RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622020.4

NPHP4-211, Transcript of nephrocystin 4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NPHP4, Length 3,004 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP4-211ENST00000622020 TMEM43Q9BTV4 400 aa14.81□□□□□ -0.04
NPHP4-211ENST00000622020 RNF32Q9H0A6 362 aa14.81□□□□□ -0.04
NPHP4-211ENST00000622020 SLC13A4Q9UKG4 626 aa14.81□□□□□ -0.04
NPHP4-211ENST00000622020 PRELID1Q9Y255 219 aa14.81□□□□□ -0.04
NPHP4-211ENST00000622020 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa14.81□□□□□ -0.04
NPHP4-211ENST00000622020 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
NPHP4-211ENST00000622020 C6P13671 934 aa14.81□□□□□ -0.04
NPHP4-211ENST00000622020 SRP54P61011 504 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
NPHP4-211ENST00000622020 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
NPHP4-211ENST00000622020 FUT5Q11128 374 aa14.81□□□□□ -0.04
NPHP4-211ENST00000622020 TCEAL5Q5H9L2 206 aa14.81□□□□□ -0.04
NPHP4-211ENST00000622020 ZNF311Q5JNZ3 666 aa14.81□□□□□ -0.04
NPHP4-211ENST00000622020 OR6C4Q8NGE1 309 aa14.81□□□□□ -0.04
NPHP4-211ENST00000622020 OR4Q3Q8NH05 313 aa14.81□□□□□ -0.04
NPHP4-211ENST00000622020 BBS10Q8TAM1 723 aa14.81□□□□□ -0.04
NPHP4-211ENST00000622020 ZSWIM3Q96MP5 696 aa14.81□□□□□ -0.04
NPHP4-211ENST00000622020 SLC38A2Q96QD8 506 aa14.81□□□□□ -0.04
NPHP4-211ENST00000622020 AIF1LQ9BQI0 150 aa14.81□□□□□ -0.04
NPHP4-211ENST00000622020 KLHL1Q9NR64 748 aa14.81□□□□□ -0.04
NPHP4-211ENST00000622020 ACAD8Q9UKU7 415 aa14.81□□□□□ -0.04
NPHP4-211ENST00000622020 SCN2AQ99250 2005 aa14.81□□□□□ -0.04
NPHP4-211ENST00000622020 HLA-DMAP28067 261 aa14.8□□□□□ -0.04
NPHP4-211ENST00000622020 OR10A3P58181 314 aa14.8□□□□□ -0.04
NPHP4-211ENST00000622020 C9orf64Q5T6V5 341 aa14.8□□□□□ -0.04
NPHP4-211ENST00000622020 FCRLBQ6BAA4 426 aa14.8□□□□□ -0.04
NPHP4-211ENST00000622020 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa14.8□□□□□ -0.04
NPHP4-211ENST00000622020 NUDT13Q86X67 352 aa14.8□□□□□ -0.04
NPHP4-211ENST00000622020 BMPERQ8N8U9 685 aa14.8□□□□□ -0.04
NPHP4-211ENST00000622020 KREMEN2Q8NCW0 462 aa14.8□□□□□ -0.04
NPHP4-211ENST00000622020 BEST4Q8NFU0 473 aa14.8□□□□□ -0.04
NPHP4-211ENST00000622020 COL26A1Q96A83 441 aa14.8□□□□□ -0.04
NPHP4-211ENST00000622020 AMDHD1Q96NU7 426 aa14.8□□□□□ -0.04
NPHP4-211ENST00000622020 GON7Q9BXV9 100 aa14.8□□□□□ -0.04
NPHP4-211ENST00000622020 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
NPHP4-211ENST00000622020 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
NPHP4-211ENST00000622020 SPEGQ15772 3267 aa14.8□□□□□ -0.04
NPHP4-211ENST00000622020 KIAA1671Q9BY89 1806 aa14.8□□□□□ -0.04
NPHP4-211ENST00000622020 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa14.8□□□□□ -0.04
NPHP4-211ENST00000622020 NDUFS4O43181 175 aa14.8□□□□□ -0.04
NPHP4-211ENST00000622020 FCMRO60667 390 aa14.8□□□□□ -0.04
NPHP4-211ENST00000622020 UBXN7O94888 489 aa14.8□□□□□ -0.04
NPHP4-211ENST00000622020 ACADMP11310 421 aa14.8□□□□□ -0.04
NPHP4-211ENST00000622020 ACADLP28330 430 aa14.8□□□□□ -0.04
NPHP4-211ENST00000622020 COX10Q12887 443 aa14.8□□□□□ -0.04
NPHP4-211ENST00000622020 FCN2Q15485 313 aa14.8□□□□□ -0.04
NPHP4-211ENST00000622020 KLHL12Q53G59 568 aa14.8□□□□□ -0.04
NPHP4-211ENST00000622020 UBE3DQ7Z6J8 389 aa14.8□□□□□ -0.04
NPHP4-211ENST00000622020 CPOQ8IVL8 374 aa14.8□□□□□ -0.04
NPHP4-211ENST00000622020 NRMQ8IXM6 262 aa14.8□□□□□ -0.04
NPHP4-211ENST00000622020 MED30Q96HR3 178 aa14.8□□□□□ -0.04
NPHP4-211ENST00000622020 LGR4Q9BXB1 951 aa14.8□□□□□ -0.04
NPHP4-211ENST00000622020 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
NPHP4-211ENST00000622020 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
NPHP4-211ENST00000622020 ORC5O43913 435 aa14.79□□□□□ -0.04
NPHP4-211ENST00000622020 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
NPHP4-211ENST00000622020 TBXA2RP21731 343 aa14.79□□□□□ -0.04
NPHP4-211ENST00000622020 SHC1P29353 583 aa14.79□□□□□ -0.04
NPHP4-211ENST00000622020 ZNF793Q6ZN11 406 aa14.79□□□□□ -0.04
NPHP4-211ENST00000622020 SYT9Q86SS6 491 aa14.79□□□□□ -0.04
NPHP4-211ENST00000622020 TCTE3Q8IZS6 198 aa14.79□□□□□ -0.04
NPHP4-211ENST00000622020 SAMD12Q8N8I0 201 aa14.79□□□□□ -0.04
NPHP4-211ENST00000622020 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
NPHP4-211ENST00000622020 MAP6Q96JE9 813 aa14.79□□□□□ -0.04
NPHP4-211ENST00000622020 COQ7Q99807 217 aa14.79□□□□□ -0.04
NPHP4-211ENST00000622020 ABCG5Q9H222 651 aa14.79□□□□□ -0.04
NPHP4-211ENST00000622020 SLC28A3Q9HAS3 691 aa14.79□□□□□ -0.04
NPHP4-211ENST00000622020 SAGE1Q9NXZ1 904 aa14.79□□□□□ -0.04
NPHP4-211ENST00000622020 KNL1Q8NG31 2342 aa14.79□□□□□ -0.04
NPHP4-211ENST00000622020 TMEM129A0AVI4 362 aa14.79□□□□□ -0.04
NPHP4-211ENST00000622020 STK25O00506 426 aa14.79□□□□□ -0.04
NPHP4-211ENST00000622020 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
NPHP4-211ENST00000622020 REM1O75628 298 aa14.79□□□□□ -0.04
NPHP4-211ENST00000622020 TFPIP10646 304 aa14.79□□□□□ -0.04
NPHP4-211ENST00000622020 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
NPHP4-211ENST00000622020 C18orf63Q68DL7 685 aa14.79□□□□□ -0.04
NPHP4-211ENST00000622020 C12orf40Q86WS4 652 aa14.79□□□□□ -0.04
NPHP4-211ENST00000622020 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa14.79□□□□□ -0.04
NPHP4-211ENST00000622020 SIRT6Q8N6T7 355 aa14.79□□□□□ -0.04
NPHP4-211ENST00000622020 RASSF5Q8WWW0 418 aa14.79□□□□□ -0.04
NPHP4-211ENST00000622020 PRRC1Q96M27 445 aa14.79□□□□□ -0.04
NPHP4-211ENST00000622020 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
NPHP4-211ENST00000622020 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
NPHP4-211ENST00000622020 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa14.79□□□□□ -0.04
NPHP4-211ENST00000622020 A0A0A6YYJ9 748 aa14.79□□□□□ -0.04
NPHP4-211ENST00000622020 SPINT1O43278 529 aa14.79□□□□□ -0.04
NPHP4-211ENST00000622020 HCN1O60741 890 aa14.79□□□□□ -0.04
NPHP4-211ENST00000622020 CXCL14O95715 111 aa14.79□□□□□ -0.04
NPHP4-211ENST00000622020 FGBP02675 491 aa14.79□□□□□ -0.04
NPHP4-211ENST00000622020 C1QBP02746 253 aa14.79□□□□□ -0.04
NPHP4-211ENST00000622020 HLA-DPB1P04440 258 aa14.79□□□□□ -0.04
NPHP4-211ENST00000622020 TM4SF4P48230 202 aa14.79□□□□□ -0.04
NPHP4-211ENST00000622020 EFNB1P98172 346 aa14.79□□□□□ -0.04
NPHP4-211ENST00000622020 MAB21L1Q13394 359 aa14.79□□□□□ -0.04
NPHP4-211ENST00000622020 GPR176Q14439 515 aa14.79□□□□□ -0.04
NPHP4-211ENST00000622020 MINDY4Q4G0A6 757 aa14.79□□□□□ -0.04
NPHP4-211ENST00000622020 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
NPHP4-211ENST00000622020 PLBD1Q6P4A8 553 aa14.79□□□□□ -0.04
NPHP4-211ENST00000622020 TMEM91Q6ZNR0 172 aa14.79□□□□□ -0.04
NPHP4-211ENST00000622020 PRR23CQ6ZRP0 262 aa14.79□□□□□ -0.04
NPHP4-211ENST00000622020 OR4N4Q8N0Y3 316 aa14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms