RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249499.7

HOXD9-201, Transcript of homeobox D9, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD9, Length 1,870 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD9-201ENST00000249499 TMEM131Q92545 1883 aa21.33■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 KIAA0513O60268 411 aa21.32■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 CLPXO76031 633 aa21.32■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 SOX14O95416 240 aa21.32■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 NSA2O95478 260 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 STSP08842 583 aa21.32■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 TGFBR2P37173 567 aa21.32■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 TSPAN31Q12999 210 aa21.32■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 DEFB110Q30KQ9 67 aa21.32■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 ZNF836Q6ZNA1 936 aa21.32■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 ZNF595Q8IYB9 648 aa21.32■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 CLIP4Q8N3C7 705 aa21.32■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 OR6C4Q8NGE1 309 aa21.32■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 CD180Q99467 661 aa21.32■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 MAP3K3Q99759 626 aa21.32■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 TLCD2A6NGC4 264 aa21.32■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 MAN1A2O60476 641 aa21.32■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 STT3AP46977 705 aa21.32■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 AVPR1BP47901 424 aa21.32■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 CDK5Q00535 292 aa21.32■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 BNIP3Q12983 259 aa21.32■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 TCTE1Q5JU00 501 aa21.32■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa21.32■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 ZNF367Q7RTV3 350 aa21.32■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 VWA5B2Q8N398 1253 aa21.32■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 FAM26EQ8N5C1 309 aa21.32■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 DEFB119Q8N690 84 aa21.32■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 SIMC1Q8NDZ2 872 aa21.32■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 C1orf216Q8TAB5 229 aa21.32■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 MCHR1Q99705 422 aa21.32■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 ARMC7Q9H6L4 198 aa21.32■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 SEMA4GQ9NTN9 838 aa21.32■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 SLC6A14Q9UN76 642 aa21.32■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 NKX2-2O95096 273 aa21.31■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 CD36P16671 472 aa21.31■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 GABRA4P48169 554 aa21.31■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 GIPRP48546 466 aa21.31■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 SMSP52788 366 aa21.31■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 EMP3P54852 163 aa21.31■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 TIGD6Q17RP2 521 aa21.31■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 PLAG1Q6DJT9 500 aa21.31■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 ZNF730Q6ZMV8 503 aa21.31■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa21.31■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 RRM2BQ7LG56 351 aa21.31■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 MRGPREQ86SM8 312 aa21.31■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 PIGXQ8TBF5 258 aa21.31■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 M0R129 80 aa21.3■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 OR10H2O60403 315 aa21.3■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 FMO6PO60774 539 aa21.3■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 CTNSO60931 367 aa21.3■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 INHBBP09529 407 aa21.3■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 ADORA3P0DMS8 318 aa21.3■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 NID1P14543 1247 aa21.3■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 TNNI3P19429 210 aa21.3■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 C14orf28Q4W4Y0 310 aa21.3■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 MFSD4BQ5TF39 518 aa21.3■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 RNLSQ5VYX0 342 aa21.3■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 CARFQ8N187 725 aa21.3■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 CLDN23Q96B33 292 aa21.3■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 PRRG3Q9BZD7 231 aa21.3■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 RACGAP1Q9H0H5 632 aa21.3■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 SELENONQ9NZV5 590 aa21.3■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 FOXS1O43638 330 aa21.3■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 CBX7O95931 251 aa21.3■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 CT62P0C5K7 136 aa21.3■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 MAOBP27338 520 aa21.3■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 PCYT1AP49585 367 aa21.3■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 SLC41A3Q96GZ6 507 aa21.3■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 HSPA12BQ96MM6 686 aa21.3■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 ENAMQ9NRM1 1142 aa21.3■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 M0R082 166 aa21.29■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 FRS3O43559 492 aa21.29■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 BRINP1O60477 761 aa21.29■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 ENTPD6O75354 484 aa21.29■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 FPR3P25089 353 aa21.29■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 STAT5AP42229 794 aa21.29■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 OMPP47874 163 aa21.29■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 ENTPD1P49961 510 aa21.29■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 EFNB1P98172 346 aa21.29■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 ZP2Q05996 745 aa21.29■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 BIKQ13323 160 aa21.29■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 GINS1Q14691 196 aa21.29■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 NCF4Q15080 339 aa21.29■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 GALNT12Q8IXK2 581 aa21.29■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 TEX47Q8TBZ9 253 aa21.29■■□□□ 1
HOXD9-201ENST00000249499 GPR151Q8TDV0 419 aa21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms