RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296098.4

TRIM54-201, Transcript of tripartite motif containing 54, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIM54, Length 2,027 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54-201ENST00000296098 MROQ9BYG7 248 aa22.38■■□□□ 1.17
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TRIM54-201ENST00000296098 NTNG1Q9Y2I2 539 aa22.38■■□□□ 1.17
TRIM54-201ENST00000296098 FGF17O60258 216 aa22.37■■□□□ 1.17
TRIM54-201ENST00000296098 LDB3O75112 727 aa22.37■■□□□ 1.17
TRIM54-201ENST00000296098 OR5F1O95221 314 aa22.37■■□□□ 1.17
TRIM54-201ENST00000296098 IGLV3-19P01714 112 aa22.37■■□□□ 1.17
TRIM54-201ENST00000296098 ATP1B1P05026 303 aa22.37■■□□□ 1.17
TRIM54-201ENST00000296098 OMPP47874 163 aa22.37■■□□□ 1.17
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TRIM54-201ENST00000296098 EFNB1P98172 346 aa22.37■■□□□ 1.17
TRIM54-201ENST00000296098 DECR1Q16698 335 aa22.37■■□□□ 1.17
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TRIM54-201ENST00000296098 MANEAQ5SRI9 462 aa22.37■■□□□ 1.17
TRIM54-201ENST00000296098 OR8D4Q8NGM9 314 aa22.37■■□□□ 1.17
TRIM54-201ENST00000296098 TMEM163Q8TC26 289 aa22.37■■□□□ 1.17
TRIM54-201ENST00000296098 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
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TRIM54-201ENST00000296098 PIGUQ9H490 435 aa22.37■■□□□ 1.17
TRIM54-201ENST00000296098 HHATLQ9HCP6 504 aa22.37■■□□□ 1.17
TRIM54-201ENST00000296098 ADAP2Q9NPF8 381 aa22.37■■□□□ 1.17
TRIM54-201ENST00000296098 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
TRIM54-201ENST00000296098 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa22.36■■□□□ 1.17
TRIM54-201ENST00000296098 MYL12BO14950 172 aa22.36■■□□□ 1.17
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TRIM54-201ENST00000296098 NTN1O95631 604 aa22.36■■□□□ 1.17
TRIM54-201ENST00000296098 RAB36O95755 333 aa22.36■■□□□ 1.17
TRIM54-201ENST00000296098 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
TRIM54-201ENST00000296098 NIPAL1Q6NVV3 410 aa22.36■■□□□ 1.17
TRIM54-201ENST00000296098 MRGPREQ86SM8 312 aa22.36■■□□□ 1.17
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TRIM54-201ENST00000296098 TMEM52Q8NDY8 209 aa22.36■■□□□ 1.17
TRIM54-201ENST00000296098 PROKR2Q8NFJ6 384 aa22.36■■□□□ 1.17
TRIM54-201ENST00000296098 OR5T3Q8NGG3 340 aa22.36■■□□□ 1.17
TRIM54-201ENST00000296098 SLC41A3Q96GZ6 507 aa22.36■■□□□ 1.17
TRIM54-201ENST00000296098 SDF2Q99470 211 aa22.36■■□□□ 1.17
TRIM54-201ENST00000296098 CDADC1Q9BWV3 514 aa22.36■■□□□ 1.17
TRIM54-201ENST00000296098 PRRG3Q9BZD7 231 aa22.36■■□□□ 1.17
TRIM54-201ENST00000296098 SAP130Q9H0E3 1048 aa22.36■■□□□ 1.17
TRIM54-201ENST00000296098 A0A087WV62 115 aa22.36■■□□□ 1.17
TRIM54-201ENST00000296098 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
TRIM54-201ENST00000296098 THEGLP0DJG4 465 aa22.36■■□□□ 1.17
TRIM54-201ENST00000296098 GLULP15104 373 aa22.36■■□□□ 1.17
TRIM54-201ENST00000296098 SOX3P41225 446 aa22.36■■□□□ 1.17
TRIM54-201ENST00000296098 IFITM3Q01628 133 aa22.36■■□□□ 1.17
TRIM54-201ENST00000296098 DUSP8Q13202 625 aa22.36■■□□□ 1.17
TRIM54-201ENST00000296098 C1DQ13901 141 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
TRIM54-201ENST00000296098 FZD2Q14332 565 aa22.36■■□□□ 1.17
TRIM54-201ENST00000296098 OXA1LQ15070 435 aa22.36■■□□□ 1.17
TRIM54-201ENST00000296098 SLC36A4Q6YBV0 504 aa22.36■■□□□ 1.17
TRIM54-201ENST00000296098 GDF7Q7Z4P5 450 aa22.36■■□□□ 1.17
TRIM54-201ENST00000296098 OOSP2Q86WS3 158 aa22.36■■□□□ 1.17
TRIM54-201ENST00000296098 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
TRIM54-201ENST00000296098 SNX29P2Q8IUI4 249 aa22.36■■□□□ 1.17
TRIM54-201ENST00000296098 NKAIN4Q8IVV8 208 aa22.36■■□□□ 1.17
TRIM54-201ENST00000296098 OR52I1Q8NGK6 324 aa22.36■■□□□ 1.17
TRIM54-201ENST00000296098 SLC38A2Q96QD8 506 aa22.36■■□□□ 1.17
TRIM54-201ENST00000296098 CCDC3Q9BQI4 270 aa22.36■■□□□ 1.17
TRIM54-201ENST00000296098 ZNF350Q9GZX5 532 aa22.36■■□□□ 1.17
TRIM54-201ENST00000296098 IL21RQ9HBE5 538 aa22.36■■□□□ 1.17
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TRIM54-201ENST00000296098 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP22.35■■□□□ 1.17
TRIM54-201ENST00000296098 THBS1P07996 1170 aa22.35■■□□□ 1.17
TRIM54-201ENST00000296098 ALOX5P09917 674 aa22.35■■□□□ 1.17
TRIM54-201ENST00000296098 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
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TRIM54-201ENST00000296098 FPR3P25089 353 aa22.35■■□□□ 1.17
TRIM54-201ENST00000296098 CD40LGP29965 261 aa22.35■■□□□ 1.17
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TRIM54-201ENST00000296098 PPP1CAP62136 330 aa22.35■■□□□ 1.17
TRIM54-201ENST00000296098 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
TRIM54-201ENST00000296098 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
TRIM54-201ENST00000296098 CCNJQ5T5M9 372 aa22.35■■□□□ 1.17
TRIM54-201ENST00000296098 Q6ZS52 159 aa22.35■■□□□ 1.17
TRIM54-201ENST00000296098 CA13Q8N1Q1 262 aa22.35■■□□□ 1.17
TRIM54-201ENST00000296098 DOK4Q8TEW6 326 aa22.35■■□□□ 1.17
TRIM54-201ENST00000296098 CFL2Q9Y281 166 aa22.35■■□□□ 1.17
TRIM54-201ENST00000296098 OR5K3A6NET4 321 aa22.35■■□□□ 1.17
TRIM54-201ENST00000296098 AGAP5A6NIR3 686 aa22.35■■□□□ 1.17
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TRIM54-201ENST00000296098 DCST2Q5T1A1 773 aa22.35■■□□□ 1.17
TRIM54-201ENST00000296098 TUBA3EQ6PEY2 450 aa22.35■■□□□ 1.17
TRIM54-201ENST00000296098 ZNF619Q8N2I2 560 aa22.35■■□□□ 1.17
TRIM54-201ENST00000296098 MINDY2Q8NBR6 621 aa22.35■■□□□ 1.17
TRIM54-201ENST00000296098 GPR27Q9NS67 375 aa22.35■■□□□ 1.17
TRIM54-201ENST00000296098 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
TRIM54-201ENST00000296098 SATB2Q9UPW6 733 aa22.35■■□□□ 1.17
TRIM54-201ENST00000296098 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa22.34■■□□□ 1.17
TRIM54-201ENST00000296098 FUOMA2VDF0 154 aa22.34■■□□□ 1.17
TRIM54-201ENST00000296098 SNTNA6NMZ2 147 aa22.34■■□□□ 1.17
TRIM54-201ENST00000296098 H3BQ06 376 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
TRIM54-201ENST00000296098 TAF4O00268 1085 aa22.34■■□□□ 1.17
TRIM54-201ENST00000296098 PRODHO43272 600 aa22.34■■□□□ 1.17
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