RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 SAP130Q9H0E3 1048 aa23.11■■□□□ 1.29
CAPNS1-215ENST00000628018 ABCG2Q9UNQ0 655 aa23.11■■□□□ 1.29
CAPNS1-215ENST00000628018 WDR45Q9Y484 360 aa23.11■■□□□ 1.29
CAPNS1-215ENST00000628018 PRAMEF25A6NGN4 478 aa23.1■■□□□ 1.29
CAPNS1-215ENST00000628018 hCG_2039718K7EN88 272 aa23.1■■□□□ 1.29
CAPNS1-215ENST00000628018 FESP07332 822 aa23.1■■□□□ 1.29
CAPNS1-215ENST00000628018 CT45A8P0DMV1 189 aa23.1■■□□□ 1.29
CAPNS1-215ENST00000628018 CT45A9P0DMV2 189 aa23.1■■□□□ 1.29
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CAPNS1-215ENST00000628018 CYP27C1Q4G0S4 372 aa23.1■■□□□ 1.29
CAPNS1-215ENST00000628018 CT45A2Q5DJT8 189 aa23.1■■□□□ 1.29
CAPNS1-215ENST00000628018 CCNJQ5T5M9 372 aa23.1■■□□□ 1.29
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CAPNS1-215ENST00000628018 ZG16BQ96DA0 208 aa23.1■■□□□ 1.29
CAPNS1-215ENST00000628018 CRB3Q9BUF7 120 aa23.1■■□□□ 1.29
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CAPNS1-215ENST00000628018 CCDC88CQ9P219 2028 aa23.1■■□□□ 1.29
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CAPNS1-215ENST00000628018 NUDT9Q9BW91 350 aa23.09■■□□□ 1.29
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CAPNS1-215ENST00000628018 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
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CAPNS1-215ENST00000628018 KCNK2O95069 426 aa23.08■■□□□ 1.29
CAPNS1-215ENST00000628018 ALPPP05187 535 aa23.08■■□□□ 1.29
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CAPNS1-215ENST00000628018 GPR143P51810 404 aa23.08■■□□□ 1.29
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CAPNS1-215ENST00000628018 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa23.08■■□□□ 1.29
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CAPNS1-215ENST00000628018 POLE3Q9NRF9 147 aa23.08■■□□□ 1.29
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CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.28
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CAPNS1-215ENST00000628018 IZUMO2Q6UXV1 221 aa23.08■■□□□ 1.28
CAPNS1-215ENST00000628018 HMGN2P46Q86SG4 172 aa23.08■■□□□ 1.28
CAPNS1-215ENST00000628018 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa23.08■■□□□ 1.28
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF619Q8N2I2 560 aa23.08■■□□□ 1.28
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CAPNS1-215ENST00000628018 OR2T29Q8NH02 315 aa23.08■■□□□ 1.28
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CAPNS1-215ENST00000628018 TMBIM1Q969X1 311 aa23.08■■□□□ 1.28
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CAPNS1-215ENST00000628018 Q9N2J8 555 aa23.08■■□□□ 1.28
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CAPNS1-215ENST00000628018 PPICP45877 212 aa23.07■■□□□ 1.28
CAPNS1-215ENST00000628018 KCNC4Q03721 635 aa23.07■■□□□ 1.28
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF311Q5JNZ3 666 aa23.07■■□□□ 1.28
CAPNS1-215ENST00000628018 C3orf38Q5JPI3 329 aa23.07■■□□□ 1.28
CAPNS1-215ENST00000628018 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
CAPNS1-215ENST00000628018 OR52P1PQ8NH57 321 aa23.07■■□□□ 1.28
CAPNS1-215ENST00000628018 MESP1Q9BRJ9 268 aa23.07■■□□□ 1.28
CAPNS1-215ENST00000628018 C9orf16Q9BUW7 83 aa23.07■■□□□ 1.28
CAPNS1-215ENST00000628018 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa23.07■■□□□ 1.28
CAPNS1-215ENST00000628018 COPS7AQ9UBW8 275 aa23.07■■□□□ 1.28
CAPNS1-215ENST00000628018 PADI1Q9ULC6 663 aa23.07■■□□□ 1.28
CAPNS1-215ENST00000628018 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF292O60281 2723 aa23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-215ENST00000628018 SAGE2PA6NJ88 616 aa23.06■■□□□ 1.28
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