RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612229.4

PTPRT-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 11,285 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-209ENST00000612229 C1orf123Q9NWV4 160 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 SAP18O00422 153 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 WNT10BO00744 389 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 TOXO94900 526 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 SPATA31D3P0C874 917 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 RFC2P35250 354 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 SLC17A1Q14916 467 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 OR5D14Q8NGL3 314 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 GTF2H4Q92759 462 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 SIX2Q9NPC8 291 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 ANKMY1Q9P2S6 941 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 GLUD1P00367 558 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 CELP19835 753 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 F2RL1P55085 397 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 FBXO48Q5FWF7 155 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 ZMAT1Q5H9K5 638 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 PAGE3Q5JUK9 113 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 TRNP1Q6NT89 227 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 STEAP2Q8NFT2 490 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 LILRB4Q8NHJ6 448 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 CACNG6Q9BXT2 260 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 ALKBH4Q9NXW9 302 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM233B4DJY2 109 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 E9PI62 339 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 LAG3P18627 525 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 SLC1A3P43003 542 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF678Q5SXM1 525 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 SSX9Q7RTT3 188 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 SERINC5Q86VE9 423 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 SIMC1Q8NDZ2 872 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 LPPQ93052 612 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 ARSGQ96EG1 525 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 PCED1BQ96HM7 432 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 PTCHD1Q96NR3 888 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 H3BMQ9 156 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 ARVCFO00192 962 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 NPBWR1P48145 328 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 PRKCZQ05513 592 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 ARHGAP1Q07960 439 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 LRRC32Q14392 662 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 DEFB115Q30KQ5 88 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 OR1S1Q8NH92 325 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 UFSP2Q9NUQ7 469 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 DMAC2Q9NW81 257 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 POU2F3Q9UKI9 436 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 ASB3Q9Y575 518 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 GOSR2O14653 212 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 GPR39O43194 453 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 SOX14O95416 240 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 HSD17B1P14061 328 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 LILRA4P59901 499 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 KBTBD6Q86V97 674 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 CPXM2Q8N436 756 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 OR6N1Q8NGY5 312 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 SLC2A13Q96QE2 648 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 LHPPQ9H008 270 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 GGT3PA6NGU5 568 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 DVL1O14640 695 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 ADAM12O43184 909 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 PNPP00491 289 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 H2BFMP0C1H6 154 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 IL3RAP26951 378 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 GGT2P36268 569 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 CAV2P51636 162 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 CTSL3PQ5NE16 218 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 OR4F3Q6IEY1 312 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 SULF2Q8IWU5 870 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 SYT14Q8NB59 555 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP6.65□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 BEX2Q9BXY8 128 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 BEX1Q9HBH7 125 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 NGBQ9NPG2 151 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 NWD2Q9ULI1 1742 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 SDC3O75056 442 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 NIPSNAP2O75323 286 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 ADH1BP00325 375 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 TNFP01375 233 aa6.65□□□□□ -1.34
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