RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299259.10

COPS2-201, Transcript of COP9 signalosome subunit 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene COPS2, Length 2,036 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS2-201ENST00000299259 LOXL4Q96JB6 756 aa9.77□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 FNDC11Q9BVV2 318 aa9.77□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 SAP130Q9H0E3 1048 aa9.77□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa9.77□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 ZNF556Q9HAH1 456 aa9.77□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 RARRES3Q9UL19 164 aa9.77□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 ZNF232Q9UNY5 417 aa9.77□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 DTX4Q9Y2E6 619 aa9.77□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 CHST2Q9Y4C5 530 aa9.77□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa9.77□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa9.77□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa9.76□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 A0A1W2PRQ8 180 aa9.76□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 AGRPO00253 132 aa9.76□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 DYRK3O43781 588 aa9.76□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 BRINP1O60477 761 aa9.76□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 DBIP07108 87 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 ZNF883P0CG24 379 aa9.76□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 TNNI3P19429 210 aa9.76□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 CBLP22681 906 aa9.76□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 GRK6P43250 576 aa9.76□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 RHAGQ02094 409 aa9.76□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 RAPSNQ13702 412 aa9.76□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 DGCR6Q14129 220 aa9.76□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 DCST1Q5T197 706 aa9.76□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 C7orf57Q8NEG2 295 aa9.76□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 C16orf52Q8NHV5 167 aa9.76□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 NR4A3Q92570 626 aa9.76□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 PITX2Q99697 317 aa9.76□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 APOL4Q9BPW4 351 aa9.76□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa9.76□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 OR10A5Q9H207 317 aa9.76□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 Q9N2J8 555 aa9.76□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 ENOPH1Q9UHY7 261 aa9.76□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 GMPPBQ9Y5P6 360 aa9.76□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 WDFY4Q6ZS81 3184 aa9.75□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 FRS3O43559 492 aa9.75□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 SCRG1O75711 98 aa9.75□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 KCNK2O95069 426 aa9.75□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 ADAP00813 363 aa9.75□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 NID1P14543 1247 aa9.75□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 ELK4P28324 431 aa9.75□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 RFX3P48380 749 aa9.75□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 CLK3P49761 638 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 TAS2R41P59536 307 aa9.75□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 NPRL3Q12980 569 aa9.75□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 VWA2Q5GFL6 755 aa9.75□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 NPSR1Q6W5P4 371 aa9.75□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 SLITRK4Q8IW52 837 aa9.75□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 CLIP4Q8N3C7 705 aa9.75□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 OR7G1Q8NGA0 311 aa9.75□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 PMM1Q92871 262 aa9.75□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 ITPAQ9BY32 194 aa9.75□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 FBXO34Q9NWN3 711 aa9.75□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 CTSFQ9UBX1 484 aa9.75□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 PRODH2Q9UF12 536 aa9.75□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 FRYLO94915 3013 aa9.75□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa9.75□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa9.75□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 TRIM64A6NGJ6 449 aa9.75□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 TTC36A6NLP5 189 aa9.75□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 CLDN24A6NM45 220 aa9.75□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 NPIPA7E9PJI5 369 aa9.75□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 PEX12O00623 359 aa9.75□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 AP3D1O14617 1153 aa9.75□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 OR10H3O60404 316 aa9.75□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 TIAF1O95411 115 aa9.75□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 CLPSP04118 112 aa9.75□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 CCNYL3P0C7X3 344 aa9.75□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 NPIPA8P0DM63 369 aa9.75□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 EPHA2P29317 976 aa9.75□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 RYKP34925 604 aa9.75□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 UGT2B15P54855 530 aa9.75□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 IL5RAQ01344 420 aa9.75□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 CD47Q08722 323 aa9.75□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 SEC23BQ15437 767 aa9.75□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 NNATQ16517 81 aa9.75□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 MAPK14Q16539 360 aa9.75□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 FLYWCH1Q4VC44 716 aa9.75□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 RNF220Q5VTB9 566 aa9.75□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 COX15Q7KZN9 410 aa9.75□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 PRSS58Q8IYP2 241 aa9.75□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.8 ms