.69
KCNQ1-202ENST00000335475 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa19.37■□□□□ 0.69
KCNQ1-202ENST00000335475 TMEM52Q8NDY8 209 aa19.37■□□□□ 0.69
KCNQ1-202ENST00000335475 OR4Q3Q8NH05 313 aa19.37■□□□□ 0.69
KCNQ1-202ENST00000335475 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa19.37■□□□□ 0.69
KCNQ1-202ENST00000335475 RSC1A1Q92681 617 aa19.37■□□□□ 0.69
KCNQ1-202ENST00000335475 SLC41A3Q96GZ6 507 aa19.37■□□□□ 0.69
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF350Q9GZX5 532 aa19.37■□□□□ 0.69
KCNQ1-202ENST00000335475 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP19.37■□□□□ 0.69
KCNQ1-202ENST00000335475 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP19.37■□□□□ 0.69
KCNQ1-202ENST00000335475 LYRM4Q9HD34 91 aa19.37■□□□□ 0.69
KCNQ1-202ENST00000335475 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP19.37■□□□□ 0.69
KCNQ1-202ENST00000335475 H0YGG7 62 aa19.36■□□□□ 0.69
KCNQ1-202ENST00000335475 GNSP15586 552 aa19.36■□□□□ 0.69
KCNQ1-202ENST00000335475 CPEP16870 476 aa19.36■□□□□ 0.69
KCNQ1-202ENST00000335475 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP19.36■□□□□ 0.69
KCNQ1-202ENST00000335475 AKT2P31751 481 aa19.36■□□□□ 0.69
KCNQ1-202ENST00000335475 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP19.36■□□□□ 0.69
KCNQ1-202ENST00000335475 ID2Q02363 134 aa19.36■□□□□ 0.69
KCNQ1-202ENST00000335475 CD300CQ08708 224 aa19.36■□□□□ 0.69
KCNQ1-202ENST00000335475 RAB40BQ12829 278 aa19.36■□□□□ 0.69
KCNQ1-202ENST00000335475 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP19.36■□□□□ 0.69
KCNQ1-202ENST00000335475 RNF44Q7L0R7 432 aa19.36■□□□□ 0.69
KCNQ1-202ENST00000335475 SFTPA2Q8IWL1 248 aa19.36■□□□□ 0.69
KCNQ1-202ENST00000335475 TMEFF1Q8IYR6 380 aa19.36■□□□□ 0.69
KCNQ1-202ENST00000335475 RNFT2Q96EX2 444 aa19.36■□□□□ 0.69
KCNQ1-202ENST00000335475 SDF2Q99470 211 aa19.36■□□□□ 0.69
KCNQ1-202ENST00000335475 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP19.36■□□□□ 0.69
KCNQ1-202ENST00000335475 NUAK2Q9H093 628 aa19.36■□□□□ 0.69
KCNQ1-202ENST00000335475 IL21RQ9HBE5 538 aa19.36■□□□□ 0.69
KCNQ1-202ENST00000335475 SMURF1Q9HCE7 757 aa19.36■□□□□ 0.69
KCNQ1-202ENST00000335475 LRRC72A6NJI9 287 aa19.36■□□□□ 0.69
KCNQ1-202ENST00000335475 CTDSP2O14595 271 aa19.36■□□□□ 0.69
KCNQ1-202ENST00000335475 APOL3O95236 402 aa19.36■□□□□ 0.69
KCNQ1-202ENST00000335475 MED26O95402 600 aa19.36■□□□□ 0.69
KCNQ1-202ENST00000335475 GABRG2P18507 467 aa19.36■□□□□ 0.69
KCNQ1-202ENST00000335475 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP19.36■□□□□ 0.69
KCNQ1-202ENST00000335475 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP19.36■□□□□ 0.69
KCNQ1-202ENST00000335475 KLHL22Q53GT1 634 aa19.36■□□□□ 0.69
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF620Q6ZNG0 422 aa19.36■□□□□ 0.69
KCNQ1-202ENST00000335475 Q6ZSR6 202 aa19.36■□□□□ 0.69
KCNQ1-202ENST00000335475 TRIM48Q8IWZ4 208 aa19.36■□□□□ 0.69
KCNQ1-202ENST00000335475 ANKK1Q8NFD2 765 aa19.36■□□□□ 0.69
KCNQ1-202ENST00000335475 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP19.36■□□□□ 0.69
KCNQ1-202ENST00000335475 TMEM255BQ8WV15 326 aa19.36■□□□□ 0.69
KCNQ1-202ENST00000335475 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP19.36■□□□□ 0.69
KCNQ1-202ENST00000335475 IRAK4Q9NWZ3 460 aa19.36■□□□□ 0.69
KCNQ1-202ENST00000335475 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa19.36■□□□□ 0.69
KCNQ1-202ENST00000335475 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP19.36■□□□□ 0.69
KCNQ1-202ENST00000335475 TMEM129A0AVI4 362 aa19.35■□□□□ 0.69
KCNQ1-202ENST00000335475 THBS1P07996 1170 aa19.35■□□□□ 0.69
KCNQ1-202ENST00000335475 STAT5AP42229 794 aa19.35■□□□□ 0.69
KCNQ1-202ENST00000335475 GPR4P46093 362 aa19.35■□□□□ 0.69
KCNQ1-202ENST00000335475 DUSP8Q13202 625 aa19.35■□□□□ 0.69
KCNQ1-202ENST00000335475 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.2 ms