RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 POU4F1Q01851 419 aa7.03□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 BSPH1Q075Z2 132 aa7.03□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 PPP1R7Q15435 360 aa7.03□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 GUSBP1Q15486 140 aa7.03□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 PGGHGQ32M88 737 aa7.03□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 SFRP5Q5T4F7 317 aa7.03□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 OR5M10Q6IEU7 315 aa7.03□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 FIGNL1Q6PIW4 674 aa7.03□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 KLHL17Q6TDP4 642 aa7.03□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM108Q6UXF1 575 aa7.03□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 C22orf34Q6ZV56 151 aa7.03□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 P2RY8Q86VZ1 359 aa7.03□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 RNF214Q8ND24 703 aa7.03□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 KBTBD8Q8NFY9 601 aa7.03□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 KCTD4Q8WVF5 259 aa7.03□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 CDKL2Q92772 493 aa7.03□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 TMBIM1Q969X1 311 aa7.03□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 CFAP36Q96G28 342 aa7.03□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 CACNG6Q9BXT2 260 aa7.03□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 TRIM2Q9C040 744 aa7.03□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 DSN1Q9H410 356 aa7.03□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 PFDN4Q9NQP4 134 aa7.03□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 SMYD2Q9NRG4 433 aa7.03□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 GIMAP4Q9NUV9 329 aa7.03□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 FBXO34Q9NWN3 711 aa7.03□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 NMRK1Q9NWW6 199 aa7.03□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 NUDT4Q9NZJ9 180 aa7.03□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 SENP1Q9P0U3 644 aa7.03□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 ADAM29Q9UKF5 820 aa7.03□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 IKZF3Q9UKT9 509 aa7.03□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 ABCG2Q9UNQ0 655 aa7.03□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa7.03□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF337Q9Y3M9 751 aa7.03□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 ROS1P08922 2347 aa7.02□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP7.02□□□□□ -1.28
PGGT1B-201ENST00000296642 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 OR2M5A3KFT3 312 aa7.02□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 SYCE1LA8MT33 242 aa7.02□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 H0YIV9 168 aa7.02□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 TMPRSS11DO60235 418 aa7.02□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 NDUFS7O75251 213 aa7.02□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 AQP8O94778 261 aa7.02□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC166P0CW27 439 aa7.02□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 STMN1P16949 149 aa7.02□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 TTKP33981 857 aa7.02□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 EVI2BP34910 448 aa7.02□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 BSGP35613 385 aa7.02□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 PDLIM4P50479 330 aa7.02□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 EFNA4P52798 201 aa7.02□□□□□ -1.29
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PGGT1B-201ENST00000296642 MAPK12P53778 367 aa7.02□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 B3GALT5-AS1P59052 145 aa7.02□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 TAS2R39P59534 338 aa7.02□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 MGAT5Q09328 741 aa7.02□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 ITGADQ13349 1161 aa7.02□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 TAB1Q15750 504 aa7.02□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa7.02□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa7.02□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa7.02□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa7.02□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 MUC15Q8N387 334 aa7.02□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 FADS6Q8N9I5 356 aa7.02□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 BANPQ8N9N5 519 aa7.02□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 OR2M3Q8NG83 312 aa7.02□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 OR52R1Q8NGF1 315 aa7.02□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 TRPC4APQ8TEL6 797 aa7.02□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 EXT2Q93063 718 aa7.02□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 ESAMQ96AP7 390 aa7.02□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 DHRS9Q9BPW9 319 aa7.02□□□□□ -1.29
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PGGT1B-201ENST00000296642 C12orf49Q9H741 205 aa7.02□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 MANSC1Q9H8J5 431 aa7.02□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 FOLH1BQ9HBA9 442 aa7.02□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 C3orf14Q9HBI5 128 aa7.02□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 GP6Q9HCN6 339 aa7.02□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 TAS2R9Q9NYW1 312 aa7.02□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 MAT2BQ9NZL9 334 aa7.02□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 ASIC3Q9UHC3 531 aa7.02□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 PLLPQ9Y342 182 aa7.02□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 EXPH5Q8NEV8 1989 aa7.02□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A087WZY1 265 aa7.01□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 ESYT3A0FGR9 886 aa7.01□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 GJE1A6NN92 205 aa7.01□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 SUPT3HB4E1H0 165 aa7.01□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 H7C417 338 aa7.01□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 PGRMC2O15173 223 aa7.01□□□□□ -1.29
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