RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285199.11

USP43-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 43, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP43, Length 4,169 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43-201ENST00000285199 EVA1BQ9NVM1 165 aa14.83□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 RCE1Q9Y256 329 aa14.83□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 ETHE1O95571 254 aa14.83□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 PEX11BO96011 259 aa14.83□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 SERPINA3P01011 423 aa14.83□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 MPC1LP0DKB6 136 aa14.83□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 ACTR1BP42025 376 aa14.83□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 RPL34P49207 117 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 CLDN2P57739 230 aa14.83□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 ACTR1AP61163 376 aa14.83□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 IHHQ14623 411 aa14.83□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 INSL4Q14641 139 aa14.83□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 TEAD2Q15562 447 aa14.83□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 ARSKQ6UWY0 536 aa14.83□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 C16orf58Q96GQ5 468 aa14.83□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 DMRT3Q9NQL9 472 aa14.83□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 ARAP2Q8WZ64 1704 aa14.83□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 GLTPD2A6NH11 291 aa14.82□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 DSCR3O14972 297 aa14.82□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 CSF3P09919 207 aa14.82□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 UCHL1P09936 223 aa14.82□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 HSD3B2P26439 372 aa14.82□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 DDOSTP39656 456 aa14.82□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 MC3RP41968 323 aa14.82□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 GRK6P43250 576 aa14.82□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 ERVK-25P63136 954 aa14.82□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 GAS6Q14393 721 aa14.82□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 TMEM44Q2T9K0 475 aa14.82□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 ACSM3Q53FZ2 586 aa14.82□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 KLHL26Q53HC5 615 aa14.82□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 ACSM5Q6NUN0 579 aa14.82□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 DNAJC13O75165 2243 aa14.82□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 SOCS6O14544 535 aa14.82□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 HRO43593 1189 aa14.82□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 ITGA10O75578 1167 aa14.82□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 CTSEP14091 401 aa14.82□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 SOX18P35713 384 aa14.82□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 KIR2DL3P43628 341 aa14.82□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 RPS5P46782 204 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 DNASE1L1P49184 302 aa14.82□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa14.82□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 LYPD8Q6UX82 237 aa14.82□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 VITQ6UXI7 678 aa14.82□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa14.82□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 CD99L2Q8TCZ2 262 aa14.82□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 MICU1Q9BPX6 476 aa14.82□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 GSKIPQ9P0R6 139 aa14.82□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 URADA6NGE7 173 aa14.82□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 SQSTM1Q13501 440 aa14.82□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 ESCO2Q56NI9 601 aa14.82□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 C18orf63Q68DL7 685 aa14.82□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 UNC5DQ6UXZ4 953 aa14.82□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 LRRTM4Q86VH4 590 aa14.82□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 SPAG16Q8N0X2 631 aa14.82□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 OR8J2Q8NGG1 315 aa14.82□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 OR6T1Q8NGN1 323 aa14.82□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 S100A13Q99584 98 aa14.82□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 BCL2L14Q9BZR8 327 aa14.82□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 SRMSQ9H3Y6 488 aa14.82□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 CKLFQ9UBR5 152 aa14.82□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 SH2B3Q9UQQ2 575 aa14.82□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 RBBP9O75884 186 aa14.81□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 ZNF30P17039 623 aa14.81□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 SWI5Q1ZZU3 235 aa14.81□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 ZNF385BQ569K4 471 aa14.81□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa14.81□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 CPA6Q8N4T0 437 aa14.81□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 OR52I1Q8NGK6 324 aa14.81□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa14.81□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 GIMAP1Q8WWP7 306 aa14.81□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 LMF1Q96S06 567 aa14.81□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 LGR4Q9BXB1 951 aa14.81□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 TDP1Q9NUW8 608 aa14.81□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 CLEC4EQ9ULY5 219 aa14.81□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 SLC7A7Q9UM01 511 aa14.81□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 OR1A2Q9Y585 309 aa14.81□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 TPRP12270 2363 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 MAST2Q6P0Q8 1798 aa14.81□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 GLI3P10071 1580 aa14.81□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 A0A1B0GV50 99 aa14.81□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa14.81□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 SIX6O95475 246 aa14.81□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 MAP3K8P41279 467 aa14.81□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 ARFIP1P53367 373 aa14.81□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 FAM27D1Q5T7N8 215 aa14.81□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 BTN2A1Q7KYR7 527 aa14.81□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 OR5W2Q8NH69 310 aa14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms